More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2999 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0853  GTPase of unknown function domain protein  92.73 
 
 		 399 aa  764    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2999  GTPase of unknown function domain protein  100 
 
 		 399 aa  817    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1465  translation-associated GTPase  69.95 
 
 		 400 aa  584  1e-166  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1334  translation-associated GTPase  70.71 
 
 		 395 aa  581  1.0000000000000001e-165  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.570526  normal  0.888182 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0128  translation-associated GTPase  67.42 
 
 		 395 aa  554  1e-156  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737053  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2275  translation-associated GTPase  45.06 
 
 		 393 aa  342  5e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0647  GTPase of unknown function domain protein  44.95 
 
 		 392 aa  341  2e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.36601  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2814  translation-associated GTPase  43.69 
 
 		 392 aa  334  2e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0294234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0779  translation-associated GTPase  43.83 
 
 		 395 aa  333  4e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0538  GTPase of unknown function domain protein  42.21 
 
 		 400 aa  328  1.0000000000000001e-88  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000115599  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0175  translation-associated GTPase  43.43 
 
 		 390 aa  325  6e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.278003  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1534  translation-associated GTPase  39.9 
 
 		 398 aa  324  2e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000432045 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1800  GTPase of unknown function  39.8 
 
 		 401 aa  319  3.9999999999999996e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.016533  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0065  translation-associated GTPase  40.4 
 
 		 419 aa  319  5e-86  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1970  GTPase of unknown function domain protein  43.43 
 
 		 392 aa  317  2e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1450  translation-associated GTPase  38.93 
 
 		 393 aa  317  3e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00412196  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0445  translation-associated GTPase  38.01 
 
 		 392 aa  310  2e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192639  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0069  translation-associated GTPase  40.55 
 
 		 400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000183308  normal  0.0114224 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0462  translation-associated GTPase  37.82 
 
 		 392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0374  translation-associated GTPase  37.5 
 
 		 392 aa  309  6.999999999999999e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376171  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1073  translation-associated GTPase  40.75 
 
 		 394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0715  translation-associated GTPase  40.4 
 
 		 399 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1545  translation-associated GTPase  36.99 
 
 		 392 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1959  translation-associated GTPase  38.4 
 
 		 395 aa  297  2e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1662  translation-associated GTPase  40.6 
 
 		 401 aa  293  3e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1806  translation-associated GTPase  38.75 
 
 		 401 aa  291  2e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.732548 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1616  translation-associated GTPase  40.05 
 
 		 401 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0533  translation-associated GTPase  39.05 
 
 		 401 aa  285  9e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.626339  normal  0.0197443 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1725  translation-associated GTPase  37.28 
 
 		 389 aa  273  4.0000000000000004e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0297  translation-associated GTPase  37.34 
 
 		 389 aa  268  1e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0624  translation-associated GTPase  38.35 
 
 		 390 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1577  translation-associated GTPase  36.18 
 
 		 389 aa  257  3e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2621  translation-associated GTPase  34.59 
 
 		 389 aa  252  9.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0980  translation-associated GTPase  33.42 
 
 		 403 aa  228  1e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.287275 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00692  GTP-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_1G13540)  35.55 
 
 		 412 aa  218  1e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35157  predicted protein  35.51 
 
 		 413 aa  213  2.9999999999999995e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3131  predicted protein  33.58 
 
 		 271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668518  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0517  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.67 
 
 		 362 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11960  GTP-binding protein YchF  29.37 
 
 		 354 aa  110  6e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.642415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0450  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.26 
 
 		 364 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21870  GTP-binding protein YchF  28.4 
 
 		 354 aa  109  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0475417 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1055  GTP-binding protein YchF  29.44 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0763151  hitchhiker  0.00159487 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0416  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  40.33 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.550609  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0986  GTP-binding protein YchF  29.58 
 
 		 363 aa  106  8e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2708  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.69 
 
 		 364 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3507  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.06 
 
 		 364 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125034  normal  0.0137315 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0347  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127573  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1634  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.1 
 
 		 362 aa  104  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0594912  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0530  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.63 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4263  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.53 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109438  normal  0.19312 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0466  GTP-binding protein YchF  27.12 
 
 		 364 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0515  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.42 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0231  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.27 
 
 		 363 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.375519 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0450  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.37 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0274175  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1579  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.49 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1390  GTP-binding protein YchF  26.17 
 
 		 367 aa  100  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00313988  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0746  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.32 
 
 		 363 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0887  GTP-binding protein YchF  28.27 
 
 		 364 aa  101  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0231852  normal  0.589868 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0453  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.33 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0338644 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0429  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.33 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2774  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.92 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.97205 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0572  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.6 
 
 		 363 aa  100  6e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15861  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.6 
 
 		 363 aa  99.8  7e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.100082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3140  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.92 
 
 		 364 aa  99.8  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.369877 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0496  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.3 
 
 		 364 aa  99.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2581  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.3 
 
 		 364 aa  99.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1259  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.99 
 
 		 363 aa  99.8  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.471371  normal  0.0100148 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0524  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.3 
 
 		 364 aa  99.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0519  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.99 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3611  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.96 
 
 		 364 aa  99.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0206  GTP-binding protein YchF  27.57 
 
 		 357 aa  99  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0657  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.99 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1923  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.99 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.264442  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1530  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.3 
 
 		 357 aa  99  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0952  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.99 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3596  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.99 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0048  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.33 
 
 		 367 aa  98.6  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2592  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.85 
 
 		 364 aa  98.2  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000145967  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3587  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.52 
 
 		 364 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1734  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.76 
 
 		 363 aa  98.6  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0584836  normal  0.0100242 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3569  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.52 
 
 		 364 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1861  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  40.37 
 
 		 373 aa  98.6  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.924801 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2845  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.63 
 
 		 364 aa  98.2  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000149199  hitchhiker  0.000000000000211408 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2871  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.91 
 
 		 364 aa  97.8  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2920  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.26 
 
 		 364 aa  97.1  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.657058  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04539  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.67 
 
 		 363 aa  97.4  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.910533  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3679  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.73 
 
 		 364 aa  97.4  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0104752  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0664  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.15 
 
 		 364 aa  97.1  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151468  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3618  GTP-binding protein YchF  28.5 
 
 		 364 aa  97.1  5e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2579  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.72 
 
 		 363 aa  97.1  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3392  GTP-binding protein YchF  36.67 
 
 		 359 aa  97.1  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4937  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.42 
 
 		 366 aa  97.1  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000108566  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0877  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.65 
 
 		 364 aa  97.1  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00007173  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2204  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.57 
 
 		 363 aa  97.1  5e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000173002  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2928  GTP-binding protein YchF  28.5 
 
 		 364 aa  97.1  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.79075  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2082  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.87 
 
 		 360 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330246  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2115  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.6 
 
 		 363 aa  97.1  6e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000126801  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2707  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.72 
 
 		 363 aa  97.1  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0729  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.14 
 
 		 363 aa  96.7  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195825 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4178  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.53 
 
 		 376 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40111  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>