More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1800 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1800  GTPase of unknown function  100 
 
 		 401 aa  822    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.016533  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0069  translation-associated GTPase  70.93 
 
 		 400 aa  608  1e-173  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000183308  normal  0.0114224 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0065  translation-associated GTPase  50.63 
 
 		 419 aa  412  1e-114  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0715  translation-associated GTPase  51.13 
 
 		 399 aa  414  1e-114  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0175  translation-associated GTPase  51.52 
 
 		 390 aa  403  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.278003  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1073  translation-associated GTPase  49.24 
 
 		 394 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0538  GTPase of unknown function domain protein  49.5 
 
 		 400 aa  392  1e-108  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000115599  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1450  translation-associated GTPase  49.37 
 
 		 393 aa  391  1e-108  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00412196  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1545  translation-associated GTPase  50.75 
 
 		 392 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1959  translation-associated GTPase  49.12 
 
 		 395 aa  386  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0462  translation-associated GTPase  49.25 
 
 		 392 aa  384  1e-105  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0374  translation-associated GTPase  50 
 
 		 392 aa  384  1e-105  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376171  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1806  translation-associated GTPase  46.87 
 
 		 401 aa  384  1e-105  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.732548 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1662  translation-associated GTPase  49.12 
 
 		 401 aa  379  1e-104  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0297  translation-associated GTPase  49.88 
 
 		 389 aa  379  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1534  translation-associated GTPase  47.5 
 
 		 398 aa  379  1e-104  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000432045 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0533  translation-associated GTPase  49.12 
 
 		 401 aa  379  1e-104  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.626339  normal  0.0197443 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1616  translation-associated GTPase  48.87 
 
 		 401 aa  375  1e-103  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0445  translation-associated GTPase  48.5 
 
 		 392 aa  377  1e-103  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192639  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2275  translation-associated GTPase  45.45 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2814  translation-associated GTPase  43.69 
 
 		 392 aa  369  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0294234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1577  translation-associated GTPase  46.62 
 
 		 389 aa  363  3e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0779  translation-associated GTPase  43.39 
 
 		 395 aa  361  1e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2621  translation-associated GTPase  47.75 
 
 		 389 aa  360  3e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1725  translation-associated GTPase  45.73 
 
 		 389 aa  355  5e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0647  GTPase of unknown function domain protein  43.32 
 
 		 392 aa  347  3e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.36601  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0624  translation-associated GTPase  45.36 
 
 		 390 aa  346  5e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0980  translation-associated GTPase  44.53 
 
 		 403 aa  340  2e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.287275 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1970  GTPase of unknown function domain protein  43.43 
 
 		 392 aa  336  5e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0853  GTPase of unknown function domain protein  41.06 
 
 		 399 aa  322  5e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2999  GTPase of unknown function domain protein  39.8 
 
 		 399 aa  319  3.9999999999999996e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1334  translation-associated GTPase  40.55 
 
 		 395 aa  319  7e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.570526  normal  0.888182 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0128  translation-associated GTPase  40.81 
 
 		 395 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737053  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1465  translation-associated GTPase  39.8 
 
 		 400 aa  308  8e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35157  predicted protein  33.5 
 
 		 413 aa  211  3e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00692  GTP-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_1G13540)  33.07 
 
 		 412 aa  208  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3131  predicted protein  34.17 
 
 		 271 aa  130  4.0000000000000003e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668518  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2022  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.51 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1739  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.95 
 
 		 366 aa  103  6e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00258583  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2707  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.61 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0154  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.22 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0109  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.26 
 
 		 365 aa  100  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000802684  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0349  GTPase, translation factor  26.52 
 
 		 366 aa  100  4e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2579  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.34 
 
 		 363 aa  100  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0347  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.64 
 
 		 363 aa  100  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127573  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0416  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.23 
 
 		 363 aa  100  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.550609  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0450  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.26 
 
 		 363 aa  99.4  9e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0274175  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0007  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.08 
 
 		 371 aa  99.4  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0312393  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2000  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.69 
 
 		 364 aa  98.6  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0027  GTP-binding protein YchF  25.59 
 
 		 366 aa  98.6  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1615  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.42 
 
 		 370 aa  98.2  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1634  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.61 
 
 		 362 aa  97.4  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0594912  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119525  Nucleic acid binding GTPase, translation factor, putative  29.29 
 
 		 419 aa  97.8  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.832953  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0005  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.17 
 
 		 371 aa  97.1  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4937  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.6 
 
 		 366 aa  96.7  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000108566  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0823  GTP-binding protein YchF  24.65 
 
 		 369 aa  96.7  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0877  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.76 
 
 		 364 aa  96.3  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00007173  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2121  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.78 
 
 		 365 aa  96.3  9e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8269  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  42.76 
 
 		 357 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1835  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.78 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.259258  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0117  GTPase, translation factor  30.43 
 
 		 367 aa  95.5  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0206  GTP-binding protein YchF  28.19 
 
 		 357 aa  95.1  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1734  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.6 
 
 		 363 aa  95.1  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0584836  normal  0.0100242 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13021  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.57 
 
 		 363 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.98106  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4015  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.08 
 
 		 366 aa  94.4  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.362655  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2592  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.86 
 
 		 364 aa  94.4  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000145967  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1234  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.61 
 
 		 363 aa  94.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.909233  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2219  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.06 
 
 		 365 aa  94.4  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5626  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.85 
 
 		 366 aa  94  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000871672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5328  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.85 
 
 		 366 aa  94.4  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00440809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5156  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.85 
 
 		 366 aa  94.4  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.474948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5172  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.85 
 
 		 366 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000341574  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5602  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.85 
 
 		 366 aa  94  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5724  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.85 
 
 		 366 aa  94.4  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000153579  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5585  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.85 
 
 		 366 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000269 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5663  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.85 
 
 		 366 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000189692  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0101  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.91 
 
 		 362 aa  94  5e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.720243  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1605  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.85 
 
 		 367 aa  93.6  5e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0458572  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0572  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.72 
 
 		 363 aa  94  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0648  GTP-binding protein YchF  27.71 
 
 		 362 aa  93.6  5e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.379901 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2082  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  40.97 
 
 		 360 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330246  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37067  predicted protein  27.92 
 
 		 363 aa  93.2  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3748  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.64 
 
 		 367 aa  92.8  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0006  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.77 
 
 		 371 aa  92.8  9e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0805  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.22 
 
 		 364 aa  92.8  9e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3392  GTP-binding protein YchF  41.55 
 
 		 359 aa  92.8  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0048  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.23 
 
 		 367 aa  92.4  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4333  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  42.14 
 
 		 376 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.567593 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0977  GTP-binding protein YchF  42.07 
 
 		 358 aa  92.4  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.245774  hitchhiker  0.00114943 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1204  GTP-binding protein YchF  26.29 
 
 		 372 aa  92  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.590839  normal  0.981589 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4102  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  40.82 
 
 		 376 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4178  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  40.82 
 
 		 376 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4625  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  40.97 
 
 		 360 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0664  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  41.73 
 
 		 364 aa  91.7  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151468  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3794  GTP-binding protein YchF  29.15 
 
 		 363 aa  92  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2845  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  42.14 
 
 		 364 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000149199  hitchhiker  0.000000000000211408 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1127  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.59 
 
 		 363 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.660689  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2765  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.82 
 
 		 364 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5333  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.59 
 
 		 366 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128538  hitchhiker  0.000000465437 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3679  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.06 
 
 		 364 aa  92  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0104752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>