More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0647 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1970  GTPase of unknown function domain protein  89.03 
 
 		 392 aa  692    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0647  GTPase of unknown function domain protein  100 
 
 		 392 aa  788    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.36601  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2814  translation-associated GTPase  73.72 
 
 		 392 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0294234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0779  translation-associated GTPase  70.92 
 
 		 395 aa  591  1e-168  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2275  translation-associated GTPase  69.82 
 
 		 393 aa  571  1.0000000000000001e-162  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1959  translation-associated GTPase  53.94 
 
 		 395 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1073  translation-associated GTPase  49.74 
 
 		 394 aa  410  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0175  translation-associated GTPase  49.74 
 
 		 390 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.278003  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0538  GTPase of unknown function domain protein  46.73 
 
 		 400 aa  389  1e-107  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000115599  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1577  translation-associated GTPase  48.48 
 
 		 389 aa  387  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2621  translation-associated GTPase  47.37 
 
 		 389 aa  365  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1725  translation-associated GTPase  46.68 
 
 		 389 aa  364  1e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0297  translation-associated GTPase  46.35 
 
 		 389 aa  364  1e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1534  translation-associated GTPase  43.51 
 
 		 398 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000432045 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0624  translation-associated GTPase  45.94 
 
 		 390 aa  351  1e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0069  translation-associated GTPase  44.44 
 
 		 400 aa  349  5e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000183308  normal  0.0114224 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1450  translation-associated GTPase  44.44 
 
 		 393 aa  348  7e-95  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00412196  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1800  GTPase of unknown function  43.32 
 
 		 401 aa  347  3e-94  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.016533  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1334  translation-associated GTPase  46 
 
 		 395 aa  345  5e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.570526  normal  0.888182 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0065  translation-associated GTPase  44.84 
 
 		 419 aa  340  2e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2999  GTPase of unknown function domain protein  44.95 
 
 		 399 aa  341  2e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0462  translation-associated GTPase  43.58 
 
 		 392 aa  339  4e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0445  translation-associated GTPase  43.32 
 
 		 392 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192639  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1465  translation-associated GTPase  45.2 
 
 		 400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1545  translation-associated GTPase  42.57 
 
 		 392 aa  335  5.999999999999999e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0374  translation-associated GTPase  42.82 
 
 		 392 aa  335  7e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376171  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1806  translation-associated GTPase  42.17 
 
 		 401 aa  333  2e-90  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.732548 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0853  GTPase of unknown function domain protein  44.95 
 
 		 399 aa  332  7.000000000000001e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1662  translation-associated GTPase  46.46 
 
 		 401 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0533  translation-associated GTPase  44.19 
 
 		 401 aa  324  2e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.626339  normal  0.0197443 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0128  translation-associated GTPase  43.83 
 
 		 395 aa  320  3e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737053  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1616  translation-associated GTPase  44.67 
 
 		 401 aa  316  4e-85  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0715  translation-associated GTPase  43.47 
 
 		 399 aa  312  6.999999999999999e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0980  translation-associated GTPase  36.57 
 
 		 403 aa  245  9e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.287275 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35157  predicted protein  35.53 
 
 		 413 aa  209  1e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00692  GTP-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_1G13540)  34.01 
 
 		 412 aa  202  8e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3131  predicted protein  34.17 
 
 		 271 aa  129  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668518  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0664  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.54 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151468  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2367  GTP-binding protein YchF  26.87 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2022  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.35 
 
 		 363 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2115  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.33 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000126801  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2765  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.8 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1475  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.8 
 
 		 364 aa  100  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0116591 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2204  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.57 
 
 		 363 aa  99.4  9e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000173002  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0445  GTP-binding protein YchF  40.48 
 
 		 373 aa  98.2  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0330999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2845  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.2 
 
 		 364 aa  97.4  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000149199  hitchhiker  0.000000000000211408 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0186  GTP-binding protein YchF  28.43 
 
