More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0980 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0980  translation-associated GTPase  100 
 
 
403 aa  818    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.287275 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1800  GTPase of unknown function  44.53 
 
 
401 aa  340  2e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.016533  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0069  translation-associated GTPase  41.54 
 
 
400 aa  315  6e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000183308  normal  0.0114224 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0715  translation-associated GTPase  38.65 
 
 
399 aa  302  9e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0065  translation-associated GTPase  39.95 
 
 
419 aa  301  1e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1073  translation-associated GTPase  41.69 
 
 
394 aa  301  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1450  translation-associated GTPase  40.65 
 
 
393 aa  293  4e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00412196  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1545  translation-associated GTPase  41.4 
 
 
392 aa  292  7e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0462  translation-associated GTPase  41.06 
 
 
392 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1806  translation-associated GTPase  39.12 
 
 
401 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.732548 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0445  translation-associated GTPase  40.65 
 
 
392 aa  285  7e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192639  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0374  translation-associated GTPase  40.9 
 
 
392 aa  285  8e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376171  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1959  translation-associated GTPase  41.03 
 
 
395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0779  translation-associated GTPase  38.61 
 
 
395 aa  271  1e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1725  translation-associated GTPase  39.65 
 
 
389 aa  271  1e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0538  GTPase of unknown function domain protein  37.91 
 
 
400 aa  271  1e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000115599  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2275  translation-associated GTPase  37.22 
 
 
393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0175  translation-associated GTPase  39.2 
 
 
390 aa  269  7e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.278003  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1534  translation-associated GTPase  37.69 
 
 
398 aa  266  5.999999999999999e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000432045 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2814  translation-associated GTPase  38.46 
 
 
392 aa  263  3e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0294234  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1662  translation-associated GTPase  37.91 
 
 
401 aa  262  8e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1577  translation-associated GTPase  37.31 
 
 
389 aa  260  3e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0533  translation-associated GTPase  38.86 
 
 
401 aa  260  3e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.626339  normal  0.0197443 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1616  translation-associated GTPase  38.6 
 
 
401 aa  252  7e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0624  translation-associated GTPase  34.66 
 
 
390 aa  252  7e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0297  translation-associated GTPase  36.66 
 
 
389 aa  251  1e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1465  translation-associated GTPase  36.23 
 
 
400 aa  249  5e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2621  translation-associated GTPase  37.16 
 
 
389 aa  249  6e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1970  GTPase of unknown function domain protein  36.93 
 
 
392 aa  247  3e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0647  GTPase of unknown function domain protein  36.57 
 
 
392 aa  245  9e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.36601  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1334  translation-associated GTPase  36.3 
 
 
395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.570526  normal  0.888182 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0853  GTPase of unknown function domain protein  34.33 
 
 
399 aa  231  2e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0128  translation-associated GTPase  33.33 
 
 
395 aa  229  6e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737053  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2999  GTPase of unknown function domain protein  33.42 
 
 
399 aa  228  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35157  predicted protein  29.06 
 
 
413 aa  157  4e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00692  GTP-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_1G13540)  29.4 
 
 
412 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0877  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.54 
 
 
364 aa  96.7  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00007173  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2482  GTP-binding protein YchF  33.05 
 
 
365 aa  95.1  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2193  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  24.94 
 
 
369 aa  95.5  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7891  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2121  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.81 
 
 
365 aa  94  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1835  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.85 
 
 
365 aa  94  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.259258  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3131  predicted protein  29.3 
 
 
271 aa  92.4  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668518  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0416  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.51 
 
 
363 aa  91.3  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.550609  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0572  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.66 
 
 
363 aa  89.4  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1835  GTP-binding protein YchF  25.59 
 
 
363 aa  89  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000078734  normal  0.600832 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0347  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.8 
 
 
363 aa  88.2  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127573  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4937  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.13 
 
 
366 aa  87.8  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000108566  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1280  GTP-binding protein YchF  31.32 
 
 
367 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2002  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.07 
 
 
363 aa  87.4  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00393198  normal  0.0943361 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1634  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.56 
 
 
362 aa  87  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0594912  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2707  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.34 
 
 
363 aa  85.9  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2845  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.96 
 
 
364 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000149199  hitchhiker  0.000000000000211408 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1796  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.05 
 
 
363 aa  85.9  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0100064  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0530  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.13 
 
 
363 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2928  GTP-binding protein YchF  31.55 
 
 
364 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.79075  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3618  GTP-binding protein YchF  31.55 
 
 
364 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0664  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.34 
 
 
364 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151468  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1734  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.42 
 
 
363 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0584836  normal  0.0100242 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1524  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.39 
 
 
363 aa  84.3  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1390  GTP-binding protein YchF  33.7 
 
 
367 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00313988  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0027  GTP-binding protein YchF  30.72 
 
 
366 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3140  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.23 
 
 
364 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.369877 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2708  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.99 
 
 
364 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2579  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.73 
 
 
363 aa  84  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0390  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.98 
 
 
363 aa  84  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.997224  normal  0.0213751 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0590  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.94 
 
 
365 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000196131  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2774  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.23 
 
 
363 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.97205 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0450  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.12 
 
 
363 aa  84  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0274175  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3679  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.92 
 
 
364 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0104752  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2765  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.27 
 
 
364 aa  84  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1475  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.27 
 
 
364 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0116591 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0894  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  24.94 
 
 
363 aa  83.6  0.000000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.943704 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09848  putative ATP/GTP-binding protein  25.13 
 
 
364 aa  83.6  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2022  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.62 
 
 
363 aa  83.6  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0887  GTP-binding protein YchF  31.55 
 
 
364 aa  83.6  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0231852  normal  0.589868 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23370  GTP-binding protein YchF  29.03 
 
 
364 aa  83.2  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000155952  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3733  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.93 
 
 
363 aa  83.2  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.316822 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1047  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.73 
 
 
367 aa  83.2  0.000000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2898  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.61 
 
 
364 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0496  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.81 
 
 
364 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  37.68 
 
 
427 aa  82.4  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0675  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.54 
 
 
361 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.762559  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2931  GTP-binding protein YchF  33.53 
 
 
366 aa  82.4  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2581  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.81 
 
 
364 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0524  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.81 
 
 
364 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0155  GTP-binding protein YchF  32.14 
 
 
364 aa  82  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.611358  normal  0.940592 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2592  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.41 
 
 
364 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000145967  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4838  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.15 
 
 
365 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13271  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.93 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1615  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  24.94 
 
 
370 aa  82  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0429  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.99 
 
 
364 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0453  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.99 
 
 
364 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0338644 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0142  GTP-binding protein YchF  32.14 
 
 
364 aa  81.6  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.400282  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2032  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.81 
 
 
363 aa  80.9  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1769  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.64 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2000  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.25 
 
 
364 aa  81.3  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3611  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.23 
 
 
364 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2871  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.65 
 
 
364 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0099  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  24.68 
 
 
363 aa  80.9  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.76867  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf169  putative GTPase translation factor  28.04 
 
 
367 aa  80.9  0.00000000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.716411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>