More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0715 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0715  translation-associated GTPase  100 
 
 		 399 aa  816    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0065  translation-associated GTPase  63.89 
 
 		 419 aa  519  1e-146  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1806  translation-associated GTPase  56.42 
 
 		 401 aa  436  1e-121  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.732548 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1616  translation-associated GTPase  55.42 
 
 		 401 aa  421  1e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0533  translation-associated GTPase  54.55 
 
 		 401 aa  420  1e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.626339  normal  0.0197443 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1662  translation-associated GTPase  54.91 
 
 		 401 aa  416  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1800  GTPase of unknown function  51.13 
 
 		 401 aa  414  1e-114  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.016533  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0069  translation-associated GTPase  52.9 
 
 		 400 aa  403  1e-111  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000183308  normal  0.0114224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1073  translation-associated GTPase  51.13 
 
 		 394 aa  383  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0175  translation-associated GTPase  52.02 
 
 		 390 aa  380  1e-104  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.278003  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1534  translation-associated GTPase  47.37 
 
 		 398 aa  369  1e-101  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000432045 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1450  translation-associated GTPase  47.47 
 
 		 393 aa  362  6e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00412196  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0538  GTPase of unknown function domain protein  49.25 
 
 		 400 aa  362  6e-99  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000115599  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1959  translation-associated GTPase  47.63 
 
 		 395 aa  348  1e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0624  translation-associated GTPase  47.49 
 
 		 390 aa  347  2e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1545  translation-associated GTPase  46.1 
 
 		 392 aa  343  4e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0445  translation-associated GTPase  45.84 
 
 		 392 aa  342  5.999999999999999e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192639  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2275  translation-associated GTPase  45.73 
 
 		 393 aa  341  1e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0462  translation-associated GTPase  45.73 
 
 		 392 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0374  translation-associated GTPase  45.34 
 
 		 392 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376171  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2814  translation-associated GTPase  44.31 
 
 		 392 aa  334  2e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0294234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0779  translation-associated GTPase  45.11 
 
 		 395 aa  330  3e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0297  translation-associated GTPase  46.06 
 
 		 389 aa  330  3e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1577  translation-associated GTPase  45.61 
 
 		 389 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1725  translation-associated GTPase  44.39 
 
 		 389 aa  318  2e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2621  translation-associated GTPase  45 
 
 		 389 aa  316  4e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0647  GTPase of unknown function domain protein  43.47 
 
 		 392 aa  312  6.999999999999999e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.36601  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1334  translation-associated GTPase  43.03 
 
 		 395 aa  311  1e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.570526  normal  0.888182 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2999  GTPase of unknown function domain protein  40.4 
 
 		 399 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1970  GTPase of unknown function domain protein  42.82 
 
 		 392 aa  303  3.0000000000000004e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0980  translation-associated GTPase  38.65 
 
 		 403 aa  302  8.000000000000001e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.287275 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0853  GTPase of unknown function domain protein  40 
 
 		 399 aa  296  3e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0128  translation-associated GTPase  42.72 
 
 		 395 aa  295  9e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737053  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1465  translation-associated GTPase  40.49 
 
 		 400 aa  289  6e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00692  GTP-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_1G13540)  37.13 
 
 		 412 aa  224  2e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35157  predicted protein  33.42 
 
 		 413 aa  186  7e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3131  predicted protein  33.81 
 
 		 271 aa  128  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668518  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0572  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.09 
 
 		 363 aa  113  5e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1796  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.34 
 
 		 363 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0100064  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2022  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.86 
 
 		 363 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1579  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.05 
 
 		 360 aa  109  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2121  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.75 
 
 		 365 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1835  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.75 
 
 		 365 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.259258  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2931  GTP-binding protein YchF  32.35 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2845  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.48 
 
 		 364 aa  107  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000149199  hitchhiker  0.000000000000211408 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2193  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.86 
 
 		 369 aa  107  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7891  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1530  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.82 
 
 		 357 aa  107  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0416  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.74 
 
 		 363 aa  107  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.550609  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0677  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.85 
 
 		 366 aa  107  5e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0450  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.6 
 
 		 363 aa  107  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0274175  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0664  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.97 
 
 		 364 aa  106  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151468  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0877  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.14 
 
 		 364 aa  106  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00007173  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1734  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.48 
 
 		 363 aa  106  8e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0584836  normal  0.0100242 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2002  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.11 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00393198  normal  0.0943361 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1835  GTP-binding protein YchF  29.63 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000078734  normal  0.600832 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2898  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.09 
 
 		 364 aa  104  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4635  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.85 
 
 		 363 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2482  GTP-binding protein YchF  32.46 
 
 		 365 aa  103  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2928  GTP-binding protein YchF  32.34 
 
 		 364 aa  102  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.79075  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3618  GTP-binding protein YchF  32.34 
 
 		 364 aa  102  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1634  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.86 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0594912  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0823  GTP-binding protein YchF  31.91 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2765  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.29 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0305  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.96 
 
 		 368 aa  100  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0911742  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0946  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.98 
 
 		 367 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1475  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.29 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0116591 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4937  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.86 
 
 		 366 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000108566  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0349  GTPase, translation factor  31.79 
 
 		 366 aa  100  4e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3363  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.63 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2774  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.04 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.97205 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3140  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.71 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.369877 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1280  GTP-binding protein YchF  32.13 
 
 		 367 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2000  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.82 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0101  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.97 
 
 		 362 aa  100  6e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.720243  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0347  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.58 
 
 		 363 aa  99.4  9e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127573  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0072  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.16 
 
 		 367 aa  99  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0234  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.63 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0453052 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3569  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.03 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0519  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.03 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3733  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.33 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.316822 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3587  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.03 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3596  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.03 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0154  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.97 
 
 		 362 aa  99.4  1e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0952  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.03 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1923  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.03 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.264442  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0657  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.03 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0884  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.82 
 
 		 367 aa  98.2  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1008  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.12 
 
 		 367 aa  98.6  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4263  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.09 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109438  normal  0.19312 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3631  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.95 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1166  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.76 
 
 		 367 aa  98.2  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.219155  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1080  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  39.26 
 
 		 359 aa  98.2  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3679  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.65 
 
 		 364 aa  97.8  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0104752  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2592  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31 
 
 		 364 aa  98.2  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000145967  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1127  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.2 
 
 		 363 aa  97.8  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.660689  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2043  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.89 
 
 		 363 aa  97.8  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3418  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.1 
 
 		 366 aa  97.4  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000016062  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1320  GTP-binding protein YchF  29.67 
 
 		 364 aa  97.4  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1486  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.87 
 
 		 367 aa  97.4  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0027  GTP-binding protein YchF  26.96 
 
 		 366 aa  97.4  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>