 		 354 aa  97.8  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2592  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.4 
 
 		 364 aa  97.1  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000145967  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4937  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.61 
 
 		 366 aa  96.3  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000108566  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2931  GTP-binding protein YchF  33.62 
 
 		 366 aa  95.5  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2000  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.23 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0877  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.1 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00007173  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2121  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.07 
 
 		 363 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0490059  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3679  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.35 
 
 		 364 aa  94.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0104752  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0109  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32 
 
 		 365 aa  94.7  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000802684  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1046  GTP-binding protein YchF  29.61 
 
 		 365 aa  94  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.929667  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1605  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.29 
 
 		 367 aa  94  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0458572  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0027  GTP-binding protein YchF  36.32 
 
 		 366 aa  93.6  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23370  GTP-binding protein YchF  40 
 
 		 364 aa  93.6  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000155952  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5862  GTP-binding protein YchF  39.02 
 
 		 359 aa  94  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2482  GTP-binding protein YchF  28.18 
 
 		 365 aa  93.6  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1835  GTP-binding protein YchF  32.34 
 
 		 363 aa  93.6  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000078734  normal  0.600832 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0099  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.13 
 
 		 363 aa  93.6  6e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.76867  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1320  GTP-binding protein YchF  26.61 
 
 		 364 aa  93.2  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0466  GTP-binding protein YchF  27.88 
 
 		 364 aa  93.6  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2121  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.37 
 
 		 365 aa  93.6  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1835  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.37 
 
 		 365 aa  93.2  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.259258  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0823  GTP-binding protein YchF  32.61 
 
 		 369 aa  92.8  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1574  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.81 
 
 		 365 aa  92.8  9e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2032  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.92 
 
 		 363 aa  92.4  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0977  GTP-binding protein YchF  28.95 
 
 		 358 aa  92.4  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.245774  hitchhiker  0.00114943 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0041  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.7 
 
 		 365 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2414  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.34 
 
 		 363 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0005  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.9 
 
 		 371 aa  91.3  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1204  GTP-binding protein YchF  37.04 
 
 		 372 aa  91.3  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.590839  normal  0.981589 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1849  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.72 
 
 		 363 aa  90.9  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.476561  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2219  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.04 
 
 		 365 aa  91.3  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0007  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.75 
 
 		 371 aa  90.9  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0312393  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1615  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.79 
 
 		 370 aa  90.9  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3363  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.84 
 
 		 363 aa  90.9  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1982  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.34 
 
 		 363 aa  90.9  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0132051 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1917  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.1 
 
 		 363 aa  90.5  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1390  GTP-binding protein YchF  26.49 
 
 		 367 aa  90.5  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00313988  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1171  GTP-binding protein YchF  27.51 
 
 		 364 aa  90.1  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1353  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.1 
 
 		 363 aa  90.5  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0280261  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1981  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.1 
 
 		 363 aa  90.5  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.262835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1537  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.1 
 
 		 363 aa  90.5  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0518912 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1923  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.1 
 
 		 363 aa  90.5  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3096  GTP-binding protein YchF  36.2 
 
 		 367 aa  90.5  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156001 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31400  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.14 
 
 		 360 aa  90.5  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.292075 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5626  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.75 
 
 		 366 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000871672  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5156  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.75 
 
 		 366 aa  90.1  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.474948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5172  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.75 
 
 		 366 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000341574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5724  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.75 
 
 		 366 aa  90.1  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000153579  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0554  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.64 
 
 		 363 aa  90.1  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.268556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0154  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  38.12 
 
 		 362 aa  90.1  6e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5663  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.75 
 
 		 366 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000189692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5585  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.75 
 
 		 366 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000269 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5268  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.75 
 
 		 366 aa  90.1  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0583565  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0349  GTPase, translation factor  25.59 
 
 		 366 aa  90.1  6e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>