More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2275 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2275  translation-associated GTPase  100 
 
 		 393 aa  792    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2814  translation-associated GTPase  76.73 
 
 		 392 aa  626  1e-178  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0294234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0779  translation-associated GTPase  72.01 
 
 		 395 aa  589  1e-167  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0647  GTPase of unknown function domain protein  69.82 
 
 		 392 aa  571  1.0000000000000001e-162  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.36601  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1970  GTPase of unknown function domain protein  68.8 
 
 		 392 aa  556  1e-157  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1959  translation-associated GTPase  50.38 
 
 		 395 aa  431  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0175  translation-associated GTPase  51.41 
 
 		 390 aa  426  1e-118  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.278003  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1073  translation-associated GTPase  48.98 
 
 		 394 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2621  translation-associated GTPase  51.39 
 
 		 389 aa  403  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1577  translation-associated GTPase  50.38 
 
 		 389 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0297  translation-associated GTPase  48.51 
 
 		 389 aa  388  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1725  translation-associated GTPase  49.12 
 
 		 389 aa  387  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0538  GTPase of unknown function domain protein  47.49 
 
 		 400 aa  387  1e-106  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000115599  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1800  GTPase of unknown function  45.45 
 
 		 401 aa  377  1e-103  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.016533  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0624  translation-associated GTPase  48.1 
 
 		 390 aa  372  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1450  translation-associated GTPase  45.98 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00412196  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0069  translation-associated GTPase  45.71 
 
 		 400 aa  370  1e-101  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000183308  normal  0.0114224 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1534  translation-associated GTPase  43.77 
 
 		 398 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000432045 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0065  translation-associated GTPase  45.96 
 
 		 419 aa  355  5.999999999999999e-97  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0462  translation-associated GTPase  43.83 
 
 		 392 aa  355  1e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1545  translation-associated GTPase  43.07 
 
 		 392 aa  353  2e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0374  translation-associated GTPase  43.07 
 
 		 392 aa  353  4e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376171  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1806  translation-associated GTPase  44.86 
 
 		 401 aa  352  5e-96  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.732548 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0445  translation-associated GTPase  43.32 
 
 		 392 aa  351  1e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192639  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2999  GTPase of unknown function domain protein  45.06 
 
 		 399 aa  342  5e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0715  translation-associated GTPase  45.73 
 
 		 399 aa  341  1e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1662  translation-associated GTPase  47.13 
 
 		 401 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0128  translation-associated GTPase  44.95 
 
 		 395 aa  334  1e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737053  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0853  GTPase of unknown function domain protein  45.32 
 
 		 399 aa  331  1e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1465  translation-associated GTPase  44.58 
 
 		 400 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1616  translation-associated GTPase  43.94 
 
 		 401 aa  323  3e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0533  translation-associated GTPase  43.32 
 
 		 401 aa  321  9.999999999999999e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.626339  normal  0.0197443 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1334  translation-associated GTPase  42.57 
 
 		 395 aa  318  7e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.570526  normal  0.888182 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0980  translation-associated GTPase  37.22 
 
 		 403 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.287275 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00692  GTP-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_1G13540)  32.75 
 
 		 412 aa  188  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35157  predicted protein  30.9 
 
 		 413 aa  184  3e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3131  predicted protein  35.88 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668518  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0664  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.37 
 
 		 364 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151468  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2707  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.22 
 
 		 363 aa  110  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0005  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.13 
 
 		 371 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2579  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.95 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2592  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.96 
 
 		 364 aa  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000145967  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2367  GTP-binding protein YchF  31.27 
 
 		 366 aa  107  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2845  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.68 
 
 		 364 aa  106  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000149199  hitchhiker  0.000000000000211408 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2917  GTP-binding protein YchF  28.49 
 
 		 368 aa  106  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000213354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1835  GTP-binding protein YchF  28.84 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000078734  normal  0.600832 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2765  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.88 
 
 		 364 aa  104  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1475  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.16 
 
 		 364 aa  104  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0116591 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4776  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.19 
 
 		 366 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117268  hitchhiker  0.000704522 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2121  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.88 
 
 		 365 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1835  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.88 
 
 		 365 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.259258  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0155  GTP-binding protein YchF  28.57 
 
 		 364 aa  103  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.611358  normal  0.940592 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09848  putative ATP/GTP-binding protein  28.42 
 
 		 364 aa  103  7e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4937  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.87 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000108566  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2022  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.26 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23370  GTP-binding protein YchF  30.38 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000155952  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0027  GTP-binding protein YchF  28.24 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0349  GTPase, translation factor  26.88 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0746  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.34 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0310591  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0109  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.13 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000802684  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0099  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.86 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.76867  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3871  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.19 
 
 		 358 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.479028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0186  GTP-binding protein YchF  30.08 
 
 		 354 aa  101  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0007  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.18 
 
 		 371 aa  100  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0312393  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0823  GTP-binding protein YchF  27.89 
 
 		 369 aa  100  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3363  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.42 
 
 		 363 aa  100  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2482  GTP-binding protein YchF  32.46 
 
 		 365 aa  99.8  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1981  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.69 
 
 		 363 aa  99.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.262835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1923  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.69 
 
 		 363 aa  99.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1537  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.69 
 
 		 363 aa  99.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0518912 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1353  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.69 
 
 		 363 aa  99.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0280261  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1917  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.69 
 
 		 363 aa  99.8  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13021  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.43 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.98106  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1849  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.61 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.476561  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3679  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.46 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0104752  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0142  GTP-binding protein YchF  28.57 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.400282  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02583  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.76 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000898424  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0006  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.55 
 
 		 371 aa  98.6  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0517  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.07 
 
 		 362 aa  98.6  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2708  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.92 
 
 		 364 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0206  GTP-binding protein YchF  26.43 
 
 		 357 aa  98.6  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0395  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.27 
 
 		 363 aa  97.8  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186596  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0877  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.57 
 
 		 364 aa  97.8  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00007173  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3140  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.46 
 
 		 364 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.369877 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5328  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.57 
 
 		 366 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00440809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5156  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.57 
 
 		 366 aa  97.1  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.474948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5172  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.57 
 
 		 366 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000341574  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5333  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.57 
 
 		 366 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128538  hitchhiker  0.000000465437 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5724  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.57 
 
 		 366 aa  97.1  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000153579  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5585  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.57 
 
 		 366 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000269 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1389  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.11 
 
 		 366 aa  97.1  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.159782 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1171  GTP-binding protein YchF  27.85 
 
 		 364 aa  97.4  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5663  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.57 
 
 		 366 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000189692  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1320  GTP-binding protein YchF  26.67 
 
 		 364 aa  97.4  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5602  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.57 
 
 		 366 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2774  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.46 
 
 		 363 aa  97.1  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.97205 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2147  GTP-binding protein YchF  28.46 
 
 		 363 aa  97.1  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1805  GTP-binding protein YchF  28.46 
 
 		 363 aa  97.1  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5626  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.57 
 
 		 366 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000871672  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3257  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.76 
 
 		 363 aa  97.1  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>