More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0297 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0297  translation-associated GTPase  100 
 
 		 389 aa  800    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1725  translation-associated GTPase  64.01 
 
 		 389 aa  528  1e-149  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1577  translation-associated GTPase  63.5 
 
 		 389 aa  519  1e-146  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2621  translation-associated GTPase  62.98 
 
 		 389 aa  509  1e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0624  translation-associated GTPase  56.78 
 
 		 390 aa  451  1e-125  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1073  translation-associated GTPase  55.98 
 
 		 394 aa  436  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0175  translation-associated GTPase  55.73 
 
 		 390 aa  436  1e-121  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.278003  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1959  translation-associated GTPase  52.28 
 
 		 395 aa  409  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2275  translation-associated GTPase  48.51 
 
 		 393 aa  388  1e-107  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1800  GTPase of unknown function  49.88 
 
 		 401 aa  379  1e-104  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.016533  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0779  translation-associated GTPase  48.09 
 
 		 395 aa  370  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2814  translation-associated GTPase  46.45 
 
 		 392 aa  371  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0294234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0647  GTPase of unknown function domain protein  46.35 
 
 		 392 aa  364  1e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.36601  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1970  GTPase of unknown function domain protein  46.85 
 
 		 392 aa  355  8.999999999999999e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1545  translation-associated GTPase  47.61 
 
 		 392 aa  355  8.999999999999999e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0445  translation-associated GTPase  46.72 
 
 		 392 aa  351  1e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192639  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0374  translation-associated GTPase  47.36 
 
 		 392 aa  351  1e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376171  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0462  translation-associated GTPase  47.22 
 
 		 392 aa  348  7e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0069  translation-associated GTPase  47.86 
 
 		 400 aa  348  1e-94  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000183308  normal  0.0114224 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1450  translation-associated GTPase  46.35 
 
 		 393 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00412196  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1534  translation-associated GTPase  46.29 
 
 		 398 aa  343  2e-93  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000432045 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0538  GTPase of unknown function domain protein  44.2 
 
 		 400 aa  344  2e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000115599  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0715  translation-associated GTPase  46.06 
 
 		 399 aa  330  3e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0065  translation-associated GTPase  44.75 
 
 		 419 aa  323  3e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1806  translation-associated GTPase  41.67 
 
 		 401 aa  293  3e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.732548 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1616  translation-associated GTPase  43.94 
 
 		 401 aa  288  2e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0533  translation-associated GTPase  43.25 
 
 		 401 aa  286  4e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.626339  normal  0.0197443 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1662  translation-associated GTPase  42.61 
 
 		 401 aa  282  7.000000000000001e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2999  GTPase of unknown function domain protein  37.34 
 
 		 399 aa  268  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0853  GTPase of unknown function domain protein  37.88 
 
 		 399 aa  265  8.999999999999999e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1465  translation-associated GTPase  38.85 
 
 		 400 aa  264  2e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1334  translation-associated GTPase  39.04 
 
 		 395 aa  261  1e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.570526  normal  0.888182 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0128  translation-associated GTPase  39.1 
 
 		 395 aa  259  8e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737053  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0980  translation-associated GTPase  36.66 
 
 		 403 aa  251  1e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.287275 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00692  GTP-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_1G13540)  32.82 
 
 		 412 aa  176  5e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35157  predicted protein  31.37 
 
 		 413 aa  164  3e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3131  predicted protein  34.24 
 
 		 271 aa  126  8.000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668518  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3096  GTP-binding protein YchF  31.25 
 
 		 367 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156001 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2482  GTP-binding protein YchF  29.23 
 
 		 365 aa  107  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0349  GTPase, translation factor  34.89 
 
 		 366 aa  107  5e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0109  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.12 
 
 		 365 aa  106  6e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000802684  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2592  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.3 
 
 		 364 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000145967  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0117  GTPase, translation factor  34.75 
 
 		 367 aa  104  3e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8269  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.22 
 
 		 357 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1095  GTP-binding protein YchF  31.34 
 
 		 363 aa  103  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0537245  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0748  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.16 
 
 		 369 aa  103  6e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2765  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.06 
 
 		 364 aa  102  8e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1475  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.06 
 
 		 364 aa  102  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0116591 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0664  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.68 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151468  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2845  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.67 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000149199  hitchhiker  0.000000000000211408 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1105  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.85 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.692178 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37067  predicted protein  29.56 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2022  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.79 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3733  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.11 
 
 		 363 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.316822 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1739  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.44 
 
 		 366 aa  100  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00258583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1615  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.93 
 
 		 370 aa  99.8  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2708  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.33 
 
 		 364 aa  99.8  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0395  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.11 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186596  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1835  GTP-binding protein YchF  30 
 
 		 363 aa  99.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000078734  normal  0.600832 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0675  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.99 
 
 		 361 aa  99.4  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.762559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0700  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.93 
 
 		 368 aa  98.6  1e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0206  GTP-binding protein YchF  32.68 
 
 		 357 aa  99.4  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0007  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.49 
 
 		 371 aa  99.4  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0312393  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2193  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.23 
 
 		 369 aa  98.2  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7891  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2367  GTP-binding protein YchF  31.5 
 
 		 366 aa  97.8  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0005  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.76 
 
 		 371 aa  97.8  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4937  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.84 
 
 		 366 aa  97.4  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000108566  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1046  GTP-binding protein YchF  34.93 
 
 		 365 aa  97.1  5e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.929667  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1574  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.57 
 
 		 365 aa  97.1  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23370  GTP-binding protein YchF  30.35 
 
 		 364 aa  97.1  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000155952  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0006  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.05 
 
 		 371 aa  96.7  6e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0099  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.43 
 
 		 363 aa  96.7  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.76867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3679  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.41 
 
 		 364 aa  96.7  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0104752  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0823  GTP-binding protein YchF  27.52 
 
 		 369 aa  96.7  6e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1204  GTP-binding protein YchF  35.4 
 
 		 372 aa  96.3  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.590839  normal  0.981589 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2082  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.51 
 
 		 360 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330246  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0648  GTP-binding protein YchF  27.18 
 
 		 362 aa  95.9  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.379901 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2920  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.59 
 
 		 364 aa  95.9  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.657058  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2931  GTP-binding protein YchF  33.33 
 
 		 366 aa  95.5  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2707  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.76 
 
 		 363 aa  94.7  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2579  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.72 
 
 		 363 aa  94.7  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22930  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.61 
 
 		 361 aa  95.1  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3631  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.29 
 
 		 363 aa  95.1  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0347  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.96 
 
 		 363 aa  95.5  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127573  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0133  GTP-binding protein YchF  29.86 
 
 		 361 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0416  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.28 
 
 		 363 aa  95.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.550609  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0530  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.36 
 
 		 363 aa  95.5  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0348  GTP-binding protein YchF  30.27 
 
 		 364 aa  94.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.214484 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3587  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.43 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3569  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.43 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0450  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.4 
 
 		 363 aa  94  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0274175  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1861  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.29 
 
 		 373 aa  94  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.924801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0656  GTP-binding protein YchF  38.65 
 
 		 370 aa  94.4  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3596  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.43 
 
 		 364 aa  93.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0952  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.43 
 
 		 364 aa  93.6  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0519  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.43 
 
 		 364 aa  93.6  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0657  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.43 
 
 		 364 aa  93.6  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1923  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.43 
 
 		 364 aa  93.6  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.264442  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0473  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.54 
 
 		 364 aa  93.2  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1796  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.68 
 
 		 363 aa  93.2  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0100064  normal  0.0470054 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>