More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1970 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0647  GTPase of unknown function domain protein  89.03 
 
 		 392 aa  709    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.36601  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1970  GTPase of unknown function domain protein  100 
 
 		 392 aa  790    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0779  translation-associated GTPase  70.41 
 
 		 395 aa  593  1e-168  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2814  translation-associated GTPase  71.94 
 
 		 392 aa  592  1e-168  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0294234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2275  translation-associated GTPase  68.8 
 
 		 393 aa  567  1e-161  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1959  translation-associated GTPase  54.45 
 
 		 395 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1073  translation-associated GTPase  51.53 
 
 		 394 aa  423  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0175  translation-associated GTPase  50 
 
 		 390 aa  414  1e-114  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.278003  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1577  translation-associated GTPase  47.86 
 
 		 389 aa  385  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2621  translation-associated GTPase  48.62 
 
 		 389 aa  378  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0538  GTPase of unknown function domain protein  45.23 
 
 		 400 aa  375  1e-103  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000115599  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1725  translation-associated GTPase  47.34 
 
 		 389 aa  364  2e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0297  translation-associated GTPase  46.85 
 
 		 389 aa  363  2e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0624  translation-associated GTPase  47.21 
 
 		 390 aa  359  5e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1800  GTPase of unknown function  43.43 
 
 		 401 aa  351  1e-95  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.016533  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0069  translation-associated GTPase  44.19 
 
 		 400 aa  351  2e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000183308  normal  0.0114224 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1534  translation-associated GTPase  45.18 
 
 		 398 aa  348  7e-95  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000432045 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1450  translation-associated GTPase  44.19 
 
 		 393 aa  346  5e-94  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00412196  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0065  translation-associated GTPase  44.84 
 
 		 419 aa  341  1e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0445  translation-associated GTPase  43.83 
 
 		 392 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192639  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1806  translation-associated GTPase  42.93 
 
 		 401 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.732548 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0462  translation-associated GTPase  43.07 
 
 		 392 aa  333  3e-90  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1334  translation-associated GTPase  44.47 
 
 		 395 aa  332  5e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.570526  normal  0.888182 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1545  translation-associated GTPase  42.57 
 
 		 392 aa  331  1e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2999  GTPase of unknown function domain protein  43.43 
 
 		 399 aa  331  2e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1465  translation-associated GTPase  44.84 
 
 		 400 aa  330  3e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0374  translation-associated GTPase  42.32 
 
 		 392 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376171  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0853  GTPase of unknown function domain protein  43.94 
 
 		 399 aa  328  9e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0533  translation-associated GTPase  44.19 
 
 		 401 aa  325  9e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.626339  normal  0.0197443 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0128  translation-associated GTPase  43.32 
 
 		 395 aa  322  9.000000000000001e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737053  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1662  translation-associated GTPase  45.2 
 
 		 401 aa  321  9.999999999999999e-87  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1616  translation-associated GTPase  44.42 
 
 		 401 aa  318  1e-85  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0715  translation-associated GTPase  42.82 
 
 		 399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0980  translation-associated GTPase  36.93 
 
 		 403 aa  257  3e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.287275 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35157  predicted protein  34.25 
 
 		 413 aa  209  9e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00692  GTP-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_1G13540)  33.25 
 
 		 412 aa  199  6e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3131  predicted protein  34.3 
 
 		 271 aa  129  9.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668518  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2367  GTP-binding protein YchF  26.72 
 
 		 366 aa  101  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0186  GTP-binding protein YchF  28.78 
 
 		 354 aa  99.8  8e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2022  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.64 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0664  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.57 
 
 		 364 aa  97.8  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151468  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3794  GTP-binding protein YchF  26.32 
 
 		 363 aa  97.4  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0445  GTP-binding protein YchF  38.79 
 
 		 373 aa  96.3  8e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0330999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2845  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.28 
 
 		 364 aa  96.3  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000149199  hitchhiker  0.000000000000211408 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13271  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.97 
 
