More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_3131 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_3131  predicted protein  100 
 
 
271 aa  559  1e-158  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668518  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35157  predicted protein  34.69 
 
 
413 aa  162  6e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00692  GTP-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_1G13540)  36.63 
 
 
412 aa  159  6e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0065  translation-associated GTPase  34.64 
 
 
419 aa  139  4.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0374  translation-associated GTPase  33.33 
 
 
392 aa  135  8e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376171  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2275  translation-associated GTPase  35.88 
 
 
393 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1073  translation-associated GTPase  33.71 
 
 
394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0175  translation-associated GTPase  36.12 
 
 
390 aa  133  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.278003  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1800  GTPase of unknown function  34.17 
 
 
401 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.016533  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1545  translation-associated GTPase  32.71 
 
 
392 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1450  translation-associated GTPase  32.97 
 
 
393 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00412196  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0647  GTPase of unknown function domain protein  34.17 
 
 
392 aa  129  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.36601  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1959  translation-associated GTPase  33.33 
 
 
395 aa  129  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1970  GTPase of unknown function domain protein  34.3 
 
 
392 aa  129  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2999  GTPase of unknown function domain protein  33.58 
 
 
399 aa  128  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0715  translation-associated GTPase  33.81 
 
 
399 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0462  translation-associated GTPase  32.35 
 
 
392 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0445  translation-associated GTPase  32.84 
 
 
392 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192639  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0779  translation-associated GTPase  34.1 
 
 
395 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0297  translation-associated GTPase  34.24 
 
 
389 aa  126  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0069  translation-associated GTPase  31.05 
 
 
400 aa  125  9e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000183308  normal  0.0114224 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1616  translation-associated GTPase  32.49 
 
 
401 aa  124  1e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1662  translation-associated GTPase  34.48 
 
 
401 aa  124  1e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0624  translation-associated GTPase  31.62 
 
 
390 aa  124  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1334  translation-associated GTPase  33.33 
 
 
395 aa  124  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.570526  normal  0.888182 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2814  translation-associated GTPase  37.85 
 
 
392 aa  124  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0294234  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0853  GTPase of unknown function domain protein  33.82 
 
 
399 aa  123  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1725  translation-associated GTPase  34.22 
 
 
389 aa  122  6e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1465  translation-associated GTPase  34.17 
 
 
400 aa  122  9e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1577  translation-associated GTPase  31.75 
 
 
389 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0533  translation-associated GTPase  32.16 
 
 
401 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.626339  normal  0.0197443 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2621  translation-associated GTPase  34.11 
 
 
389 aa  118  9e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0128  translation-associated GTPase  34.53 
 
 
395 aa  115  7.999999999999999e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737053  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1806  translation-associated GTPase  33.33 
 
 
401 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.732548 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0538  GTPase of unknown function domain protein  32.03 
 
 
400 aa  113  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000115599  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1534  translation-associated GTPase  31.7 
 
 
398 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000432045 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0980  translation-associated GTPase  29.3 
 
 
403 aa  92.4  6e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.287275 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2931  GTP-binding protein YchF  31.89 
 
 
366 aa  79  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0109  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.61 
 
 
365 aa  78.2  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000802684  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2121  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.64 
 
 
365 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1835  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.64 
 
 
365 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.259258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1475  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.89 
 
 
364 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0116591 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2765  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.89 
 
 
364 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1046  GTP-binding protein YchF  31.33 
 
 
365 aa  74.3  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.929667  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0445  GTP-binding protein YchF  31.89 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0330999  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2482  GTP-binding protein YchF  31.33 
 
 
365 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0349  GTPase, translation factor  32.73 
 
 
366 aa  74.3  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0877  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.93 
 
 
364 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00007173  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0231  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.11 
 
 
363 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.375519 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4937  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.05 
 
 
366 aa  72.8  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000108566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8269  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30 
 
 
357 aa  72.4  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1095  GTP-binding protein YchF  30.48 
 
 
363 aa  72  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0537245  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0117  GTPase, translation factor  30.39 
 
 
367 aa  72  0.000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2022  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.53 
 
 
363 aa  72  0.000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2845  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.98 
 
 
364 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000149199  hitchhiker  0.000000000000211408 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0823  GTP-binding protein YchF  30.27 
 
 
369 aa  72  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0664  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.84 
 
 
364 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151468  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0954  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.33 
 
 
365 aa  71.2  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1204  GTP-binding protein YchF  30.16 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.590839  normal  0.981589 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1734  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.05 
 
 
363 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0584836  normal  0.0100242 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3679  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.93 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0104752  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1574  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.85 
 
 
365 aa  70.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4838  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30 
 
 
365 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1390  GTP-binding protein YchF  29.7 
 
 
367 aa  70.5  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00313988  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4159  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.43 
 
 
365 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.471291  normal  0.369246 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3999  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30 
 
 
365 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0590  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.73 
 
 
365 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000196131  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1634  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.13 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0594912  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1417  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.26 
 
 
365 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.685552 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2115  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.41 
 
 
363 aa  69.7  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000126801  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2204  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.69 
 
 
363 aa  69.3  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000173002  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0271  GTP-binding protein YchF  28.25 
 
 
364 aa  69.7  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198016 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4281  GTP-binding protein YchF  32.32 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1739  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.2 
 
 
366 aa  69.7  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00258583  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0041  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.43 
 
 
365 aa  69.3  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1629  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36 
 
 
367 aa  69.3  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.866476  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0572  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.16 
 
 
363 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1002  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.9 
 
 
367 aa  68.9  0.00000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3194  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.8 
 
 
367 aa  68.9  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0675  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.6 
 
 
361 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.762559  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0656  GTP-binding protein YchF  29.26 
 
 
370 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_004310  BR1537  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.2 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0679708  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2266  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.72 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1486  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.2 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1579  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.94 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4776  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.93 
 
 
366 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117268  hitchhiker  0.000704522 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2000  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.57 
 
 
364 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0977  GTP-binding protein YchF  36.3 
 
 
358 aa  68.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.245774  hitchhiker  0.00114943 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3062  GTP-binding protein YchF  33.73 
 
 
362 aa  68.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8476  GTP-binding protein YchF  30.65 
 
 
362 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775953  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0005  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.4 
 
 
371 aa  68.2  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0416  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30 
 
 
363 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.550609  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0334  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.15 
 
 
365 aa  68.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3794  GTP-binding protein YchF  29.84 
 
 
363 aa  67.8  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1234  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.41 
 
 
363 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.909233  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13131  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.1 
 
 
363 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1796  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30 
 
 
363 aa  67.4  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0100064  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1124  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.53 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.356013 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1530  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.94 
 
 
357 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0347  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.13 
 
 
363 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>