More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1534 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1534  translation-associated GTPase  100 
 
 		 398 aa  808    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000432045 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1800  GTPase of unknown function  47.5 
 
 		 401 aa  379  1e-104  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.016533  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0065  translation-associated GTPase  46.23 
 
 		 419 aa  375  1e-103  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0175  translation-associated GTPase  48.09 
 
 		 390 aa  377  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.278003  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0069  translation-associated GTPase  47.88 
 
 		 400 aa  373  1e-102  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000183308  normal  0.0114224 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0538  GTPase of unknown function domain protein  46 
 
 		 400 aa  371  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000115599  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0715  translation-associated GTPase  47.37 
 
 		 399 aa  369  1e-101  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1073  translation-associated GTPase  46.95 
 
 		 394 aa  367  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2814  translation-associated GTPase  43.77 
 
 		 392 aa  360  2e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0294234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2275  translation-associated GTPase  43.77 
 
 		 393 aa  357  2.9999999999999997e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1806  translation-associated GTPase  42.42 
 
 		 401 aa  354  2e-96  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.732548 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0647  GTPase of unknown function domain protein  43.51 
 
 		 392 aa  353  4e-96  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.36601  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0779  translation-associated GTPase  42.89 
 
 		 395 aa  351  1e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0624  translation-associated GTPase  46.29 
 
 		 390 aa  350  3e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1545  translation-associated GTPase  45.59 
 
 		 392 aa  347  3e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1725  translation-associated GTPase  46.41 
 
 		 389 aa  346  5e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0374  translation-associated GTPase  45.59 
 
 		 392 aa  343  2e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376171  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0297  translation-associated GTPase  46.29 
 
 		 389 aa  343  2e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0462  translation-associated GTPase  45.59 
 
 		 392 aa  342  8e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1970  GTPase of unknown function domain protein  45.18 
 
 		 392 aa  341  1e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1662  translation-associated GTPase  43.36 
 
 		 401 aa  340  2e-92  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0445  translation-associated GTPase  45.32 
 
 		 392 aa  340  2e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192639  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1959  translation-associated GTPase  43.86 
 
 		 395 aa  340  2e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1577  translation-associated GTPase  45.01 
 
 		 389 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1616  translation-associated GTPase  42.93 
 
 		 401 aa  339  5e-92  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1450  translation-associated GTPase  44.58 
 
 		 393 aa  339  5e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00412196  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0533  translation-associated GTPase  42.17 
 
 		 401 aa  339  5e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.626339  normal  0.0197443 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2621  translation-associated GTPase  43.62 
 
 		 389 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0853  GTPase of unknown function domain protein  40.69 
 
 		 399 aa  324  2e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2999  GTPase of unknown function domain protein  39.9 
 
 		 399 aa  324  2e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1465  translation-associated GTPase  40.39 
 
 		 400 aa  309  5e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1334  translation-associated GTPase  39.65 
 
 		 395 aa  308  6.999999999999999e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.570526  normal  0.888182 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0128  translation-associated GTPase  38.48 
 
 		 395 aa  289  6e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737053  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0980  translation-associated GTPase  37.69 
 
 		 403 aa  266  5.999999999999999e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.287275 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00692  GTP-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_1G13540)  32.13 
 
 		 412 aa  194  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35157  predicted protein  30.89 
 
 		 413 aa  176  5e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3131  predicted protein  31.7 
 
 		 271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668518  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13021  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.54 
 
 		 363 aa  106  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.98106  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1234  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.09 
 
 		 363 aa  103  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.909233  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1835  GTP-binding protein YchF  32 
 
 		 363 aa  103  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000078734  normal  0.600832 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1095  GTP-binding protein YchF  24.47 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0537245  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0072  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.46 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3037  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.36 
 
 		 387 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1634  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.24 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0594912  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2043  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.07 
 
 		 363 aa  100  3e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1605  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.49 
 
 		 367 aa  100  4e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0458572  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0677  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.36 
 
 		 366 aa  100  5e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0805  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.33 
 
 		 364 aa  99.8  9e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0048  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.39 
 
 		 367 aa  99  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0442  GTP-binding protein YchF  33.73 
 
 		 366 aa  98.6  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.637193  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0154  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.18 
 
 		 362 aa  99  1e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13131  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.32 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0099  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.38 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.76867  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0857  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.26 
 
 		 358 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0266679  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0466  GTP-binding protein YchF  26.49 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0101  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.57 
 
 		 362 aa  98.6  2e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.720243  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1615  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.68 
 
 		 370 aa  98.2  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3090  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.8 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2845  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.91 
 
 		 364 aa  98.6  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000149199  hitchhiker  0.000000000000211408 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3193  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.63 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.36162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3030  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.8 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2482  GTP-binding protein YchF  32.03 
 
 		 365 aa  98.6  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37067  predicted protein  26.51 
 
 		 363 aa  98.2  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3101  GTP-binding protein YchF  35.93 
 
 		 357 aa  97.1  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13271  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.2 
 
 		 363 aa  97.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1475  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.67 
 
 		 364 aa  96.7  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0116591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1769  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.27 
 
 		 365 aa  96.7  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0877  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.18 
 
 		 364 aa  96.7  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00007173  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1008  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.37 
 
 		 367 aa  96.3  8e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0186  GTP-binding protein YchF  39.02 
 
 		 354 aa  96.3  8e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2121  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.33 
 
 		 365 aa  96.3  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1835  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.33 
 
 		 365 aa  96.3  8e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.259258  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2931  GTP-binding protein YchF  35.29 
 
 		 366 aa  96.3  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3140  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  40.56 
 
 		 364 aa  96.3  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.369877 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2898  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  40.56 
 
 		 364 aa  95.9  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0656  GTP-binding protein YchF  36.88 
 
 		 370 aa  95.5  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4625  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.62 
 
 		 363 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0369347 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09848  putative ATP/GTP-binding protein  33.33 
 
 		 364 aa  95.9  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0832  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.33 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.596144  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2765  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.4 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0572  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.53 
 
 		 363 aa  95.5  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3392  GTP-binding protein YchF  34.15 
 
 		 359 aa  95.9  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0884  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.1 
 
 		 367 aa  96.3  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2774  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  40.56 
 
 		 363 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.97205 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1055  GTP-binding protein YchF  28.72 
 
 		 354 aa  95.5  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0763151  hitchhiker  0.00159487 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0231  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.65 
 
 		 363 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.375519 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2002  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.73 
 
 		 363 aa  95.5  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00393198  normal  0.0943361 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2032  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.16 
 
 		 363 aa  95.1  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2490  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.33 
 
 		 365 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.071382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0027  GTP-binding protein YchF  35.09 
 
 		 366 aa  95.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2920  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  39.86 
 
 		 364 aa  94.7  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.657058  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3794  GTP-binding protein YchF  27.7 
 
 		 363 aa  95.1  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0937  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.84 
 
 		 367 aa  94.7  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.844815  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1318  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.76 
 
 		 367 aa  95.1  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0104464  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1320  GTP-binding protein YchF  31.08 
 
 		 364 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1124  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.54 
 
 		 361 aa  95.1  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.356013 
 
 
-
 
NC_002978  WD0442  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.47 
 
 		 364 aa  94.4  3e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.392269  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2022  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.94 
 
 		 363 aa  94.7  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1390  GTP-binding protein YchF  27.63 
 
 		 367 aa  94.4  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00313988  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5862  GTP-binding protein YchF  37.93 
 
 		 359 aa  94.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>