More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0445 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0445  translation-associated GTPase  100 
 
 
392 aa  802    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192639  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1545  translation-associated GTPase  84.95 
 
 
392 aa  699    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0374  translation-associated GTPase  84.95 
 
 
392 aa  699    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376171  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0462  translation-associated GTPase  85.2 
 
 
392 aa  701    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1450  translation-associated GTPase  73.35 
 
 
393 aa  609  1e-173  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00412196  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0538  GTPase of unknown function domain protein  51.75 
 
 
400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000115599  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1073  translation-associated GTPase  52.64 
 
 
394 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0175  translation-associated GTPase  50.38 
 
 
390 aa  386  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.278003  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1800  GTPase of unknown function  48.5 
 
 
401 aa  377  1e-103  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.016533  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1959  translation-associated GTPase  48.74 
 
 
395 aa  376  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0069  translation-associated GTPase  47.37 
 
 
400 aa  371  1e-101  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000183308  normal  0.0114224 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2621  translation-associated GTPase  47.1 
 
 
389 aa  365  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1725  translation-associated GTPase  48.61 
 
 
389 aa  363  2e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0065  translation-associated GTPase  45.8 
 
 
419 aa  353  2e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0297  translation-associated GTPase  46.72 
 
 
389 aa  351  1e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2275  translation-associated GTPase  43.32 
 
 
393 aa  351  1e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1577  translation-associated GTPase  45.32 
 
 
389 aa  346  4e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2814  translation-associated GTPase  42.42 
 
 
392 aa  345  7e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0294234  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0624  translation-associated GTPase  47.36 
 
 
390 aa  344  2e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0779  translation-associated GTPase  41.85 
 
 
395 aa  344  2e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0715  translation-associated GTPase  45.84 
 
 
399 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1534  translation-associated GTPase  45.32 
 
 
398 aa  340  2e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000432045 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0647  GTPase of unknown function domain protein  43.32 
 
 
392 aa  338  9.999999999999999e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.36601  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1616  translation-associated GTPase  46.72 
 
 
401 aa  335  5.999999999999999e-91  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0533  translation-associated GTPase  44.44 
 
 
401 aa  328  7e-89  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.626339  normal  0.0197443 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1806  translation-associated GTPase  42.39 
 
 
401 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.732548 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1970  GTPase of unknown function domain protein  43.83 
 
 
392 aa  326  4.0000000000000003e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1662  translation-associated GTPase  43.94 
 
 
401 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2999  GTPase of unknown function domain protein  38.01 
 
 
399 aa  310  2e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0853  GTPase of unknown function domain protein  38.58 
 
 
399 aa  305  1.0000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0128  translation-associated GTPase  38.38 
 
 
395 aa  303  5.000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737053  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1465  translation-associated GTPase  38.52 
 
 
400 aa  300  4e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1334  translation-associated GTPase  38.32 
 
 
395 aa  299  6e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.570526  normal  0.888182 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0980  translation-associated GTPase  40.65 
 
 
403 aa  285  7e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.287275 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35157  predicted protein  35.68 
 
 
413 aa  243  6e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00692  GTP-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_1G13540)  33.83 
 
 
412 aa  218  1e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3131  predicted protein  32.84 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668518  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2022  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.71 
 
 
363 aa  119  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0416  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.79 
 
 
363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.550609  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3547  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.78 
 
 
366 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2193  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.19 
 
 
369 aa  116  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7891  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1734  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.34 
 
 
363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0584836  normal  0.0100242 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12121  GTP-binding protein  29.74 
 
 
393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.467658 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23370  GTP-binding protein YchF  29.54 
 
 
364 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000155952  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1796  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.87 
 
 
363 aa  114  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0100064  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0823  GTP-binding protein YchF  28.26 
 
 
369 aa  113  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2482  GTP-binding protein YchF  30.56 
 
 
365 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0877  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.47 
 
 
364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00007173  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0347  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.28 
 
 
363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127573  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1634  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.17 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0594912  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37067  predicted protein  29.3 
 
 
363 aa  110  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0572  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.67 
 
 
363 aa  110  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1835  GTP-binding protein YchF  30.89 
 
 
363 aa  111  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000078734  normal  0.600832 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3418  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.47 
 
 
366 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000016062  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0048  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.42 
 
 
367 aa  108  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0422  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.14 
 
 
365 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0242427  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0411  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.14 
 
 
365 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00200515  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0450  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.87 
 
 
363 aa  108  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0274175  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0442  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.95 
 
 
364 aa  107  3e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.392269  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0117  GTPase, translation factor  28.22 
 
 
367 aa  107  3e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1615  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.13 
 
 
370 aa  107  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4937  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.24 
 
 
366 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000108566  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2592  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.27 
 
 
364 aa  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000145967  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0007  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.42 
 
 
371 aa  107  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0312393  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0109  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.48 
 
 
365 aa  107  5e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000802684  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1259  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.33 
 
 
363 aa  106  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.471371  normal  0.0100148 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21870  GTP-binding protein YchF  27.37 
 
 
354 aa  106  7e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0475417 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4015  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.78 
 
 
366 aa  106  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.362655  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3631  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.33 
 
 
363 aa  106  8e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3999  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.79 
 
 
365 aa  106  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5626  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.87 
 
 
366 aa  106  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000871672  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0664  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.8 
 
 
364 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151468  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13021  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.38 
 
 
363 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.98106  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5663  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.78 
 
 
366 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000189692  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5328  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.78 
 
 
366 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00440809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5156  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.78 
 
 
366 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.474948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5172  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.78 
 
 
366 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000341574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5585  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.78 
 
 
366 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000269 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5724  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.78 
 
 
366 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000153579  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0027  GTP-binding protein YchF  26.53 
 
 
366 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1055  GTP-binding protein YchF  27.7 
 
 
354 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0763151  hitchhiker  0.00159487 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5602  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.78 
 
 
366 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0041  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.54 
 
 
365 aa  104  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2002  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.34 
 
 
363 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00393198  normal  0.0943361 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0517  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.69 
 
 
362 aa  105  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1389  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.5 
 
 
366 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.159782 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0154  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.42 
 
 
362 aa  105  2e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3101  GTP-binding protein YchF  34.02 
 
 
357 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1739  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.86 
 
 
366 aa  104  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00258583  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11960  GTP-binding protein YchF  27.76 
 
 
354 aa  105  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.642415  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4838  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.96 
 
 
365 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5333  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.78 
 
 
366 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128538  hitchhiker  0.000000465437 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2367  GTP-binding protein YchF  27.78 
 
 
366 aa  104  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0675  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.64 
 
 
361 aa  104  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.762559  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1318  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.5 
 
 
367 aa  103  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0104464  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5268  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.05 
 
 
366 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0583565  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1537  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.55 
 
 
367 aa  103  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0679708  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1486  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.55 
 
 
367 aa  103  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1417  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.79 
 
 
365 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.685552 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2159  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.77 
 
 
367 aa  103  5e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>