More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0175 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0175  translation-associated GTPase  100 
 
 		 390 aa  793    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.278003  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1073  translation-associated GTPase  63.71 
 
 		 394 aa  518  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1959  translation-associated GTPase  59.03 
 
 		 395 aa  484  1e-135  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1577  translation-associated GTPase  55.87 
 
 		 389 aa  436  1e-121  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0297  translation-associated GTPase  55.73 
 
 		 389 aa  436  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2275  translation-associated GTPase  51.41 
 
 		 393 aa  426  1e-118  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1725  translation-associated GTPase  54.36 
 
 		 389 aa  427  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0624  translation-associated GTPase  53.45 
 
 		 390 aa  420  1e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0779  translation-associated GTPase  52.04 
 
 		 395 aa  421  1e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2814  translation-associated GTPase  50.77 
 
 		 392 aa  419  1e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0294234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0538  GTPase of unknown function domain protein  52.75 
 
 		 400 aa  415  9.999999999999999e-116  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000115599  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2621  translation-associated GTPase  53.2 
 
 		 389 aa  413  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1800  GTPase of unknown function  51.52 
 
 		 401 aa  403  1e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.016533  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0647  GTPase of unknown function domain protein  49.74 
 
 		 392 aa  400  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.36601  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1450  translation-associated GTPase  49.75 
 
 		 393 aa  397  1e-109  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00412196  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1970  GTPase of unknown function domain protein  50 
 
 		 392 aa  397  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0069  translation-associated GTPase  51.01 
 
 		 400 aa  390  1e-107  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000183308  normal  0.0114224 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0445  translation-associated GTPase  50.38 
 
 		 392 aa  386  1e-106  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192639  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0462  translation-associated GTPase  49.62 
 
 		 392 aa  384  1e-105  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1545  translation-associated GTPase  49.62 
 
 		 392 aa  379  1e-104  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0374  translation-associated GTPase  49.62 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376171  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0715  translation-associated GTPase  52.02 
 
 		 399 aa  380  1e-104  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1616  translation-associated GTPase  52.28 
 
 		 401 aa  375  1e-103  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1534  translation-associated GTPase  48.09 
 
 		 398 aa  377  1e-103  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000432045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1806  translation-associated GTPase  49.24 
 
 		 401 aa  374  1e-102  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.732548 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0533  translation-associated GTPase  50.51 
 
 		 401 aa  367  1e-100  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.626339  normal  0.0197443 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0065  translation-associated GTPase  46.12 
 
 		 419 aa  364  1e-99  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1662  translation-associated GTPase  50.25 
 
 		 401 aa  360  3e-98  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2999  GTPase of unknown function domain protein  43.43 
 
 		 399 aa  325  6e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0853  GTPase of unknown function domain protein  43.18 
 
 		 399 aa  317  3e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0128  translation-associated GTPase  42.68 
 
 		 395 aa  311  1e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737053  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1465  translation-associated GTPase  42.68 
 
 		 400 aa  305  7e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1334  translation-associated GTPase  41.46 
 
 		 395 aa  305  8.000000000000001e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.570526  normal  0.888182 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0980  translation-associated GTPase  39.2 
 
 		 403 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.287275 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00692  GTP-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_1G13540)  34.36 
 
 		 412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35157  predicted protein  34.01 
 
 		 413 aa  205  1e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3131  predicted protein  36.12 
 
 		 271 aa  133  6e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668518  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2193  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.12 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7891  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2592  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.15 
 
 		 364 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000145967  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0349  GTPase, translation factor  27.93 
 
 		 366 aa  103  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0877  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.89 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00007173  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2482  GTP-binding protein YchF  26.59 
 
 		 365 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23370  GTP-binding protein YchF  30.35 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000155952  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2121  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.87 
 
 		 365 aa  99.4  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1835  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.87 
 
 		 365 aa  99.4  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.259258  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0395  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.57 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186596  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1124  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.59 
 
 		 361 aa  99  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.356013 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0675  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.22 
 
 		 361 aa  98.6  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.762559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26380  GTP-binding protein YchF  28.19 
 
