More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1334 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1334  translation-associated GTPase  100 
 
 		 395 aa  803    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.570526  normal  0.888182 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0128  translation-associated GTPase  78.99 
 
 		 395 aa  654    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737053  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1465  translation-associated GTPase  71.03 
 
 		 400 aa  587  1e-166  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2999  GTPase of unknown function domain protein  70.71 
 
 		 399 aa  581  1.0000000000000001e-165  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0853  GTPase of unknown function domain protein  71.21 
 
 		 399 aa  575  1.0000000000000001e-163  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0647  GTPase of unknown function domain protein  46 
 
 		 392 aa  345  5e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.36601  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0779  translation-associated GTPase  47.63 
 
 		 395 aa  332  1e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1970  GTPase of unknown function domain protein  44.47 
 
 		 392 aa  324  2e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2814  translation-associated GTPase  44.47 
 
 		 392 aa  323  3e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0294234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0065  translation-associated GTPase  42.61 
 
 		 419 aa  320  1.9999999999999998e-86  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1800  GTPase of unknown function  40.55 
 
 		 401 aa  319  7e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.016533  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2275  translation-associated GTPase  42.57 
 
 		 393 aa  318  7e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0715  translation-associated GTPase  43.03 
 
 		 399 aa  311  1e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1450  translation-associated GTPase  39.69 
 
 		 393 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00412196  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0538  GTPase of unknown function domain protein  41.35 
 
 		 400 aa  308  6.999999999999999e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000115599  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1534  translation-associated GTPase  39.65 
 
 		 398 aa  308  6.999999999999999e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000432045 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0069  translation-associated GTPase  40.81 
 
 		 400 aa  308  9e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000183308  normal  0.0114224 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0175  translation-associated GTPase  41.46 
 
 		 390 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.278003  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1959  translation-associated GTPase  39.85 
 
 		 395 aa  300  2e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0445  translation-associated GTPase  38.32 
 
 		 392 aa  299  6e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192639  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0462  translation-associated GTPase  38.27 
 
 		 392 aa  296  3e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0374  translation-associated GTPase  38.27 
 
 		 392 aa  296  4e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376171  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1806  translation-associated GTPase  41.01 
 
 		 401 aa  295  8e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.732548 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1073  translation-associated GTPase  40.15 
 
 		 394 aa  293  4e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1545  translation-associated GTPase  38.01 
 
 		 392 aa  293  5e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0533  translation-associated GTPase  40.71 
 
 		 401 aa  287  2e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.626339  normal  0.0197443 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1662  translation-associated GTPase  39.75 
 
 		 401 aa  281  1e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0624  translation-associated GTPase  39.25 
 
 		 390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1725  translation-associated GTPase  38.85 
 
 		 389 aa  273  3e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1616  translation-associated GTPase  39.44 
 
 		 401 aa  272  8.000000000000001e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0297  translation-associated GTPase  39.04 
 
 		 389 aa  261  1e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1577  translation-associated GTPase  37.16 
 
 		 389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2621  translation-associated GTPase  36.02 
 
 		 389 aa  248  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0980  translation-associated GTPase  36.3 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.287275 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35157  predicted protein  35.07 
 
 		 413 aa  211  2e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00692  GTP-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_1G13540)  34.83 
 
 		 412 aa  202  9e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3131  predicted protein  33.33 
 
 		 271 aa  124  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668518  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0450  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.15 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0274175  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0530  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.34 
 
 		 363 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0416  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  42.31 
 
 		 363 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.550609  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0986  GTP-binding protein YchF  30.83 
 
 		 363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1390  GTP-binding protein YchF  29.09 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00313988  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0677  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.26 
 
 		 366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0347  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.5 
 
 		 363 aa  110  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127573  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2367  GTP-binding protein YchF  31.12 
 
 		 366 aa  110  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3030  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.02 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0884  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.13 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0937  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.39 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.844815  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf169  putative GTPase translation factor  27.78 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.716411  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3090  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.02 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1008  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.13 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4937  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.66 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000108566  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1055  GTP-binding protein YchF  30.3 
 
 		 354 aa  107  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0763151  hitchhiker  0.00159487 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0390  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.16 
 
 		 363 aa  106  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.997224  normal  0.0213751 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0572  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.57 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0532  GTP-binding protein YchF  28.28 
 
 		 357 aa  105  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2765  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.8 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1475  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.07 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0116591 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1734  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  39.77 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0584836  normal  0.0100242 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1769  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  39.67 
 
 		 365 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21870  GTP-binding protein YchF  29.66 
 
 		 354 aa  105  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0475417 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2159  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.95 
 
 		 367 aa  105  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470887  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0048  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.12 
 
 		 367 aa  104  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1579  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.93 
 
 		 360 aa  104  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3392  GTP-binding protein YchF  40.25 
 
 		 359 aa  104  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.180575  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0729  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.68 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195825 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3101  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  39.2 
 
 		 365 aa  103  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0517  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.61 
 
 		 362 aa  103  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4159  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  40.34 
 
 		 365 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.471291  normal  0.369246 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15861  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.57 
 
 		 363 aa  103  7e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.100082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2592  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.8 
 
 		 364 aa  103  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000145967  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1530  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.52 
 
 		 357 aa  103  7e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0330741  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3037  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.75 
 
 		 387 aa  102  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3193  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.78 
 
 		 363 aa  102  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.36162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3999  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  39.77 
 
 		 365 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3101  GTP-binding protein YchF  41.4 
 
 		 357 aa  102  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8269  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.46 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3794  GTP-binding protein YchF  31.41 
 
 		 363 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1259  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.88 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.471371  normal  0.0100148 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2708  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.95 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0664  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.81 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151468  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0648  GTP-binding protein YchF  29.06 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.379901 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0746  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.06 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11960  GTP-binding protein YchF  32.85 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.642415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0453  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.05 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0338644 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1417  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  39.2 
 
 		 365 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.685552 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0429  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.05 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1861  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  40.76 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.924801 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0519  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.96 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3596  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.96 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0450  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.72 
 
 		 364 aa  101  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3507  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.34 
 
 		 364 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125034  normal  0.0137315 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1923  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.96 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.264442  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1835  GTP-binding protein YchF  30.13 
 
 		 363 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000078734  normal  0.600832 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0952  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.96 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1124  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  38.01 
 
 		 361 aa  101  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.356013 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2368  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.89 
 
 		 363 aa  101  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0657  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.96 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2898  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.02 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl660  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.49 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>