More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2814 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2814  translation-associated GTPase  100 
 
 		 392 aa  786    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0294234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2275  translation-associated GTPase  76.73 
 
 		 393 aa  626  1e-178  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0779  translation-associated GTPase  76.28 
 
 		 395 aa  609  1e-173  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0647  GTPase of unknown function domain protein  73.72 
 
 		 392 aa  602  1.0000000000000001e-171  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.36601  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1970  GTPase of unknown function domain protein  71.94 
 
 		 392 aa  580  1e-164  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1959  translation-associated GTPase  49.11 
 
 		 395 aa  418  1e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0175  translation-associated GTPase  50.77 
 
 		 390 aa  419  1e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.278003  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1073  translation-associated GTPase  49.23 
 
 		 394 aa  410  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1577  translation-associated GTPase  50.51 
 
 		 389 aa  394  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0538  GTPase of unknown function domain protein  46.98 
 
 		 400 aa  388  1e-107  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000115599  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2621  translation-associated GTPase  47.58 
 
 		 389 aa  382  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1725  translation-associated GTPase  48.6 
 
 		 389 aa  380  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1800  GTPase of unknown function  43.69 
 
 		 401 aa  369  1e-101  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.016533  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0297  translation-associated GTPase  46.45 
 
 		 389 aa  371  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0069  translation-associated GTPase  44.95 
 
 		 400 aa  368  1e-100  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000183308  normal  0.0114224 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1450  translation-associated GTPase  44.08 
 
 		 393 aa  363  4e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00412196  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1534  translation-associated GTPase  43.77 
 
 		 398 aa  360  2e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000432045 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0065  translation-associated GTPase  46.46 
 
 		 419 aa  357  1.9999999999999998e-97  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0624  translation-associated GTPase  45.55 
 
 		 390 aa  355  1e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1545  translation-associated GTPase  42.93 
 
 		 392 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1806  translation-associated GTPase  45.82 
 
 		 401 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.732548 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0462  translation-associated GTPase  42.93 
 
 		 392 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0374  translation-associated GTPase  42.93 
 
 		 392 aa  350  2e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376171  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0445  translation-associated GTPase  42.42 
 
 		 392 aa  345  7e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192639  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1465  translation-associated GTPase  45.71 
 
 		 400 aa  334  2e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2999  GTPase of unknown function domain protein  43.69 
 
 		 399 aa  334  2e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0715  translation-associated GTPase  44.31 
 
 		 399 aa  334  2e-90  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1662  translation-associated GTPase  45.71 
 
 		 401 aa  330  4e-89  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0853  GTPase of unknown function domain protein  43.43 
 
 		 399 aa  328  1.0000000000000001e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0128  translation-associated GTPase  43.32 
 
 		 395 aa  325  8.000000000000001e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737053  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1334  translation-associated GTPase  44.47 
 
 		 395 aa  323  3e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.570526  normal  0.888182 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1616  translation-associated GTPase  45.2 
 
 		 401 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0533  translation-associated GTPase  42.93 
 
 		 401 aa  319  5e-86  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.626339  normal  0.0197443 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0980  translation-associated GTPase  38.46 
 
 		 403 aa  263  3e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.287275 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00692  GTP-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_1G13540)  32.35 
 
 		 412 aa  196  5.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35157  predicted protein  33.24 
 
 		 413 aa  190  4e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3131  predicted protein  37.85 
 
 		 271 aa  124  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668518  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2367  GTP-binding protein YchF  28.34 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0349  GTPase, translation factor  27.93 
 
 		 366 aa  109  9.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2022  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.68 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0664  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.52 
 
 		 364 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151468  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0099  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.05 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.76867  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2765  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.03 
 
 		 364 aa  103  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0027  GTP-binding protein YchF  29.09 
 
 		 366 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1475  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.03 
 
 		 364 aa  103  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0116591 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2592  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.93 
 
 		 364 aa  102  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000145967  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23370  GTP-binding protein YchF  29.46 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000155952  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2845  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.07 
 
 		 364 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000149199  hitchhiker  0.000000000000211408 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0109  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.41 
 
 		 365 aa  102  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000802684  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2032  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.97 
 
 		 363 aa  101  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0117  GTPase, translation factor  26.61 
 
 		 367 aa  101  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1835  GTP-binding protein YchF  27.59 
 
 		 363 aa  100  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000078734  normal  0.600832 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3166  putative GTP-binding protein  28.38 
 
 		 364 aa  100  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563466 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0005  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.96 
 
 		 371 aa  100  6e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2219  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.57 
 
 		 365 aa  99.4  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4015  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.7 
 
 		 366 aa  99.4  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.362655  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5333  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.7 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128538  hitchhiker  0.000000465437 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0154  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.54 
 
 		 362 aa  98.6  2e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0007  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.34 
 
 		 371 aa  98.6  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0312393  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3418  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.78 
 
 		 366 aa  97.8  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000016062  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2000  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.04 
 
 		 364 aa  97.4  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1389  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.13 
 
 		 366 aa  97.4  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.159782 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0186  GTP-binding protein YchF  30.46 
 
 		 354 aa  97.1  4e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5626  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.44 
 
 		 366 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000871672  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0006  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.12 
 
 		 371 aa  96.7  6e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5328  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.44 
 
 		 366 aa  96.7  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00440809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5156  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.44 
 
 		 366 aa  96.7  6e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.474948  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2917  GTP-binding protein YchF  24.93 
 
 		 368 aa  96.7  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000213354  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5172  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.44 
 
 		 366 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000341574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5724  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.44 
 
 		 366 aa  96.7  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000153579  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5602  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.44 
 
 		 366 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5585  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.44 
 
 		 366 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000269 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5663  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.44 
 
 		 366 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000189692  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2193  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.57 
 
 		 369 aa  96.7  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7891  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0101  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.01 
 
 		 362 aa  96.3  8e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.720243  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37067  predicted protein  29.43 
 
 		 363 aa  95.9  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3547  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.51 
 
 		 366 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4635  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.23 
 
 		 363 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0206  GTP-binding protein YchF  24.38 
 
 		 357 aa  95.9  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3871  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.03 
 
 		 358 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.479028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1579  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.18 
 
 		 360 aa  95.5  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0155  GTP-binding protein YchF  27.69 
 
 		 364 aa  95.9  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.611358  normal  0.940592 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0887  GTP-binding protein YchF  26.95 
 
 		 364 aa  95.9  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0231852  normal  0.589868 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2928  GTP-binding protein YchF  27.51 
 
 		 364 aa  94.7  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.79075  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3618  GTP-binding protein YchF  27.51 
 
 		 364 aa  94.7  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2082  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29 
 
 		 360 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330246  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11134  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.71 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1739  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.22 
 
 		 366 aa  95.5  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00258583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0857  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.62 
 
 		 358 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0266679  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3101  GTP-binding protein YchF  40.12 
 
 		 357 aa  95.5  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0142  GTP-binding protein YchF  29.3 
 
 		 364 aa  94.7  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.400282  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13271  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  23.9 
 
 		 363 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3363  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.26 
 
 		 363 aa  94.4  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2121  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.94 
 
 		 365 aa  94.4  3e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0271  GTP-binding protein YchF  27.39 
 
 		 364 aa  94.7  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4625  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.41 
 
 		 360 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1204  GTP-binding protein YchF  31.37 
 
 		 372 aa  94  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.590839  normal  0.981589 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1835  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.94 
 
 		 365 aa  94  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.259258  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0416  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.14 
 
 		 363 aa  94  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.550609  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3392  GTP-binding protein YchF  28.03 
 
 		 359 aa  93.6  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>