 		 361 aa  98.6  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0845459 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3794  GTP-binding protein YchF  32.44 
 
 		 363 aa  97.8  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0664  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.95 
 
 		 364 aa  97.1  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151468  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4625  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.44 
 
 		 363 aa  97.1  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0369347 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2845  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.7 
 
 		 364 aa  97.1  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000149199  hitchhiker  0.000000000000211408 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0530  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.6 
 
 		 363 aa  97.1  5e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0656  GTP-binding protein YchF  39.29 
 
 		 370 aa  95.9  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3037  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.2 
 
 		 387 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0027  GTP-binding protein YchF  28.4 
 
 		 366 aa  95.5  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5862  GTP-binding protein YchF  27.74 
 
 		 359 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0823  GTP-binding protein YchF  26.41 
 
 		 369 aa  94.7  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2022  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.11 
 
 		 363 aa  94.4  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1634  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.08 
 
 		 362 aa  94  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0594912  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1259  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.44 
 
 		 363 aa  93.6  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.471371  normal  0.0100148 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3679  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.05 
 
 		 364 aa  93.6  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0104752  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3733  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.58 
 
 		 363 aa  93.6  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.316822 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37067  predicted protein  28.29 
 
 		 363 aa  93.2  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004209  GTP-binding and nucleic acid-binding protein YchF  26.78 
 
 		 363 aa  93.2  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000209033  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1095  GTP-binding protein YchF  27.29 
 
 		 363 aa  93.2  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0537245  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1861  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.06 
 
 		 373 aa  93.2  8e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.924801 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf169  putative GTPase translation factor  26.75 
 
 		 367 aa  92.8  9e-18  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.716411  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0977  GTP-binding protein YchF  31.1 
 
 		 358 aa  92  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.245774  hitchhiker  0.00114943 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0133  GTP-binding protein YchF  27.45 
 
 		 361 aa  92.8  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01244  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.3 
 
 		 363 aa  92.8  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1835  GTP-binding protein YchF  30.97 
 
 		 363 aa  92  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000078734  normal  0.600832 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0231  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.56 
 
 		 363 aa  92.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.375519 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0109  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.8 
 
 		 365 aa  92.4  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000802684  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1204  GTP-binding protein YchF  38.32 
 
 		 372 aa  92  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.590839  normal  0.981589 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2931  GTP-binding protein YchF  30.8 
 
 		 366 aa  91.7  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1122  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.36 
 
 		 366 aa  91.7  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167047  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3418  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.8 
 
 		 366 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000016062  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3507  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.49 
 
 		 364 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125034  normal  0.0137315 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0748  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.8 
 
 		 369 aa  91.7  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0442  GTP-binding protein YchF  32.59 
 
 		 366 aa  91.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.637193  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2367  GTP-binding protein YchF  38.57 
 
 		 366 aa  92  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0048  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.46 
 
 		 367 aa  91.3  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3631  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.22 
 
 		 363 aa  91.3  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2219  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.84 
 
 		 365 aa  91.3  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0717  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.34 
 
 		 363 aa  90.9  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000164209  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0007  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.03 
 
 		 371 aa  91.3  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0312393  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3871  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.08 
 
 		 358 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.479028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1739  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.25 
 
 		 366 aa  90.9  4e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00258583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1280  GTP-binding protein YchF  27.47 
 
 		 367 aa  90.5  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0572  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.4 
 
 		 363 aa  90.1  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2000  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.07 
 
 		 364 aa  90.1  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0271  GTP-binding protein YchF  25.37 
 
 		 364 aa  90.1  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198016 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0041  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.83 
 
 		 365 aa  90.1  7e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1574  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.98 
 
 		 365 aa  89.7  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4937  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.58 
 
 		 366 aa  89.7  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000108566  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1234  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.97 
 
 		 363 aa  89.7  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.909233  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3096  GTP-binding protein YchF  27.88 
 
 		 367 aa  89.7  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156001 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1008  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.8 
 
 		 367 aa  89.4  9e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>