More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0624 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0624  translation-associated GTPase  100 
 
 		 390 aa  798    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1577  translation-associated GTPase  58.97 
 
 		 389 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0297  translation-associated GTPase  56.78 
 
 		 389 aa  451  1e-125  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1725  translation-associated GTPase  57.44 
 
 		 389 aa  450  1e-125  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2621  translation-associated GTPase  55.64 
 
 		 389 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1073  translation-associated GTPase  53.3 
 
 		 394 aa  418  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0175  translation-associated GTPase  53.45 
 
 		 390 aa  420  1e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.278003  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1959  translation-associated GTPase  52.41 
 
 		 395 aa  408  1e-113  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2275  translation-associated GTPase  48.1 
 
 		 393 aa  372  1e-102  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0538  GTPase of unknown function domain protein  47 
 
 		 400 aa  363  3e-99  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000115599  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1450  translation-associated GTPase  47.1 
 
 		 393 aa  359  4e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00412196  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1545  translation-associated GTPase  47.36 
 
 		 392 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0374  translation-associated GTPase  47.99 
 
 		 392 aa  355  1e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376171  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2814  translation-associated GTPase  45.55 
 
 		 392 aa  355  1e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0294234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1970  GTPase of unknown function domain protein  47.21 
 
 		 392 aa  351  1e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0647  GTPase of unknown function domain protein  45.94 
 
 		 392 aa  351  1e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.36601  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0779  translation-associated GTPase  45.06 
 
 		 395 aa  350  3e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1534  translation-associated GTPase  46.29 
 
 		 398 aa  350  3e-95  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000432045 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0715  translation-associated GTPase  47.49 
 
 		 399 aa  347  2e-94  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1800  GTPase of unknown function  45.36 
 
 		 401 aa  346  5e-94  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.016533  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0462  translation-associated GTPase  46.98 
 
 		 392 aa  345  7e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0445  translation-associated GTPase  47.36 
 
 		 392 aa  344  2e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192639  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0069  translation-associated GTPase  46.12 
 
 		 400 aa  343  2.9999999999999997e-93  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000183308  normal  0.0114224 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0065  translation-associated GTPase  45 
 
 		 419 aa  324  2e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1806  translation-associated GTPase  41.5 
 
 		 401 aa  293  2e-78  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.732548 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1662  translation-associated GTPase  43.21 
 
 		 401 aa  293  5e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1616  translation-associated GTPase  44.97 
 
 		 401 aa  292  7e-78  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0533  translation-associated GTPase  42.71 
 
 		 401 aa  286  5.999999999999999e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.626339  normal  0.0197443 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1334  translation-associated GTPase  39.25 
 
 		 395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.570526  normal  0.888182 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2999  GTPase of unknown function domain protein  38.35 
 
 		 399 aa  267  2.9999999999999995e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0853  GTPase of unknown function domain protein  38.06 
 
 		 399 aa  262  6.999999999999999e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1465  translation-associated GTPase  37.66 
 
 		 400 aa  256  6e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0128  translation-associated GTPase  38.1 
 
 		 395 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737053  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0980  translation-associated GTPase  34.66 
 
 		 403 aa  252  7e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.287275 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35157  predicted protein  32.04 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00692  GTP-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_1G13540)  31.88 
 
 		 412 aa  173  5.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3131  predicted protein  31.62 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668518  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02583  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.7 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000898424  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2482  GTP-binding protein YchF  30.65 
 
 		 365 aa  106  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0442  GTP-binding protein YchF  35.59 
 
 		 366 aa  106  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.637193  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2022  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.78 
 
 		 363 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0977  GTP-binding protein YchF  35.12 
 
 		 358 aa  105  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.245774  hitchhiker  0.00114943 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20210  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.61 
 
 		 361 aa  104  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.640353  normal  0.191287 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2845  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  40.61 
 
 		 364 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000149199  hitchhiker  0.000000000000211408 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0206  GTP-binding protein YchF  27.76 
 
 		 357 aa  103  5e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0109  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.95 
 
 		 365 aa  102  8e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000802684  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1835  GTP-binding protein YchF  34.03 
 
 		 363 aa  102  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000078734  normal  0.600832 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0133  GTP-binding protein YchF  35.06 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3631  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.91 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8269  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0664  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.8 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151468  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5862  GTP-binding protein YchF  36.14 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3733  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.81 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.316822 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26380  GTP-binding protein YchF  35.17 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0845459 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1259  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.6 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.471371  normal  0.0100148 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1046  GTP-binding protein YchF  28.3 
 
 		 365 aa  100  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.929667  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3037  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.96 
 
 		 387 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2571  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.95 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0416  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.42 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.550609  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3392  GTP-binding protein YchF  33.33 
 
 		 359 aa  100  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1055  GTP-binding protein YchF  27.17 
 
 		 354 aa  99.8  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0763151  hitchhiker  0.00159487 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23370  GTP-binding protein YchF  34.98 
 
 		 364 aa  99.8  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000155952  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01244  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.03 
 
 		 363 aa  99.8  8e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2193  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.72 
 
 		 369 aa  99.8  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7891  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2708  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.88 
 
 		 364 aa  99.4  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0530  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.94 
 
 		 363 aa  99.4  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0041  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.14 
 
 		 365 aa  99  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1095  GTP-binding protein YchF  36.6 
 
 		 363 aa  99.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0537245  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0496  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.64 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1033  GTP-binding protein YchF  29.32 
 
 		 357 aa  99  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3611  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.76 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1234  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.05 
 
 		 363 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.909233  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2871  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  38.12 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3030  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.35 
 
 		 363 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2581  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.64 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3101  GTP-binding protein YchF  36.97 
 
 		 357 aa  99  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0007  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.42 
 
 		 371 aa  99  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0312393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0524  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.64 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1080  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.08 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3090  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.35 
 
 		 363 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4365  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  38.99 
 
 		 359 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3096  GTP-binding protein YchF  34.19 
 
 		 367 aa  98.6  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156001 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1105  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  39.26 
 
 		 361 aa  98.6  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.692178 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0946  GTP-binding protein YchF  33.2 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1734  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.49 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0584836  normal  0.0100242 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0736  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.57 
 
 		 359 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.217905  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0857  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.51 
 
 		 358 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0266679  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0429  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.76 
 
 		 364 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0453  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.76 
 
 		 364 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0338644 
 
 
-
 
NC_002978  WD0442  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.77 
 
 		 364 aa  97.8  3e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.392269  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3140  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.18 
 
 		 364 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.369877 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0519  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  38.12 
 
 		 364 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0952  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  38.12 
 
 		 364 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3587  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  38.12 
 
 		 364 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3596  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  38.12 
 
 		 364 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3193  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.44 
 
 		 363 aa  97.8  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.36162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1923  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  38.12 
 
 		 364 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.264442  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0657  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  38.12 
 
 		 364 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3569  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  38.12 
 
 		 364 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4635  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.91 
 
 		 363 aa  97.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>