More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1616 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1616  translation-associated GTPase  100 
 
 		 401 aa  810    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1806  translation-associated GTPase  76.06 
 
 		 401 aa  664    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.732548 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0533  translation-associated GTPase  84.29 
 
 		 401 aa  688    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.626339  normal  0.0197443 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1662  translation-associated GTPase  79.55 
 
 		 401 aa  655    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0065  translation-associated GTPase  59.2 
 
 		 419 aa  490  1e-137  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0715  translation-associated GTPase  55.42 
 
 		 399 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0069  translation-associated GTPase  49.87 
 
 		 400 aa  395  1e-109  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000183308  normal  0.0114224 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1800  GTPase of unknown function  48.87 
 
 		 401 aa  392  1e-108  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.016533  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0175  translation-associated GTPase  52.28 
 
 		 390 aa  388  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.278003  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1073  translation-associated GTPase  51.65 
 
 		 394 aa  387  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0538  GTPase of unknown function domain protein  49.25 
 
 		 400 aa  367  1e-100  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000115599  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1450  translation-associated GTPase  45.82 
 
 		 393 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00412196  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1534  translation-associated GTPase  42.93 
 
 		 398 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000432045 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1545  translation-associated GTPase  46.72 
 
 		 392 aa  353  2e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0374  translation-associated GTPase  46.97 
 
 		 392 aa  353  2e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376171  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0462  translation-associated GTPase  46.19 
 
 		 392 aa  352  7e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0445  translation-associated GTPase  46.72 
 
 		 392 aa  351  1e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192639  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1959  translation-associated GTPase  45.75 
 
 		 395 aa  342  9e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2275  translation-associated GTPase  43.94 
 
 		 393 aa  342  9e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2814  translation-associated GTPase  45.2 
 
 		 392 aa  338  8e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0294234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0647  GTPase of unknown function domain protein  44.67 
 
 		 392 aa  338  8e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.36601  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1970  GTPase of unknown function domain protein  44.42 
 
 		 392 aa  337  2.9999999999999997e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0779  translation-associated GTPase  44.3 
 
 		 395 aa  332  8e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1577  translation-associated GTPase  45.45 
 
 		 389 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1725  translation-associated GTPase  44.36 
 
 		 389 aa  312  6.999999999999999e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0624  translation-associated GTPase  44.97 
 
 		 390 aa  307  3e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0297  translation-associated GTPase  43.94 
 
 		 389 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2999  GTPase of unknown function domain protein  40.1 
 
 		 399 aa  299  6e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2621  translation-associated GTPase  42.32 
 
 		 389 aa  297  2e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0853  GTPase of unknown function domain protein  40.39 
 
 		 399 aa  294  2e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1334  translation-associated GTPase  39.85 
 
 		 395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.570526  normal  0.888182 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1465  translation-associated GTPase  38.29 
 
 		 400 aa  280  3e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0128  translation-associated GTPase  40.51 
 
 		 395 aa  280  3e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737053  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0980  translation-associated GTPase  38.6 
 
 		 403 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.287275 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35157  predicted protein  34.83 
 
 		 413 aa  206  5e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00692  GTP-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_1G13540)  35.71 
 
 		 412 aa  203  4e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3131  predicted protein  32.49 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668518  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3794  GTP-binding protein YchF  32.95 
 
 		 363 aa  106  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1796  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.2 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0100064  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0572  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.82 
 
 		 363 aa  103  7e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4625  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.2 
 
 		 363 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0369347 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0450  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.22 
 
 		 363 aa  100  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0274175  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0416  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.72 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.550609  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1634  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.2 
 
 		 362 aa  97.1  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0594912  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2845  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.2 
 
 		 364 aa  96.7  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000149199  hitchhiker  0.000000000000211408 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1734  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.5 
 
 		 363 aa  96.7  7e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0584836  normal  0.0100242 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1835  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.95 
 
 		 365 aa  96.3  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.259258  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3090  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.7 
 
 		 363 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3030  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.7 
 
 		 363 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2121  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.95 
 
 		 365 aa  96.3  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13021  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.18 
 
 		 363 aa  96.3  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.98106  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37067  predicted protein  33.09 
 
 		 363 aa  95.9  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2482  GTP-binding protein YchF  33.33 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2022  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.48 
 
 		 363 aa  95.5  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1579  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  38.36 
 
 		 360 aa  95.5  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0347  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.48 
 
 		 363 aa  95.1  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127573  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1234  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.31 
 
 		 363 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.909233  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1530  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  38.61 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0466  GTP-binding protein YchF  29.93 
 
 		 364 aa  95.1  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0877  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.66 
 
 		 364 aa  94.4  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00007173  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1390  GTP-binding protein YchF  33.62 
 
 		 367 aa  94.4  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00313988  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2002  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.9 
 
 		 363 aa  94.4  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00393198  normal  0.0943361 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0664  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  38.22 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151468  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0231  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.42 
 
 		 363 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.375519 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3166  putative GTP-binding protein  31 
 
 		 364 aa  92.4  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563466 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0823  GTP-binding protein YchF  30.17 
 
 		 369 aa  92.4  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4635  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.65 
 
 		 363 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4937  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.57 
 
 		 366 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000108566  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4281  GTP-binding protein YchF  29.15 
 
 		 366 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2219  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.84 
 
 		 365 aa  92  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0530  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.02 
 
 		 363 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1475  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.86 
 
 		 364 aa  91.3  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0116591 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3679  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.09 
 
 		 364 aa  91.3  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0104752  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3631  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.76 
 
 		 363 aa  90.9  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0554  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.34 
 
 		 363 aa  90.9  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.268556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0946  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.72 
 
 		 367 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1259  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.27 
 
 		 363 aa  90.9  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.471371  normal  0.0100148 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0286  GTP-binding protein YchF  35.68 
 
 		 363 aa  90.5  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.79515 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2642  GTP-binding protein YchF  31.82 
 
 		 366 aa  90.5  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2765  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.11 
 
 		 364 aa  90.5  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2579  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.36 
 
 		 363 aa  90.1  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2707  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.36 
 
 		 363 aa  89.7  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2931  GTP-binding protein YchF  31.49 
 
 		 366 aa  90.1  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0154  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.43 
 
 		 362 aa  89.7  7e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2193  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.97 
 
 		 369 aa  90.1  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7891  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0349  GTPase, translation factor  30.83 
 
 		 366 aa  90.1  7e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1280  GTP-binding protein YchF  29.74 
 
 		 367 aa  89.7  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1861  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.62 
 
 		 373 aa  89.7  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.924801 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12121  GTP-binding protein  30.67 
 
 		 393 aa  89.7  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.467658 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2000  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.33 
 
 		 364 aa  89  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0305  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.33 
 
 		 368 aa  88.6  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0911742  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1835  GTP-binding protein YchF  35.54 
 
 		 363 aa  88.2  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000078734  normal  0.600832 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0027  GTP-binding protein YchF  32.11 
 
 		 366 aa  88.6  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2115  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.75 
 
 		 363 aa  88.6  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000126801  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  35.37 
 
 		 439 aa  88.2  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3096  GTP-binding protein YchF  30.71 
 
 		 367 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156001 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0805  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.81 
 
 		 364 aa  88.6  2e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1127  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.08 
 
 		 363 aa  88.6  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.660689  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  37.41 
 
 		 427 aa  88.2  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2592  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.9 
 
 		 364 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000145967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>