More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1959 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1959  translation-associated GTPase  100 
 
 		 395 aa  817    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1073  translation-associated GTPase  68.69 
 
 		 394 aa  584  1e-166  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0175  translation-associated GTPase  59.03 
 
 		 390 aa  484  1e-135  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.278003  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0647  GTPase of unknown function domain protein  53.94 
 
 		 392 aa  445  1.0000000000000001e-124  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.36601  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0779  translation-associated GTPase  51.9 
 
 		 395 aa  437  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1970  GTPase of unknown function domain protein  54.45 
 
 		 392 aa  432  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2275  translation-associated GTPase  50.38 
 
 		 393 aa  431  1e-119  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1577  translation-associated GTPase  52.79 
 
 		 389 aa  423  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2621  translation-associated GTPase  53.55 
 
 		 389 aa  422  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2814  translation-associated GTPase  49.11 
 
 		 392 aa  418  1e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0294234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1725  translation-associated GTPase  52.79 
 
 		 389 aa  421  1e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0297  translation-associated GTPase  52.28 
 
 		 389 aa  409  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0624  translation-associated GTPase  52.41 
 
 		 390 aa  408  1e-113  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1450  translation-associated GTPase  51.39 
 
 		 393 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00412196  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0538  GTPase of unknown function domain protein  48.37 
 
 		 400 aa  396  1e-109  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000115599  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1800  GTPase of unknown function  49.12 
 
 		 401 aa  386  1e-106  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.016533  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0445  translation-associated GTPase  48.74 
 
 		 392 aa  376  1e-103  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192639  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0462  translation-associated GTPase  49.12 
 
 		 392 aa  376  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1545  translation-associated GTPase  48.24 
 
 		 392 aa  373  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0374  translation-associated GTPase  48.49 
 
 		 392 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376171  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0069  translation-associated GTPase  46.85 
 
 		 400 aa  358  9e-98  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000183308  normal  0.0114224 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0715  translation-associated GTPase  47.63 
 
 		 399 aa  348  1e-94  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0065  translation-associated GTPase  46.1 
 
 		 419 aa  340  2e-92  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1534  translation-associated GTPase  43.86 
 
 		 398 aa  340  2e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000432045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1806  translation-associated GTPase  43.25 
 
 		 401 aa  330  3e-89  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.732548 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0533  translation-associated GTPase  44.78 
 
 		 401 aa  325  1e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.626339  normal  0.0197443 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1616  translation-associated GTPase  45.75 
 
 		 401 aa  323  3e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1662  translation-associated GTPase  44.33 
 
 		 401 aa  323  3e-87  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1334  translation-associated GTPase  39.85 
 
 		 395 aa  300  2e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.570526  normal  0.888182 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1465  translation-associated GTPase  39.36 
 
 		 400 aa  300  4e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2999  GTPase of unknown function domain protein  38.4 
 
 		 399 aa  297  2e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0853  GTPase of unknown function domain protein  39.4 
 
 		 399 aa  296  5e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0128  translation-associated GTPase  39.21 
 
 		 395 aa  295  7e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737053  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0980  translation-associated GTPase  41.03 
 
 		 403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.287275 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00692  GTP-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_1G13540)  34.07 
 
 		 412 aa  201  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35157  predicted protein  31.83 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3131  predicted protein  33.33 
 
 		 271 aa  129  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668518  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2193  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.68 
 
 		 369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7891  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2931  GTP-binding protein YchF  33.04 
 
 		 366 aa  107  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2022  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.71 
 
 		 363 aa  107  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0572  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.17 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0109  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  40.62 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000802684  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1318  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.16 
 
 		 367 aa  103  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0104464  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2121  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.66 
 
 		 365 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1835  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.66 
 
 		 365 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.259258  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1739  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.47 
 
 		 366 aa  103  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00258583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0349  GTPase, translation factor  26.86 
 
 		 366 aa  103  4e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl660  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.87 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2579  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.93 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0530  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.54 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0664  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.47 
 
 		 364 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151468  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0675  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.75 
 
 		 361 aa  100  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.762559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1734  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.89 
 
 		 363 aa  100  5e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0584836  normal  0.0100242 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0117  GTPase, translation factor  33.33 
 
 		 367 aa  100  5e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1280  GTP-binding protein YchF  30.3 
 
 		 367 aa  100  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1634  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.82 
 
 		 362 aa  100  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0594912  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2707  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.67 
 
 		 363 aa  99.8  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0677  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.19 
 
 		 366 aa  99.8  7e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0347  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.67 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127573  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1605  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.55 
 
 		 367 aa  99  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0458572  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0007  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.2 
 
 		 371 aa  99.4  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0312393  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2482  GTP-binding protein YchF  31.62 
 
 		 365 aa  98.6  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0416  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.04 
 
 		 363 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.550609  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1796  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.56 
 
 		 363 aa  97.8  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0100064  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2367  GTP-binding protein YchF  30.19 
 
 		 366 aa  97.8  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0884  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.47 
 
 		 367 aa  97.4  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1124  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.67 
 
 		 361 aa  97.4  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.356013 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1008  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.47 
 
 		 367 aa  97.1  5e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0937  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.03 
 
 		 367 aa  97.1  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.844815  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13131  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.67 
 
 		 363 aa  96.7  7e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13271  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.31 
 
 		 363 aa  96.7  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2032  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.69 
 
 		 363 aa  95.9  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2898  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.77 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3101  GTP-binding protein YchF  33.5 
 
 		 357 aa  95.5  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0877  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.56 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00007173  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1389  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.18 
 
 		 366 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.159782 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1615  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.07 
 
 		 370 aa  95.5  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23370  GTP-binding protein YchF  29.3 
 
 		 364 aa  95.9  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000155952  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20210  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.29 
 
 		 361 aa  95.5  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.640353  normal  0.191287 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0656  GTP-binding protein YchF  38.1 
 
 		 370 aa  95.1  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.196254 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1033  GTP-binding protein YchF  32.19 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2845  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.31 
 
 		 364 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000149199  hitchhiker  0.000000000000211408 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0395  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.17 
 
 		 363 aa  95.1  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186596  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1234  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.47 
 
 		 363 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.909233  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0442  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.88 
 
 		 364 aa  94.4  3e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.392269  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2774  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.46 
 
 		 363 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.97205 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1095  GTP-binding protein YchF  37.5 
 
 		 363 aa  94.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0537245  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3037  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.21 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3748  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.92 
 
 		 367 aa  94.7  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4365  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  38.51 
 
 		 359 aa  94.7  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4015  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.54 
 
 		 366 aa  94.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.362655  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0823  GTP-binding protein YchF  27.86 
 
 		 369 aa  94.7  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3507  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.89 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125034  normal  0.0137315 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0450  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.44 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11960  GTP-binding protein YchF  31.89 
 
 		 354 aa  93.6  5e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.642415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26380  GTP-binding protein YchF  38.04 
 
 		 361 aa  93.2  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0845459 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0072  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.47 
 
 		 367 aa  93.6  6e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0805  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.76 
 
 		 364 aa  93.6  6e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3140  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.02 
 
 		 364 aa  93.2  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.369877 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1835  GTP-binding protein YchF  27.59 
 
 		 363 aa  93.6  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000078734  normal  0.600832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>