More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_35157 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_35157  predicted protein  100 
 
 
413 aa  841    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00692  GTP-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_1G13540)  62.65 
 
 
412 aa  540  9.999999999999999e-153  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0445  translation-associated GTPase  35.68 
 
 
392 aa  243  7e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192639  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1450  translation-associated GTPase  34.45 
 
 
393 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00412196  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0462  translation-associated GTPase  34.91 
 
 
392 aa  232  9e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0065  translation-associated GTPase  35.71 
 
 
419 aa  226  8e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1545  translation-associated GTPase  34.58 
 
 
392 aa  225  9e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0374  translation-associated GTPase  34.58 
 
 
392 aa  225  1e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376171  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1465  translation-associated GTPase  35.66 
 
 
400 aa  224  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0853  GTPase of unknown function domain protein  35.81 
 
 
399 aa  216  5.9999999999999996e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2999  GTPase of unknown function domain protein  35.51 
 
 
399 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1334  translation-associated GTPase  35.07 
 
 
395 aa  211  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.570526  normal  0.888182 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1800  GTPase of unknown function  33.5 
 
 
401 aa  211  3e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.016533  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1806  translation-associated GTPase  34.66 
 
 
401 aa  208  1e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.732548 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0647  GTPase of unknown function domain protein  35.53 
 
 
392 aa  209  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.36601  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1970  GTPase of unknown function domain protein  34.93 
 
 
392 aa  205  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0175  translation-associated GTPase  34.01 
 
 
390 aa  205  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.278003  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0538  GTPase of unknown function domain protein  34.7 
 
 
400 aa  204  3e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000115599  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1662  translation-associated GTPase  34.71 
 
 
401 aa  200  5e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0128  translation-associated GTPase  35.08 
 
 
395 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737053  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0069  translation-associated GTPase  33.5 
 
 
400 aa  196  5.000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000183308  normal  0.0114224 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0779  translation-associated GTPase  32.48 
 
 
395 aa  196  7e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1959  translation-associated GTPase  31.83 
 
 
395 aa  195  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1616  translation-associated GTPase  34.83 
 
 
401 aa  195  1e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1577  translation-associated GTPase  33.09 
 
 
389 aa  193  6e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0533  translation-associated GTPase  34.25 
 
 
401 aa  192  7e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.626339  normal  0.0197443 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2814  translation-associated GTPase  33.24 
 
 
392 aa  190  4e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0294234  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1073  translation-associated GTPase  33.75 
 
 
394 aa  189  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0715  translation-associated GTPase  33.42 
 
 
399 aa  186  8e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2275  translation-associated GTPase  30.9 
 
 
393 aa  184  3e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0624  translation-associated GTPase  32.04 
 
 
390 aa  181  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1534  translation-associated GTPase  30.89 
 
 
398 aa  176  6e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000432045 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2621  translation-associated GTPase  30.83 
 
 
389 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1725  translation-associated GTPase  30.97 
 
 
389 aa  164  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0297  translation-associated GTPase  31.37 
 
 
389 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3131  predicted protein  34.69 
 
 
271 aa  162  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668518  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0980  translation-associated GTPase  29.06 
 
 
403 aa  157  4e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.287275 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1008  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.66 
 
 
367 aa  92.4  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0937  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.06 
 
 
367 aa  92.8  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.844815  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0884  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.48 
 
 
367 aa  92  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0007  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.15 
 
 
371 aa  90.1  7e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0312393  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0006  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.94 
 
 
371 aa  89.7  8e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1047  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.5 
 
 
367 aa  89.4  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1318  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.23 
 
 
367 aa  89  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0104464  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5862  GTP-binding protein YchF  31.58 
 
 
359 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0005  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.55 
 
 
371 aa  88.2  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0823  GTP-binding protein YchF  32.31 
 
 
369 aa  88.2  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1605  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.86 
 
 
367 aa  87.8  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0458572  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0946  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.12 
 
 
367 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13271  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.73 
 
 
363 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13021  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.13 
 
 
363 aa  84.7  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.98106  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1835  GTP-binding protein YchF  37.59 
 
 
363 aa  84.3  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000078734  normal  0.600832 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13131  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.33 
 
 
363 aa  84  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0048  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.76 
 
 
367 aa  84  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1234  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.88 
 
 
363 aa  83.6  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.909233  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1166  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.33 
 
 
367 aa  83.6  0.000000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.219155  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0677  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.84 
 
 
366 aa  83.2  0.000000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.57 
 
 
426 aa  83.2  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl660  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.58 
 
 
364 aa  82.4  0.00000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1390  GTP-binding protein YchF  36.25 
 
 
367 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00313988  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0450  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.33 
 
 
364 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3507  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.33 
 
 
364 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125034  normal  0.0137315 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2931  GTP-binding protein YchF  37.09 
 
 
366 aa  81.6  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1698  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.32 
 
 
366 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.309195  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0206  GTP-binding protein YchF  32.54 
 
 
357 aa  82  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  34.06 
 
 
423 aa  81.6  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2708  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.88 
 
 
364 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0234  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.48 
 
 
366 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0453052 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0041  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.33 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0395  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.53 
 
 
363 aa  81.3  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186596  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1122  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.36 
 
 
366 aa  81.3  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167047  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1615  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.92 
 
 
370 aa  81.3  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0109  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.33 
 
 
365 aa  80.9  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000802684  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2579  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.16 
 
 
363 aa  80.5  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3037  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.33 
 
 
387 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3101  GTP-binding protein YchF  29.95 
 
 
357 aa  80.5  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  33.33 
 
 
424 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2193  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.22 
 
 
369 aa  80.5  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7891  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2482  GTP-binding protein YchF  37.11 
 
 
365 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3733  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.96 
 
 
363 aa  80.1  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.316822 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3679  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.88 
 
 
364 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0104752  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1046  GTP-binding protein YchF  31.87 
 
 
365 aa  80.1  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.929667  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2121  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.35 
 
 
365 aa  80.1  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1835  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.35 
 
 
365 aa  80.1  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.259258  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2845  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.74 
 
 
364 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000149199  hitchhiker  0.000000000000211408 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1534  GTP-binding protein YchF  34.97 
 
 
364 aa  80.1  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.452605 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4937  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.06 
 
 
366 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000108566  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0572  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.84 
 
 
363 aa  79.7  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2920  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.94 
 
 
364 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.657058  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0348  GTP-binding protein YchF  35.8 
 
 
364 aa  79.7  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.214484 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0411  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.95 
 
 
365 aa  79.7  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00200515  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0422  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.95 
 
 
365 aa  79.7  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0242427  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2032  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.68 
 
 
363 aa  79.7  0.00000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1259  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.39 
 
 
363 aa  79.7  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.471371  normal  0.0100148 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0664  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.24 
 
 
364 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151468  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0877  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.75 
 
 
364 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00007173  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4365  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.36 
 
 
359 aa  79.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1475  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.95 
 
 
364 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0116591 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1320  GTP-binding protein YchF  34.34 
 
 
364 aa  79.7  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2765  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.95 
 
 
364 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>