More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0128 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0128  translation-associated GTPase  100 
 
 
395 aa  803    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737053  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1334  translation-associated GTPase  78.99 
 
 
395 aa  654    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.570526  normal  0.888182 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1465  translation-associated GTPase  69.95 
 
 
400 aa  580  1e-164  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0853  GTPase of unknown function domain protein  68.94 
 
 
399 aa  557  1e-157  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2999  GTPase of unknown function domain protein  67.42 
 
 
399 aa  554  1e-156  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0779  translation-associated GTPase  46.6 
 
 
395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2275  translation-associated GTPase  44.95 
 
 
393 aa  334  1e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2814  translation-associated GTPase  43.32 
 
 
392 aa  325  8.000000000000001e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0294234  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0647  GTPase of unknown function domain protein  43.83 
 
 
392 aa  320  3e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.36601  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0175  translation-associated GTPase  42.68 
 
 
390 aa  311  1e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.278003  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1800  GTPase of unknown function  40.81 
 
 
401 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.016533  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1970  GTPase of unknown function domain protein  43.32 
 
 
392 aa  310  2.9999999999999997e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0538  GTPase of unknown function domain protein  42.21 
 
 
400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000115599  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0065  translation-associated GTPase  42.11 
 
 
419 aa  306  3e-82  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0445  translation-associated GTPase  38.38 
 
 
392 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192639  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0069  translation-associated GTPase  40.55 
 
 
400 aa  301  2e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000183308  normal  0.0114224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1073  translation-associated GTPase  41.9 
 
 
394 aa  298  8e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1545  translation-associated GTPase  37.88 
 
 
392 aa  297  2e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1450  translation-associated GTPase  38.42 
 
 
393 aa  297  2e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00412196  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0462  translation-associated GTPase  37.88 
 
 
392 aa  297  2e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1959  translation-associated GTPase  39.21 
 
 
395 aa  295  7e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0374  translation-associated GTPase  37.63 
 
 
392 aa  295  7e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376171  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0715  translation-associated GTPase  42.72 
 
 
399 aa  295  9e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1534  translation-associated GTPase  38.48 
 
 
398 aa  289  6e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000432045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1806  translation-associated GTPase  40.51 
 
 
401 aa  289  7e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.732548 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1662  translation-associated GTPase  39.8 
 
 
401 aa  277  3e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1725  translation-associated GTPase  39.85 
 
 
389 aa  271  2e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0533  translation-associated GTPase  38.58 
 
 
401 aa  270  4e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.626339  normal  0.0197443 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1616  translation-associated GTPase  40.51 
 
 
401 aa  267  2e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2621  translation-associated GTPase  36.78 
 
 
389 aa  262  6e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0297  translation-associated GTPase  39.1 
 
 
389 aa  259  8e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0624  translation-associated GTPase  38.1 
 
 
390 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1577  translation-associated GTPase  37.19 
 
 
389 aa  251  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0980  translation-associated GTPase  33.33 
 
 
403 aa  229  6e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.287275 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35157  predicted protein  35.08 
 
 
413 aa  197  4.0000000000000005e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00692  GTP-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_1G13540)  33.85 
 
 
412 aa  182  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0048  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.95 
 
 
367 aa  118  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3131  predicted protein  34.53 
 
 
271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668518  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2266  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.5 
 
 
367 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0729  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.97 
 
 
363 aa  114  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.195825 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0700  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.3 
 
 
368 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1353  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.26 
 
 
363 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0280261  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1981  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.26 
 
 
363 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.262835  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1917  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.26 
 
 
363 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1923  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.26 
 
 
363 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1537  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.26 
 
 
363 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0518912 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0530  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.83 
 
 
363 aa  113  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2159  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.44 
 
 
367 aa  112  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470887  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0717  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.7 
 
 
363 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000164209  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4159  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.89 
 
 
365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.471291  normal  0.369246 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04539  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.71 
 
 
363 aa  111  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.910533  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0390  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.63 
 
 
363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.997224  normal  0.0213751 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1055  GTP-binding protein YchF  30.46 
 
 
354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0763151  hitchhiker  0.00159487 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0295  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.82 
 
 
356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3794  GTP-binding protein YchF  29.55 
 
 
363 aa  110  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3999  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.63 
 
 
365 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3030  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.17 
 
 
363 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3257  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.74 
 
 
363 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720126  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3090  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.17 
 
 
363 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1574  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.75 
 
 
365 aa  109  9.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2115  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.89 
 
 
363 aa  109  9.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000126801  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1185  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.34 
 
 
363 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3435  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.47 
 
 
363 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000360155  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1110  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.47 
 
 
363 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000114321  hitchhiker  0.00000000131179 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3299  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.47 
 
 
363 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000459769  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4776  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.02 
 
 
366 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117268  hitchhiker  0.000704522 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2121  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.95 
 
 
363 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0490059  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0416  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.09 
 
 
363 aa  109  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.550609  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1982  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.19 
 
 
363 aa  109  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0132051 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3194  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.53 
 
 
367 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1417  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.65 
 
 
365 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.685552 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1008  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.77 
 
 
363 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000208433  normal  0.179939 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1073  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.77 
 
 
363 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000596539  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1012  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.77 
 
 
363 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00042531  normal  0.0638456 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01178  translation-associated GTPase  28.53 
 
 
363 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01188  hypothetical protein  28.53 
 
 
363 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01244  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.79 
 
 
363 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0664  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.99 
 
 
364 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151468  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0442  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.58 
 
 
364 aa  107  4e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.392269  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0517  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.46 
 
 
362 aa  107  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1579  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.27 
 
 
360 aa  107  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2414  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.91 
 
 
363 aa  107  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2444  GTP-binding protein YchF  28.53 
 
 
363 aa  107  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0781916  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1769  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.63 
 
 
365 aa  107  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1308  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.53 
 
 
363 aa  107  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.253077  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2707  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.22 
 
 
363 aa  107  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1367  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.53 
 
 
363 aa  107  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.37474  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1939  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.53 
 
 
363 aa  107  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.256808  normal  0.0918473 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1684  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.53 
 
 
363 aa  107  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000467912  normal  0.464774 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2063  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.82 
 
 
363 aa  107  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1350  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.53 
 
 
363 aa  107  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0630481  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2423  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.53 
 
 
363 aa  107  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0847638 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13271  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.5 
 
 
363 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0746  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.34 
 
 
363 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15861  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.09 
 
 
363 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.100082  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3748  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.74 
 
 
367 aa  106  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4838  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.1 
 
 
365 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02583  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.8 
 
 
363 aa  106  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000898424  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3392  GTP-binding protein YchF  33.21 
 
 
359 aa  106  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2579  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.22 
 
 
363 aa  106  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>