More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2621 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2621  translation-associated GTPase  100 
 
 		 389 aa  798    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0297  translation-associated GTPase  62.98 
 
 		 389 aa  509  1e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1725  translation-associated GTPase  61.44 
 
 		 389 aa  496  1e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1577  translation-associated GTPase  61.18 
 
 		 389 aa  495  1e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0624  translation-associated GTPase  55.64 
 
 		 390 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1073  translation-associated GTPase  54.06 
 
 		 394 aa  429  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1959  translation-associated GTPase  53.55 
 
 		 395 aa  422  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0175  translation-associated GTPase  53.2 
 
 		 390 aa  413  1e-114  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.278003  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2275  translation-associated GTPase  51.39 
 
 		 393 aa  403  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0779  translation-associated GTPase  48.74 
 
 		 395 aa  389  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2814  translation-associated GTPase  47.58 
 
 		 392 aa  382  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0294234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1970  GTPase of unknown function domain protein  48.62 
 
 		 392 aa  370  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0374  translation-associated GTPase  47.86 
 
 		 392 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376171  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0462  translation-associated GTPase  48.87 
 
 		 392 aa  371  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1450  translation-associated GTPase  48.36 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00412196  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0647  GTPase of unknown function domain protein  47.37 
 
 		 392 aa  365  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.36601  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1545  translation-associated GTPase  47.86 
 
 		 392 aa  368  1e-100  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0445  translation-associated GTPase  47.1 
 
 		 392 aa  365  1e-100  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192639  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1800  GTPase of unknown function  47.75 
 
 		 401 aa  360  3e-98  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.016533  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0069  translation-associated GTPase  48.49 
 
 		 400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000183308  normal  0.0114224 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0538  GTPase of unknown function domain protein  46.48 
 
 		 400 aa  357  2.9999999999999997e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000115599  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1534  translation-associated GTPase  43.62 
 
 		 398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000432045 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0715  translation-associated GTPase  45 
 
 		 399 aa  316  4e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0065  translation-associated GTPase  43.22 
 
 		 419 aa  314  1.9999999999999998e-84  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1806  translation-associated GTPase  41.16 
 
 		 401 aa  288  1e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.732548 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0533  translation-associated GTPase  41.96 
 
 		 401 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.626339  normal  0.0197443 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1616  translation-associated GTPase  41.92 
 
 		 401 aa  280  4e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1662  translation-associated GTPase  42.46 
 
 		 401 aa  277  2e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0128  translation-associated GTPase  36.78 
 
 		 395 aa  262  6e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737053  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0853  GTPase of unknown function domain protein  35.09 
 
 		 399 aa  253  3e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2999  GTPase of unknown function domain protein  34.59 
 
 		 399 aa  252  8.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1465  translation-associated GTPase  35.84 
 
 		 400 aa  251  2e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0980  translation-associated GTPase  37.16 
 
 		 403 aa  249  6e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.287275 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1334  translation-associated GTPase  36.02 
 
 		 395 aa  248  2e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.570526  normal  0.888182 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35157  predicted protein  30.83 
 
 		 413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00692  GTP-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_1G13540)  29.78 
 
 		 412 aa  167  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3131  predicted protein  34.11 
 
 		 271 aa  118  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668518  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0109  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.47 
 
 		 365 aa  116  6e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000802684  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0349  GTPase, translation factor  28.99 
 
 		 366 aa  116  8.999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23370  GTP-binding protein YchF  28.71 
 
 		 364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000155952  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0748  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.41 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0530  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.49 
 
 		 363 aa  111  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2002  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.57 
 
 		 363 aa  110  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00393198  normal  0.0943361 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2707  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.28 
 
 		 363 aa  109  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2579  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.28 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2482  GTP-binding protein YchF  29.35 
 
 		 365 aa  109  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3096  GTP-binding protein YchF  29.87 
 
 		 367 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156001 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2000  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.35 
 
 		 364 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2193  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.62 
 
 		 369 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7891  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2931  GTP-binding protein YchF  29.97 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0027  GTP-binding protein YchF  26.05 
 
 		 366 aa  107  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0117  GTPase, translation factor  26.57 
 
 		 367 aa  106  6e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1796  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.5 
 
 		 363 aa  105  9e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0100064  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0416  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.04 
 
 		 363 aa  105  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.550609  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37067  predicted protein  26.49 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0395  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.12 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186596  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0554  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.268556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0347  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.03 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127573  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26380  GTP-binding protein YchF  27.43 
 
 		 361 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0845459 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1105  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.72 
 
 		 361 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.692178 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0450  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.49 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0274175  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3101  GTP-binding protein YchF  37.82 
 
 		 357 aa  104  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2845  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  38.22 
 
 		 364 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000149199  hitchhiker  0.000000000000211408 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1634  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.18 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0594912  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0206  GTP-binding protein YchF  27.55 
 
 		 357 aa  103  4e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0664  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  39.24 
 
 		 364 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151468  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0977  GTP-binding protein YchF  29 
 
 		 358 aa  103  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.245774  hitchhiker  0.00114943 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0648  GTP-binding protein YchF  26.92 
 
 		 362 aa  103  6e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.379901 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2219  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.58 
 
 		 365 aa  103  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1739  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  38.61 
 
 		 366 aa  103  7e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00258583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0348  GTP-binding protein YchF  28.88 
 
 		 364 aa  103  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.214484 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2121  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.87 
 
 		 365 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2592  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.47 
 
 		 364 aa  102  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000145967  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5862  GTP-binding protein YchF  28.33 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2765  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.01 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4365  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.51 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3748  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.2 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1835  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.87 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.259258  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1095  GTP-binding protein YchF  27.09 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0537245  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8269  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.36 
 
 		 357 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1475  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  38.22 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0116591 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0133  GTP-binding protein YchF  26.83 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20210  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.51 
 
 		 361 aa  100  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.640353  normal  0.191287 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3392  GTP-binding protein YchF  36.94 
 
 		 359 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0007  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.58 
 
 		 371 aa  100  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0312393  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1861  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.37 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.924801 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1389  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.46 
 
 		 366 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.159782 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3166  putative GTP-binding protein  29.35 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563466 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0572  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.5 
 
 		 363 aa  100  5e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3547  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.7 
 
 		 366 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31400  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  38.36 
 
 		 360 aa  100  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.292075 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1835  GTP-binding protein YchF  26.47 
 
 		 363 aa  100  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000078734  normal  0.600832 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4625  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.1 
 
 		 360 aa  100  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0445  GTP-binding protein YchF  39.38 
 
 		 373 aa  99.8  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0330999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1734  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.18 
 
 		 363 aa  99.8  7e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0584836  normal  0.0100242 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0656  GTP-binding protein YchF  36.88 
 
 		 370 aa  99.4  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1080  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.97 
 
 		 359 aa  99.4  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0946  GTP-binding protein YchF  27.7 
 
 		 361 aa  99.4  9e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0006  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.36 
 
 		 371 aa  99  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0271  GTP-binding protein YchF  27.93 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>