More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1095 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1095  GTP-binding protein YchF  100 
 
 
363 aa  722    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0537245  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8476  GTP-binding protein YchF  81.04 
 
 
362 aa  598  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775953  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0133  GTP-binding protein YchF  80.22 
 
 
361 aa  580  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3062  GTP-binding protein YchF  80.49 
 
 
362 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0473  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  78.3 
 
 
364 aa  569  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8269  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  77.41 
 
 
357 aa  560  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31400  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  74.73 
 
 
360 aa  532  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.292075 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0748  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  72.73 
 
 
369 aa  527  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0946  GTP-binding protein YchF  72.73 
 
 
361 aa  525  1e-148  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26380  GTP-binding protein YchF  73 
 
 
361 aa  525  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0845459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4160  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  73.83 
 
 
361 aa  526  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000134834 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1861  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  72.75 
 
 
373 aa  525  1e-148  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.924801 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3781  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  74.38 
 
 
361 aa  523  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1080  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  73.35 
 
 
359 aa  521  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22930  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  69.81 
 
 
361 aa  510  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5521  GTP-binding protein YchF  72.38 
 
 
358 aa  509  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.633913  normal  0.842427 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0736  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  73.28 
 
 
359 aa  510  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.217905  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1033  GTP-binding protein YchF  75.21 
 
 
357 aa  509  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0857  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  73 
 
 
358 aa  508  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0266679  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3871  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  73 
 
 
358 aa  503  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.479028  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2831  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  69.15 
 
 
368 aa  500  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4625  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  73.55 
 
 
360 aa  498  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1124  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  71.35 
 
 
361 aa  496  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.356013 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2546  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  69.42 
 
 
363 aa  494  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000002151 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2082  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  71.9 
 
 
360 aa  496  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330246  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4365  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  72.18 
 
 
359 aa  496  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20210  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  70.8 
 
 
361 aa  493  9.999999999999999e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.640353  normal  0.191287 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3392  GTP-binding protein YchF  69.7 
 
 
359 aa  491  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4333  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  71.67 
 
 
376 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.567593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4102  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  71.75 
 
 
376 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0977  GTP-binding protein YchF  71.15 
 
 
358 aa  492  9.999999999999999e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.245774  hitchhiker  0.00114943 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1105  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  67.77 
 
 
361 aa  491  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.692178 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4178  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  71.75 
 
 
376 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40111  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3101  GTP-binding protein YchF  69.15 
 
 
357 aa  491  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0648  GTP-binding protein YchF  63.46 
 
 
362 aa  473  1e-132  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.379901 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16190  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  68.82 
 
 
354 aa  468  1.0000000000000001e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.938895  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11134  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  71.07 
 
 
357 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0667  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  63.46 
 
 
364 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.416643  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0186  GTP-binding protein YchF  58.97 
 
 
354 aa  412  1e-114  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11960  GTP-binding protein YchF  59.24 
 
 
354 aa  402  1e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.642415  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1055  GTP-binding protein YchF  57.92 
 
 
354 aa  394  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0763151  hitchhiker  0.00159487 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21870  GTP-binding protein YchF  56.64 
 
 
354 aa  392  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0475417 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3547  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  53.89 
 
 
366 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0530  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  54.35 
 
 
363 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3418  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  52.69 
 
 
366 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000016062  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3618  GTP-binding protein YchF  55.16 
 
 
364 aa  383  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2928  GTP-binding protein YchF  55.16 
 
 
364 aa  383  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.79075  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0887  GTP-binding protein YchF  54.52 
 
 
364 aa  381  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0231852  normal  0.589868 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0390  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  54.89 
 
 
363 aa  380  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.997224  normal  0.0213751 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3166  putative GTP-binding protein  54.77 
 
 
364 aa  379  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563466 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0675  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  53.26 
 
 
361 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.762559  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2159  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  52.72 
 
 
367 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470887  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2368  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  52.72 
 
 
363 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2931  GTP-binding protein YchF  53.35 
 
 
366 aa  375  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4015  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  51.47 
 
 
366 aa  375  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.362655  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0041  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  52.45 
 
 
365 aa  377  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1534  GTP-binding protein YchF  54.08 
 
 
364 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.452605 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3748  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  54.62 
 
 
367 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23370  GTP-binding protein YchF  55.16 
 
 
364 aa  375  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000155952  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1574  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  54.81 
 
 
365 aa  377  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0986  GTP-binding protein YchF  52.88 
 
 
363 aa  375  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1647  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  54.2 
 
 
366 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.429909  normal  0.918011 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3096  GTP-binding protein YchF  54.35 
 
 
367 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.156001 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0072  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  52.57 
 
 
367 aa  372  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0271  GTP-binding protein YchF  52.88 
 
 
364 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198016 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5626  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  51.21 
 
 
366 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000871672  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl660  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  51.91 
 
 
364 aa  374  1e-102  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2022  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  52.46 
 
 
363 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0411  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  51.88 
 
 
365 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00200515  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1204  GTP-binding protein YchF  57.29 
 
 
372 aa  372  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.590839  normal  0.981589 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2000  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  52.19 
 
 
364 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0445  GTP-binding protein YchF  52.94 
 
 
373 aa  372  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0330999  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0286  GTP-binding protein YchF  54.25 
 
 
363 aa  371  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.79515 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0027  GTP-binding protein YchF  52.53 
 
 
366 aa  373  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0422  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  51.88 
 
 
365 aa  374  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0242427  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2043  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  52.57 
 
 
363 aa  371  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0348  GTP-binding protein YchF  54.16 
 
 
364 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.214484 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5663  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  50.94 
 
 
366 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000189692  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0006  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  50.93 
 
 
371 aa  369  1e-101  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5328  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  50.94 
 
 
366 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00440809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5156  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  50.94 
 
 
366 aa  371  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.474948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5172  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  50.94 
 
 
366 aa  371  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000341574  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2707  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  51.89 
 
 
363 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2579  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  51.62 
 
 
363 aa  369  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0946  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  52.57 
 
 
367 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5724  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  50.94 
 
 
366 aa  371  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000153579  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0592  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  52.99 
 
 
367 aa  369  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.269932  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0805  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  52.72 
 
 
364 aa  370  1e-101  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0155  GTP-binding protein YchF  51.89 
 
 
364 aa  369  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.611358  normal  0.940592 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5333  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  50.94 
 
 
366 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128538  hitchhiker  0.000000465437 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3193  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  55.04 
 
 
363 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.36162  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5602  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  50.67 
 
 
366 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0442  GTP-binding protein YchF  52.94 
 
 
366 aa  371  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.637193  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5585  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  50.94 
 
 
366 aa  371  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000269 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0234  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  52.83 
 
 
366 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0453052 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0466  GTP-binding protein YchF  53.51 
 
 
364 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0005  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  51.72 
 
 
371 aa  371  1e-101  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3037  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  54.5 
 
 
387 aa  368  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1676  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  53.1 
 
 
364 aa  366  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0252475  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2121  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  52.04 
 
 
366 aa  366  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.328757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>