 		 363 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1835  GTP-binding protein YchF  29.52 
 
 		 363 aa  94.7  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000078734  normal  0.600832 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1390  GTP-binding protein YchF  26.85 
 
 		 367 aa  94  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00313988  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13021  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.36 
 
 		 363 aa  93.6  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.98106  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0877  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.15 
 
 		 364 aa  92.8  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00007173  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3363  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.76 
 
 		 363 aa  92.8  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13131  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.6 
 
 		 363 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4625  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.67 
 
 		 363 aa  92.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0369347 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0554  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.49 
 
 		 363 aa  92.4  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.268556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0823  GTP-binding protein YchF  31.44 
 
 		 369 aa  92.8  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1320  GTP-binding protein YchF  24.63 
 
 		 364 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2707  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.61 
 
 		 363 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2000  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.09 
 
 		 364 aa  91.3  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1234  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.54 
 
 		 363 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.909233  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1574  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.9 
 
 		 365 aa  91.7  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5862  GTP-binding protein YchF  38.41 
 
 		 359 aa  91.3  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2917  GTP-binding protein YchF  27.7 
 
 		 368 aa  91.3  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000213354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2592  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.25 
 
 		 364 aa  90.9  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000145967  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3030  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.02 
 
 		 363 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3090  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.02 
 
 		 363 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2482  GTP-binding protein YchF  26.67 
 
 		 365 aa  90.9  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2579  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.34 
 
 		 363 aa  90.1  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0271  GTP-binding protein YchF  26.47 
 
 		 364 aa  90.5  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198016 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2928  GTP-binding protein YchF  35.8 
 
 		 364 aa  90.5  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.79075  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2121  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.87 
 
 		 365 aa  90.5  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1835  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.87 
 
 		 365 aa  90.5  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.259258  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3618  GTP-binding protein YchF  35.8 
 
 		 364 aa  90.5  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3733  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.27 
 
 		 363 aa  90.1  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.316822 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3101  GTP-binding protein YchF  36.88 
 
 		 357 aa  90.1  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3679  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.4 
 
 		 364 aa  90.1  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0104752  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0656  GTP-binding protein YchF  35.76 
 
 		 370 aa  89.7  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1204  GTP-binding protein YchF  34.76 
 
 		 372 aa  89.4  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.590839  normal  0.981589 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0109  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.76 
 
 		 365 aa  89.7  9e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000802684  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0027  GTP-binding protein YchF  36.84 
 
 		 366 aa  89.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2115  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.85 
 
 		 363 aa  89  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000126801  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3392  GTP-binding protein YchF  36.65 
 
 		 359 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1055  GTP-binding protein YchF  37.27 
 
 		 354 aa  88.2  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0763151  hitchhiker  0.00159487 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1475  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.02 
 
 		 364 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0116591 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2204  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.91 
 
 		 363 aa  88.6  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000173002  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2765  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.42 
 
 		 364 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0416  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.14 
 
 		 363 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.550609  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1080  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.76 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl660  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.15 
 
 		 364 aa  87.8  3e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1127  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.6 
 
 		 363 aa  87.8  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.660689  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2219  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.9 
 
 		 365 aa  88.2  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4937  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.9 
 
 		 366 aa  88.2  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000108566  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0887  GTP-binding protein YchF  27.32 
 
 		 364 aa  87.8  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0231852  normal  0.589868 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2032  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.98 
 
 		 363 aa  87.4  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2931  GTP-binding protein YchF  33.76 
 
 		 366 aa  87.4  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3193  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.05 
 
 		 363 aa  87.4  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.36162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0231  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.37 
 
 		 363 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.375519 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0349  GTPase, translation factor  34.76 
 
 		 366 aa  87  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0005  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.79 
 
 		 371 aa  87  5e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0041  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.97 
 
 		 365 aa  86.7  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3037  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.29 
 
 		 387 aa  86.7  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0422  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.58 
 
 		 365 aa  86.7  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0242427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>