More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_31400 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_31400  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  100 
 
 		 360 aa  721    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.292075 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0736  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  85.56 
 
 		 359 aa  606  9.999999999999999e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.217905  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4365  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  81.11 
 
 		 359 aa  559  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3392  GTP-binding protein YchF  77.78 
 
 		 359 aa  550  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2082  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  77.78 
 
 		 360 aa  535  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330246  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4102  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  77.87 
 
 		 376 aa  535  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4178  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  77.87 
 
 		 376 aa  535  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4625  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  78.61 
 
 		 360 aa  536  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0473  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  73.97 
 
 		 364 aa  533  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4333  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  77.59 
 
 		 376 aa  532  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.567593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8269  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  71.67 
 
 		 357 aa  528  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2831  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  72.38 
 
 		 368 aa  530  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0133  GTP-binding protein YchF  73.83 
 
 		 361 aa  527  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1095  GTP-binding protein YchF  74.73 
 
 		 363 aa  527  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0537245  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3101  GTP-binding protein YchF  75.56 
 
 		 357 aa  526  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2546  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  72.1 
 
 		 363 aa  523  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000002151 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26380  GTP-binding protein YchF  72.65 
 
 		 361 aa  523  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0845459 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0946  GTP-binding protein YchF  72.1 
 
 		 361 aa  523  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11134  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  77.22 
 
 		 357 aa  518  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3871  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  74.44 
 
 		 358 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.479028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8476  GTP-binding protein YchF  71.35 
 
 		 362 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1124  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  74.31 
 
 		 361 aa  513  1e-144  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.356013 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22930  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  69.72 
 
 		 361 aa  511  1e-144  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1033  GTP-binding protein YchF  73.89 
 
 		 357 aa  512  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5521  GTP-binding protein YchF  73.26 
 
 		 358 aa  509  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.633913  normal  0.842427 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0977  GTP-binding protein YchF  73.06 
 
 		 358 aa  508  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.245774  hitchhiker  0.00114943 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1105  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  70.99 
 
 		 361 aa  508  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.692178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0857  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  73.33 
 
 		 358 aa  503  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0266679  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3781  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  71.27 
 
 		 361 aa  501  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0748  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  70.8 
 
 		 369 aa  502  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3062  GTP-binding protein YchF  71.35 
 
 		 362 aa  503  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16190  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  72.96 
 
 		 354 aa  498  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.938895  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20210  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  71.07 
 
 		 361 aa  498  1e-140  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.640353  normal  0.191287 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4160  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  71.55 
 
 		 361 aa  496  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000134834 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1861  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  68.31 
 
 		 373 aa  496  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.924801 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1080  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  68.61 
 
 		 359 aa  494  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0648  GTP-binding protein YchF  65.56 
 
 		 362 aa  481  1e-135  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.379901 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0667  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  64.74 
 
 		 364 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.416643  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0186  GTP-binding protein YchF  58.45 
 
 		 354 aa  408  1e-113  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11960  GTP-binding protein YchF  58.13 
 
 		 354 aa  397  1e-109  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.642415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3547  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  55.56 
 
 		 366 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1055  GTP-binding protein YchF  57.3 
 
 		 354 aa  391  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0763151  hitchhiker  0.00159487 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2707  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  54.1 
 
 		 363 aa  385  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0422  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  54.22 
 
 		 365 aa  383  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0242427  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0041  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  53.95 
 
 		 365 aa  382  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2579  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  53.83 
 
 		 363 aa  384  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0411  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  54.22 
 
 		 365 aa  383  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00200515  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5333  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  54.5 
 
 		 366 aa  382  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128538  hitchhiker  0.000000465437 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5602  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  54.5 
 
 		 366 aa  382  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5626  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  54.22 
 
 		 366 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000871672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5328  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  54.22 
 
 		 366 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00440809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5156  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  54.22 
 
 		 366 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.474948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5172  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  54.22 
 
 		 366 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000341574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5724  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  54.22 
 
 		 366 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000153579  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4015  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  53.41 
 
 		 366 aa  379  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.362655  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5663  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  54.22 
 
 		 366 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000189692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5585  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  54.22 
 
 		 366 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000269 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2368  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  53.57 
 
 		 363 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0006  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  52.96 
 
 		 371 aa  375  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0517  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  52.89 
 
 		 362 aa  378  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2022  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  53.3 
 
 		 363 aa  375  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0445  GTP-binding protein YchF  53.35 
 
 		 373 aa  375  1e-103  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0330999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0530  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  52.72 
 
 		 363 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3418  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  54.45 
 
 		 366 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000016062  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2159  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  54.57 
 
 		 367 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470887  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1280  GTP-binding protein YchF  54.08 
 
 		 367 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0005  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  53.74 
 
 		 371 aa  376  1e-103  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0027  GTP-binding protein YchF  54.89 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3037  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  55.16 
 
 		 387 aa  371  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1647  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  53.41 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.429909  normal  0.918011 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2931  GTP-binding protein YchF  54.5 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0395  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  52.19 
 
 		 363 aa  372  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186596  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0675  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  53.68 
 
 		 361 aa  372  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.762559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0117  GTPase, translation factor  52.99 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02583  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  52.2 
 
 		 363 aa  374  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000898424  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21870  GTP-binding protein YchF  52.63 
 
 		 354 aa  374  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0475417 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0234  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  52.04 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0453052 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0348  GTP-binding protein YchF  54.22 
 
 		 364 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.214484 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3166  putative GTP-binding protein  54.5 
 
 		 364 aa  370  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563466 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0390  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  55.16 
 
 		 363 aa  370  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.997224  normal  0.0213751 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0887  GTP-binding protein YchF  53.53 
 
 		 364 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0231852  normal  0.589868 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0442  GTP-binding protein YchF  52.59 
 
 		 366 aa  370  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.637193  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2482  GTP-binding protein YchF  51.64 
 
 		 365 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0986  GTP-binding protein YchF  53.02 
 
 		 363 aa  370  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0503  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  51.1 
 
 		 363 aa  369  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0877  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  52.45 
 
 		 364 aa  370  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00007173  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1185  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  53.28 
 
 		 363 aa  365  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3257  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  51.37 
 
 		 363 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720126  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2928  GTP-binding protein YchF  53.64 
 
 		 364 aa  366  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.79075  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0466  GTP-binding protein YchF  54.35 
 
 		 364 aa  365  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0155  GTP-binding protein YchF  53.39 
 
 		 364 aa  366  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.611358  normal  0.940592 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3618  GTP-binding protein YchF  53.64 
 
 		 364 aa  366  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3193  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  54.62 
 
 		 363 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.36162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0286  GTP-binding protein YchF  53.17 
 
 		 363 aa  367  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.79515 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0954  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  53.7 
 
 		 365 aa  366  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0349  GTPase, translation factor  52.57 
 
 		 366 aa  365  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2032  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  52.86 
 
 		 363 aa  364  1e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0554  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  54.82 
 
 		 363 aa  364  1e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.268556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0007  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  52.14 
 
 		 371 aa  364  1e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0312393  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3999  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  53.13 
 
 		 365 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>