More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0538 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0538  GTPase of unknown function domain protein  100 
 
 		 400 aa  816    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000115599  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0175  translation-associated GTPase  52.75 
 
 		 390 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.278003  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1073  translation-associated GTPase  51.51 
 
 		 394 aa  412  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1450  translation-associated GTPase  52.26 
 
 		 393 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00412196  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0445  translation-associated GTPase  51.75 
 
 		 392 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192639  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1545  translation-associated GTPase  50.75 
 
 		 392 aa  398  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0462  translation-associated GTPase  50.5 
 
 		 392 aa  395  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0374  translation-associated GTPase  50.75 
 
 		 392 aa  396  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376171  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0069  translation-associated GTPase  50.5 
 
 		 400 aa  397  1e-109  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000183308  normal  0.0114224 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0065  translation-associated GTPase  51.62 
 
 		 419 aa  397  1e-109  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1959  translation-associated GTPase  48.37 
 
 		 395 aa  396  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1800  GTPase of unknown function  49.5 
 
 		 401 aa  392  1e-108  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.016533  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0647  GTPase of unknown function domain protein  46.73 
 
 		 392 aa  389  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.36601  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2814  translation-associated GTPase  46.98 
 
 		 392 aa  388  1e-107  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0294234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0779  translation-associated GTPase  46.48 
 
 		 395 aa  388  1e-106  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2275  translation-associated GTPase  47.49 
 
 		 393 aa  387  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1577  translation-associated GTPase  48.75 
 
 		 389 aa  383  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1806  translation-associated GTPase  50.74 
 
 		 401 aa  375  1e-103  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.732548 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1534  translation-associated GTPase  46 
 
 		 398 aa  371  1e-101  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000432045 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0624  translation-associated GTPase  47 
 
 		 390 aa  363  4e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0715  translation-associated GTPase  49.25 
 
 		 399 aa  362  6e-99  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1970  GTPase of unknown function domain protein  45.23 
 
 		 392 aa  362  9e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1662  translation-associated GTPase  51 
 
 		 401 aa  360  2e-98  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2621  translation-associated GTPase  46.48 
 
 		 389 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0533  translation-associated GTPase  49.5 
 
 		 401 aa  355  8.999999999999999e-97  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.626339  normal  0.0197443 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1725  translation-associated GTPase  46.98 
 
 		 389 aa  351  1e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1616  translation-associated GTPase  49.25 
 
 		 401 aa  348  1e-94  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0297  translation-associated GTPase  44.2 
 
 		 389 aa  344  2e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2999  GTPase of unknown function domain protein  42.21 
 
 		 399 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0853  GTPase of unknown function domain protein  41.96 
 
 		 399 aa  321  1.9999999999999998e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0128  translation-associated GTPase  42.21 
 
 		 395 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737053  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1334  translation-associated GTPase  41.35 
 
 		 395 aa  308  6.999999999999999e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.570526  normal  0.888182 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1465  translation-associated GTPase  40.75 
 
 		 400 aa  304  1.0000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0980  translation-associated GTPase  37.91 
 
 		 403 aa  271  1e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.287275 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00692  GTP-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_1G13540)  34.95 
 
 		 412 aa  205  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35157  predicted protein  34.7 
 
 		 413 aa  204  3e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2571  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.47 
 
 		 363 aa  119  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02583  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.91 
 
 		 363 aa  117  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000898424  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1605  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.14 
 
 		 367 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0458572  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2022  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.22 
 
 		 363 aa  116  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2592  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.95 
 
 		 364 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000145967  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1318  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.24 
 
 		 367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0104464  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2121  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.13 
 
 		 365 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1835  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.7 
 
 		 365 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.259258  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3131  predicted protein  32.03 
 
 		 271 aa  113  5e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668518  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1052  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.19 
 
 		 366 aa  113  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.133345 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2444  GTP-binding protein YchF  28.33 
 
 		 363 aa  113  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0781916  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1308  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.33 
 
 		 363 aa  113  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.253077  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2423  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.33 
 
 		 363 aa  113  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0847638 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1350  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.33 
 
 		 363 aa  113  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0630481  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1367  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.33 
 
 		 363 aa  113  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.37474  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1939  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.33 
 
 		 363 aa  113  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.256808  normal  0.0918473 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0503  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.89 
 
 		 363 aa  113  6e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1684  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.33 
 
 		 363 aa  113  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000467912  normal  0.464774 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01178  translation-associated GTPase  28.33 
 
 		 363 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1835  GTP-binding protein YchF  28.99 
 
 		 363 aa  113  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000078734  normal  0.600832 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01188  hypothetical protein  28.33 
 
 		 363 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1390  GTP-binding protein YchF  28.17 
 
 		 367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00313988  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1923  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.21 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1280  GTP-binding protein YchF  27.46 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1537  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.21 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0518912 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1981  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.21 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.262835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1917  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.21 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1353  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.21 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0280261  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0877  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.73 
 
 		 364 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00007173  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01244  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.61 
 
 		 363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2931  GTP-binding protein YchF  31.97 
 
 		 366 aa  110  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0677  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.25 
 
 		 366 aa  110  5e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0717  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.1 
 
 		 363 aa  110  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000164209  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2063  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.86 
 
 		 363 aa  109  8.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37067  predicted protein  28.4 
 
 		 363 aa  109  8.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1698  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.77 
 
 		 366 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.309195  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1849  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.55 
 
 		 363 aa  109  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.476561  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2121  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.64 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0490059  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0442  GTP-binding protein YchF  27.9 
 
 		 366 aa  109  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.637193  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0072  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.56 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2043  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.56 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0206  GTP-binding protein YchF  28.92 
 
 		 357 aa  108  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0784  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.71 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000100332  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2482  GTP-binding protein YchF  27.68 
 
 		 365 aa  107  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2571  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.79 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000069275  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0517  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.92 
 
 		 362 aa  107  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2204  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.88 
 
 		 363 aa  106  6e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000173002  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1634  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.67 
 
 		 362 aa  106  8e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0594912  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2000  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.86 
 
 		 364 aa  106  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2115  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.88 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000126801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0590  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.06 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000196131  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1762  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.99 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000606508  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2345  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.75 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3257  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.44 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720126  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4756  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.47 
 
 		 366 aa  104  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.586629  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1047  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.08 
 
 		 367 aa  104  3e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3259  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.9 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267729 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0675  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.95 
 
 		 361 aa  104  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.762559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0819  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.29 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000642371  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2414  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.92 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1171  GTP-binding protein YchF  27.87 
 
 		 364 aa  104  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2852  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.43 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000959871  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0530  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.13 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1521  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.73 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00078802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>