More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3062 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3062  GTP-binding protein YchF  100 
 
 
362 aa  727    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8476  GTP-binding protein YchF  83.15 
 
 
362 aa  623  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775953  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1095  GTP-binding protein YchF  80.49 
 
 
363 aa  579  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0537245  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0473  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  76.71 
 
 
364 aa  560  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0133  GTP-binding protein YchF  74.25 
 
 
361 aa  546  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8269  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  72.65 
 
 
357 aa  530  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1861  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  73.37 
 
 
373 aa  521  1e-147  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.924801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4160  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  73.2 
 
 
361 aa  512  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000134834 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0748  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  69.61 
 
 
369 aa  514  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31400  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  71.35 
 
 
360 aa  508  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.292075 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3781  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  72.65 
 
 
361 aa  509  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26380  GTP-binding protein YchF  69.89 
 
 
361 aa  507  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0845459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0857  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  73.2 
 
 
358 aa  502  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0266679  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5521  GTP-binding protein YchF  71.47 
 
 
358 aa  501  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.633913  normal  0.842427 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22930  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  68.61 
 
 
361 aa  499  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0946  GTP-binding protein YchF  67.68 
 
 
361 aa  499  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3871  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  73.76 
 
 
358 aa  498  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.479028  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1080  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  70.8 
 
 
359 aa  496  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1033  GTP-binding protein YchF  73.48 
 
 
357 aa  493  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2831  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  67.68 
 
 
368 aa  488  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2082  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  70.72 
 
 
360 aa  484  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330246  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2546  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  67.96 
 
 
363 aa  484  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000002151 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3101  GTP-binding protein YchF  68.51 
 
 
357 aa  484  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0736  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  70.72 
 
 
359 aa  483  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.217905  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4625  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  70.44 
 
 
360 aa  482  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1105  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  66.85 
 
 
361 aa  480  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.692178 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4365  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  71.27 
 
 
359 aa  478  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4178  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  69.92 
 
 
376 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40111  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1124  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  69.34 
 
 
361 aa  471  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.356013 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4102  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  69.92 
 
 
376 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4333  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  69.64 
 
 
376 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.567593 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20210  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  66.85 
 
 
361 aa  469  1.0000000000000001e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.640353  normal  0.191287 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0977  GTP-binding protein YchF  67.22 
 
 
358 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.245774  hitchhiker  0.00114943 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3392  GTP-binding protein YchF  67.4 
 
 
359 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16190  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  69.01 
 
 
354 aa  465  9.999999999999999e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.938895  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11134  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  70.72 
 
 
357 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0648  GTP-binding protein YchF  61.43 
 
 
362 aa  455  1e-127  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.379901 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0667  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  60.61 
 
 
364 aa  431  1e-120  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.416643  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0186  GTP-binding protein YchF  56.13 
 
 
354 aa  399  9.999999999999999e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11960  GTP-binding protein YchF  59.4 
 
 
354 aa  394  1e-109  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.642415  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2931  GTP-binding protein YchF  55.53 
 
 
366 aa  383  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1055  GTP-binding protein YchF  57.77 
 
 
354 aa  384  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0763151  hitchhiker  0.00159487 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2159  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  54.5 
 
 
367 aa  384  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470887  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3547  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  53.49 
 
 
366 aa  381  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1647  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  54.77 
 
 
366 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.429909  normal  0.918011 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0554  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  54.89 
 
 
363 aa  377  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.268556  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0530  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  53.08 
 
 
363 aa  371  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3418  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  52.42 
 
 
366 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000016062  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2368  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  53.26 
 
 
363 aa  373  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3090  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  53.28 
 
 
363 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0027  GTP-binding protein YchF  53.46 
 
 
366 aa  369  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1574  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  54.59 
 
 
365 aa  370  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2771  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  52.69 
 
 
367 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3030  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  53.28 
 
 
363 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3096  GTP-binding protein YchF  55.14 
 
 
367 aa  369  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.156001 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2266  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  53.13 
 
 
367 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4015  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  51.61 
 
 
366 aa  368  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.362655  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0877  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  51.91 
 
 
364 aa  367  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00007173  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1615  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  51.73 
 
 
370 aa  365  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4263  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  54.27 
 
 
363 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109438  normal  0.19312 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3794  GTP-binding protein YchF  53.17 
 
 
363 aa  366  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2000  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  52.03 
 
 
364 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3748  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  53.95 
 
 
367 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21870  GTP-binding protein YchF  52.86 
 
 
354 aa  367  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0475417 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0887  GTP-binding protein YchF  54.03 
 
 
364 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0231852  normal  0.589868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0231  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  52.07 
 
 
363 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.375519 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3035  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  52.57 
 
 
367 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1204  GTP-binding protein YchF  56.99 
 
 
372 aa  365  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.590839  normal  0.981589 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0234  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  52.04 
 
 
366 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0453052 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23370  GTP-binding protein YchF  55.01 
 
 
364 aa  365  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000155952  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3618  GTP-binding protein YchF  54.13 
 
 
364 aa  364  1e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0445  GTP-binding protein YchF  52 
 
 
373 aa  364  1e-99  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0330999  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1534  GTP-binding protein YchF  54.4 
 
 
364 aa  364  1e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.452605 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1280  GTP-binding protein YchF  52.14 
 
 
367 aa  364  1e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2928  GTP-binding protein YchF  54.13 
 
 
364 aa  364  1e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.79075  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2022  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  52.33 
 
 
363 aa  363  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2032  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  53.7 
 
 
363 aa  363  3e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0286  GTP-binding protein YchF  54.22 
 
 
363 aa  363  3e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.79515 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37067  predicted protein  53.51 
 
 
363 aa  363  3e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5602  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  51.08 
 
 
366 aa  363  3e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0411  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  51.08 
 
 
365 aa  362  5.0000000000000005e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00200515  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0422  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  51.08 
 
 
365 aa  362  5.0000000000000005e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0242427  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5626  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  51.08 
 
 
366 aa  362  6e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000871672  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5333  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  51.34 
 
 
366 aa  362  6e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128538  hitchhiker  0.000000465437 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0041  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  50.81 
 
 
365 aa  362  8e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5328  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  50.81 
 
 
366 aa  361  1e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00440809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5156  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  50.81 
 
 
366 aa  361  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.474948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5172  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  50.81 
 
 
366 aa  361  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000341574  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4625  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  52.17 
 
 
363 aa  361  1e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0369347 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1390  GTP-binding protein YchF  52.59 
 
 
367 aa  361  1e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00313988  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5663  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  50.81 
 
 
366 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000189692  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5724  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  50.81 
 
 
366 aa  361  1e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000153579  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5585  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  50.81 
 
 
366 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000269 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2707  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  53.42 
 
 
363 aa  360  2e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0986  GTP-binding protein YchF  52.99 
 
 
363 aa  360  2e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3101  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  53.39 
 
 
365 aa  360  2e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0946  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  51.77 
 
 
367 aa  360  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1389  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  53.01 
 
 
366 aa  360  2e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.159782 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2579  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  53.15 
 
 
363 aa  359  3e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3194  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  51.34 
 
 
367 aa  360  3e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>