More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1577 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1577  translation-associated GTPase  100 
 
 		 389 aa  799    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1725  translation-associated GTPase  64.52 
 
 		 389 aa  523  1e-147  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0297  translation-associated GTPase  63.5 
 
 		 389 aa  519  1e-146  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2621  translation-associated GTPase  61.18 
 
 		 389 aa  495  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0624  translation-associated GTPase  58.97 
 
 		 390 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1073  translation-associated GTPase  57.25 
 
 		 394 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0175  translation-associated GTPase  55.87 
 
 		 390 aa  436  1e-121  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.278003  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1959  translation-associated GTPase  52.79 
 
 		 395 aa  423  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0779  translation-associated GTPase  52.51 
 
 		 395 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2275  translation-associated GTPase  50.38 
 
 		 393 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2814  translation-associated GTPase  50.51 
 
 		 392 aa  394  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0294234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0647  GTPase of unknown function domain protein  48.48 
 
 		 392 aa  387  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.36601  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0538  GTPase of unknown function domain protein  48.75 
 
 		 400 aa  383  1e-105  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000115599  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1970  GTPase of unknown function domain protein  47.86 
 
 		 392 aa  377  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1450  translation-associated GTPase  47.59 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00412196  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1800  GTPase of unknown function  46.62 
 
 		 401 aa  363  3e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.016533  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0462  translation-associated GTPase  46.21 
 
 		 392 aa  353  2e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0374  translation-associated GTPase  46.21 
 
 		 392 aa  350  3e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376171  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1545  translation-associated GTPase  45.96 
 
 		 392 aa  348  1e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0069  translation-associated GTPase  46.6 
 
 		 400 aa  347  3e-94  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000183308  normal  0.0114224 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0445  translation-associated GTPase  45.32 
 
 		 392 aa  346  4e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192639  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1534  translation-associated GTPase  45.01 
 
 		 398 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000432045 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1806  translation-associated GTPase  45.86 
 
 		 401 aa  327  3e-88  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.732548 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0065  translation-associated GTPase  43.86 
 
 		 419 aa  325  1e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0715  translation-associated GTPase  45.61 
 
 		 399 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1616  translation-associated GTPase  45.45 
 
 		 401 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1662  translation-associated GTPase  42.68 
 
 		 401 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0533  translation-associated GTPase  43.94 
 
 		 401 aa  301  9e-81  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.626339  normal  0.0197443 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1465  translation-associated GTPase  39.6 
 
 		 400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0980  translation-associated GTPase  37.31 
 
 		 403 aa  260  3e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.287275 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2999  GTPase of unknown function domain protein  36.18 
 
 		 399 aa  257  3e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1334  translation-associated GTPase  37.16 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.570526  normal  0.888182 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0128  translation-associated GTPase  37.19 
 
 		 395 aa  251  2e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737053  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0853  GTPase of unknown function domain protein  35.68 
 
 		 399 aa  249  8e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35157  predicted protein  33.09 
 
 		 413 aa  193  5e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00692  GTP-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_1G13540)  30.4 
 
 		 412 aa  168  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3131  predicted protein  31.75 
 
 		 271 aa  119  7e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668518  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23370  GTP-binding protein YchF  30.71 
 
 		 364 aa  110  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000155952  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2482  GTP-binding protein YchF  37.05 
 
 		 365 aa  110  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0048  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.21 
 
 		 367 aa  107  4e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1605  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.74 
 
 		 367 aa  104  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0458572  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0109  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.07 
 
 		 365 aa  103  7e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000802684  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2193  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.46 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7891  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0007  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30 
 
 		 371 aa  102  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0312393  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3748  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.19 
 
 		 367 aa  102  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1769  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.32 
 
 		 365 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2845  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.2 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000149199  hitchhiker  0.000000000000211408 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2510  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.87 
 
 		 365 aa  100  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.566797  normal  0.501348 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0347  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.45 
 
 		 363 aa  100  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127573  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0117  GTPase, translation factor  29.92 
 
 		 367 aa  100  6e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5862  GTP-binding protein YchF  31.81 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2022  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.05 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1046  GTP-binding protein YchF  44.93 
 
 		 365 aa  98.2  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.929667  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1835  GTP-binding protein YchF  28.38 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000078734  normal  0.600832 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1259  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  38.65 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.471371  normal  0.0100148 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1390  GTP-binding protein YchF  29.23 
 
 		 367 aa  97.8  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00313988  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0664  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.29 
 
 		 364 aa  97.4  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151468  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0027  GTP-binding protein YchF  30.66 
 
 		 366 aa  97.1  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1739  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.51 
 
 		 366 aa  97.1  5e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00258583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0877  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.68 
 
 		 364 aa  97.1  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00007173  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2000  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.22 
 
 		 364 aa  96.7  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0206  GTP-binding protein YchF  26.37 
 
 		 357 aa  95.5  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0005  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.73 
 
 		 371 aa  95.9  1e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0445  GTP-binding protein YchF  30.97 
 
 		 373 aa  95.1  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0330999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0677  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.85 
 
 		 366 aa  94.7  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0554  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.43 
 
 		 363 aa  94.7  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.268556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37067  predicted protein  43.48 
 
 		 363 aa  94.7  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0349  GTPase, translation factor  28.88 
 
 		 366 aa  95.1  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2592  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.19 
 
 		 364 aa  94.4  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000145967  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09848  putative ATP/GTP-binding protein  29.73 
 
 		 364 aa  94.4  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3733  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.48 
 
 		 363 aa  94.4  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.316822 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3101  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.04 
 
 		 365 aa  94  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3090  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.2 
 
 		 363 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3030  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.2 
 
 		 363 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3392  GTP-binding protein YchF  29.95 
 
 		 359 aa  93.6  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0450  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.49 
 
 		 363 aa  93.6  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0274175  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1389  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.62 
 
 		 366 aa  93.6  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.159782 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3101  GTP-binding protein YchF  38.36 
 
 		 357 aa  93.6  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4625  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.06 
 
 		 360 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0006  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.65 
 
 		 371 aa  93.2  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4365  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.26 
 
 		 359 aa  93.2  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1634  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.38 
 
 		 362 aa  92.8  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0594912  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1318  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.78 
 
 		 367 aa  92.8  9e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0104464  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1574  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.7 
 
 		 365 aa  92.8  9e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0748  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  38.51 
 
 		 369 aa  92.4  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2765  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  40.65 
 
 		 364 aa  92.8  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5333  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.66 
 
 		 366 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128538  hitchhiker  0.000000465437 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4937  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  40.25 
 
 		 366 aa  92  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000108566  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4625  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.89 
 
 		 363 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0369347 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1085  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.02 
 
 		 364 aa  92.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3547  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.51 
 
 		 366 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1475  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  40.65 
 
 		 364 aa  92.8  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0116591 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3096  GTP-binding protein YchF  38.12 
 
 		 367 aa  92  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156001 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2871  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.18 
 
 		 364 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0442  GTP-binding protein YchF  41.94 
 
 		 366 aa  92  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.637193  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0416  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.04 
 
 		 363 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.550609  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4263  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.54 
 
 		 363 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109438  normal  0.19312 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3037  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.45 
 
 		 387 aa  91.3  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0937  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.47 
 
 		 367 aa  91.3  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.844815  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1647  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  38.92 
 
 		 366 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.429909  normal  0.918011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>