More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0853 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0853  GTPase of unknown function domain protein  100 
 
 
399 aa  816    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2999  GTPase of unknown function domain protein  92.73 
 
 
399 aa  764    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1465  translation-associated GTPase  70.45 
 
 
400 aa  585  1e-166  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1334  translation-associated GTPase  71.21 
 
 
395 aa  575  1.0000000000000001e-163  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.570526  normal  0.888182 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0128  translation-associated GTPase  68.94 
 
 
395 aa  557  1e-157  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737053  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0779  translation-associated GTPase  44.33 
 
 
395 aa  336  2.9999999999999997e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0647  GTPase of unknown function domain protein  44.95 
 
 
392 aa  332  7.000000000000001e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.36601  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2275  translation-associated GTPase  45.32 
 
 
393 aa  331  1e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2814  translation-associated GTPase  43.43 
 
 
392 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0294234  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1534  translation-associated GTPase  40.69 
 
 
398 aa  324  2e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000432045 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1800  GTPase of unknown function  41.06 
 
 
401 aa  322  5e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.016533  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0538  GTPase of unknown function domain protein  41.96 
 
 
400 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000115599  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0175  translation-associated GTPase  43.18 
 
 
390 aa  317  3e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.278003  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0065  translation-associated GTPase  41.9 
 
 
419 aa  316  5e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0069  translation-associated GTPase  41.06 
 
 
400 aa  315  6e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000183308  normal  0.0114224 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1970  GTPase of unknown function domain protein  43.94 
 
 
392 aa  315  9.999999999999999e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1450  translation-associated GTPase  39.19 
 
 
393 aa  309  4e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00412196  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0462  translation-associated GTPase  38.58 
 
 
392 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0374  translation-associated GTPase  38.27 
 
 
392 aa  308  9e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376171  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1073  translation-associated GTPase  40.75 
 
 
394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0445  translation-associated GTPase  38.58 
 
 
392 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192639  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1545  translation-associated GTPase  38.64 
 
 
392 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0715  translation-associated GTPase  40 
 
 
399 aa  296  3e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1959  translation-associated GTPase  39.4 
 
 
395 aa  296  6e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1662  translation-associated GTPase  40.35 
 
 
401 aa  286  4e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0533  translation-associated GTPase  39.3 
 
 
401 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.626339  normal  0.0197443 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1616  translation-associated GTPase  40.39 
 
 
401 aa  281  1e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1806  translation-associated GTPase  38.25 
 
 
401 aa  281  1e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.732548 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1725  translation-associated GTPase  38 
 
 
389 aa  270  5e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0297  translation-associated GTPase  37.88 
 
 
389 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0624  translation-associated GTPase  38.06 
 
 
390 aa  262  8e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2621  translation-associated GTPase  35.09 
 
 
389 aa  253  3e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1577  translation-associated GTPase  35.68 
 
 
389 aa  249  8e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0980  translation-associated GTPase  34.33 
 
 
403 aa  231  2e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.287275 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35157  predicted protein  35.81 
 
 
413 aa  216  5.9999999999999996e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00692  GTP-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_1G13540)  35.04 
 
 
412 aa  212  9e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3131  predicted protein  33.82 
 
 
271 aa  123  5e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668518  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1055  GTP-binding protein YchF  29.76 
 
 
354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0763151  hitchhiker  0.00159487 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0416  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.87 
 
 
363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.550609  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0517  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.34 
 
 
362 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0347  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.05 
 
 
363 aa  107  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127573  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1579  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.85 
 
 
360 aa  104  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0746  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.01 
 
 
363 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11960  GTP-binding protein YchF  28.47 
 
 
354 aa  104  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.642415  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15861  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.08 
 
 
363 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.100082  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0515  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.99 
 
 
368 aa  103  5e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0572  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.51 
 
 
363 aa  103  5e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1634  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.77 
 
 
362 aa  103  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0594912  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0450  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.14 
 
 
363 aa  103  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0274175  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2774  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.58 
 
 
363 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.97205 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2708  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.88 
 
 
364 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0453  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.41 
 
 
364 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0338644 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0429  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.41 
 
 
364 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0450  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.88 
 
 
364 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1259  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.12 
 
 
363 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.471371  normal  0.0100148 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1530  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.58 
 
 
357 aa  102  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21870  GTP-binding protein YchF  28.54 
 
 
354 aa  102  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0475417 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0530  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.19 
 
 
363 aa  101  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3507  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.88 
 
 
364 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125034  normal  0.0137315 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1861  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  40.37 
 
 
373 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.924801 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4263  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.47 
 
 
363 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109438  normal  0.19312 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3140  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.58 
 
 
364 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.48249  normal  0.369877 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2368  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.69 
 
 
363 aa  100  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1390  GTP-binding protein YchF  27.37 
 
 
367 aa  99  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00313988  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0496  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.58 
 
 
364 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2581  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.58 
 
 
364 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0986  GTP-binding protein YchF  29.76 
 
 
363 aa  99  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0524  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.58 
 
 
364 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0231  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.27 
 
 
363 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.375519 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3392  GTP-binding protein YchF  37.08 
 
 
359 aa  98.6  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0519  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.69 
 
 
364 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3587  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.69 
 
 
364 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3611  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.88 
 
 
364 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1923  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.69 
 
 
364 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.264442  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3569  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.69 
 
 
364 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3596  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.69 
 
 
364 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0952  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.69 
 
 
364 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2871  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.48 
 
 
364 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0657  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.69 
 
 
364 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2898  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.65 
 
 
364 aa  98.2  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1734  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  38.33 
 
 
363 aa  98.2  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0584836  normal  0.0100242 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0466  GTP-binding protein YchF  26.15 
 
 
364 aa  97.8  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2920  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.38 
 
 
364 aa  97.4  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.657058  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0877  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.63 
 
 
364 aa  97.4  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00007173  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1234  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.59 
 
 
363 aa  96.7  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.909233  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0664  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.65 
 
 
364 aa  96.7  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151468  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0048  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.9 
 
 
367 aa  96.3  8e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3733  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.17 
 
 
363 aa  96.3  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.316822 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1171  GTP-binding protein YchF  27.7 
 
 
364 aa  96.3  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2082  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.72 
 
 
360 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330246  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2592  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.75 
 
 
364 aa  96.3  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000145967  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13271  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.09 
 
 
363 aa  96.3  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4333  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.36 
 
 
376 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.567593 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3037  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.93 
 
 
387 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0857  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.91 
 
 
358 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0266679  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0700  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.86 
 
 
368 aa  95.9  1e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4102  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.36 
 
 
376 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4178  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.36 
 
 
376 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40111  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3193  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.49 
 
 
363 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.36162  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0295  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.07 
 
 
356 aa  94.7  2e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>