More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1073 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1073  translation-associated GTPase  100 
 
 		 394 aa  803    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1959  translation-associated GTPase  68.69 
 
 		 395 aa  584  1e-166  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0175  translation-associated GTPase  63.71 
 
 		 390 aa  518  1e-146  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.278003  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1577  translation-associated GTPase  57.25 
 
 		 389 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1725  translation-associated GTPase  56.71 
 
 		 389 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0297  translation-associated GTPase  55.98 
 
 		 389 aa  436  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2621  translation-associated GTPase  54.06 
 
 		 389 aa  429  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0624  translation-associated GTPase  53.3 
 
 		 390 aa  418  1e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0779  translation-associated GTPase  51.39 
 
 		 395 aa  419  1e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1450  translation-associated GTPase  52.53 
 
 		 393 aa  413  1e-114  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00412196  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0538  GTPase of unknown function domain protein  51.51 
 
 		 400 aa  412  1e-114  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000115599  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1970  GTPase of unknown function domain protein  51.53 
 
 		 392 aa  410  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0647  GTPase of unknown function domain protein  49.74 
 
 		 392 aa  410  1e-113  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.36601  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2814  translation-associated GTPase  49.23 
 
 		 392 aa  410  1e-113  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0294234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2275  translation-associated GTPase  48.98 
 
 		 393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1800  GTPase of unknown function  49.24 
 
 		 401 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.016533  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0445  translation-associated GTPase  52.64 
 
 		 392 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192639  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0374  translation-associated GTPase  50.63 
 
 		 392 aa  393  1e-108  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376171  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0462  translation-associated GTPase  50.63 
 
 		 392 aa  389  1e-107  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1545  translation-associated GTPase  50.38 
 
 		 392 aa  391  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0715  translation-associated GTPase  51.13 
 
 		 399 aa  383  1e-105  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0069  translation-associated GTPase  47.98 
 
 		 400 aa  374  1e-102  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000183308  normal  0.0114224 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1806  translation-associated GTPase  48.86 
 
 		 401 aa  374  1e-102  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.732548 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1616  translation-associated GTPase  51.65 
 
 		 401 aa  370  1e-101  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1534  translation-associated GTPase  46.95 
 
 		 398 aa  367  1e-100  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000432045 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0065  translation-associated GTPase  47.1 
 
 		 419 aa  362  5.0000000000000005e-99  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0533  translation-associated GTPase  49.12 
 
 		 401 aa  362  6e-99  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.626339  normal  0.0197443 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1662  translation-associated GTPase  48.35 
 
 		 401 aa  351  1e-95  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0853  GTPase of unknown function domain protein  40.75 
 
 		 399 aa  305  1.0000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2999  GTPase of unknown function domain protein  40.75 
 
 		 399 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0980  translation-associated GTPase  41.69 
 
 		 403 aa  301  2e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.287275 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1465  translation-associated GTPase  40.2 
 
 		 400 aa  300  4e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0128  translation-associated GTPase  41.9 
 
 		 395 aa  298  8e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737053  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1334  translation-associated GTPase  40.15 
 
 		 395 aa  293  4e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.570526  normal  0.888182 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00692  GTP-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_1G13540)  34.28 
 
 		 412 aa  195  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35157  predicted protein  33.75 
 
 		 413 aa  189  5e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3131  predicted protein  33.71 
 
 		 271 aa  134  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668518  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0349  GTPase, translation factor  27.45 
 
 		 366 aa  110  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0109  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  40.13 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000802684  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0416  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.83 
 
 		 363 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.550609  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0072  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.55 
 
 		 367 aa  104  3e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0572  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.91 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3733  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.77 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.316822 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2022  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.16 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2043  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.24 
 
 		 363 aa  103  5e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0347  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.1 
 
 		 363 aa  103  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127573  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf169  putative GTPase translation factor  28.23 
 
 		 367 aa  102  9e-21  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.716411  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2367  GTP-binding protein YchF  28.61 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2482  GTP-binding protein YchF  33.48 
 
 		 365 aa  100  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0007  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.72 
 
 		 371 aa  100  5e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0312393  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1615  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.47 
 
 		 370 aa  100  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2931  GTP-binding protein YchF  36.68 
 
 		 366 aa  99.8  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2845  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.62 
 
 		 364 aa  99.4  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000149199  hitchhiker  0.000000000000211408 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0117  GTPase, translation factor  40.13 
 
 		 367 aa  98.2  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3631  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.71 
 
 		 363 aa  97.8  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1739  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  42.25 
 
 		 366 aa  97.8  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00258583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0450  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.61 
 
 		 363 aa  97.4  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0274175  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3193  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.36 
 
 		 363 aa  97.4  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.36162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0736  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.68 
 
 		 359 aa  97.1  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.217905  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5862  GTP-binding protein YchF  30.07 
 
 		 359 aa  96.7  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1095  GTP-binding protein YchF  38.61 
 
 		 363 aa  96.7  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0537245  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3037  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.36 
 
 		 387 aa  96.3  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3392  GTP-binding protein YchF  38.29 
 
 		 359 aa  96.3  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1835  GTP-binding protein YchF  39.13 
 
 		 363 aa  96.3  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000078734  normal  0.600832 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0748  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.29 
 
 		 369 aa  96.3  9e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2708  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.57 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1634  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.46 
 
 		 362 aa  95.5  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0594912  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0530  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.11 
 
 		 363 aa  96.3  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0784  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.34 
 
 		 363 aa  95.5  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000100332  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2193  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.99 
 
 		 369 aa  95.9  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7891  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0664  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.33 
 
 		 364 aa  95.1  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151468  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0442  GTP-binding protein YchF  27.1 
 
 		 366 aa  95.1  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.637193  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3101  GTP-binding protein YchF  37.64 
 
 		 357 aa  95.5  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1796  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.88 
 
 		 363 aa  95.1  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0100064  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26380  GTP-binding protein YchF  31.37 
 
 		 361 aa  95.1  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0845459 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0877  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.04 
 
 		 364 aa  95.1  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00007173  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0675  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  38.75 
 
 		 361 aa  94.4  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.762559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3507  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.6 
 
 		 364 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125034  normal  0.0137315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4160  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  39.62 
 
 		 361 aa  94.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000134834 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2871  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.34 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0496  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.71 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004209  GTP-binding and nucleic acid-binding protein YchF  31.56 
 
 		 363 aa  94.4  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000209033  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0519  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.34 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3587  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.34 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0395  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.46 
 
 		 363 aa  94.4  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186596  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3569  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.34 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3596  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.34 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1923  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.34 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.264442  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2581  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.71 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0524  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.71 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0952  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.34 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0657  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.34 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4365  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.14 
 
 		 359 aa  93.6  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0390  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.14 
 
 		 363 aa  93.2  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.997224  normal  0.0213751 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2920  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.34 
 
 		 364 aa  93.6  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.657058  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20210  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.07 
 
 		 361 aa  93.2  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.640353  normal  0.191287 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2121  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  39.33 
 
 		 365 aa  93.2  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1835  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  39.33 
 
 		 365 aa  93.2  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.259258  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0887  GTP-binding protein YchF  31.69 
 
 		 364 aa  93.2  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0231852  normal  0.589868 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0677  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.16 
 
 		 366 aa  93.2  6e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>