More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0462 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0462  translation-associated GTPase  100 
 
 		 392 aa  798    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1545  translation-associated GTPase  96.17 
 
 		 392 aa  770    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0445  translation-associated GTPase  85.2 
 
 		 392 aa  701    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192639  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0374  translation-associated GTPase  95.92 
 
 		 392 aa  769    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376171  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1450  translation-associated GTPase  73.86 
 
 		 393 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00412196  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0538  GTPase of unknown function domain protein  50.5 
 
 		 400 aa  395  1e-109  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000115599  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1073  translation-associated GTPase  50.63 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1800  GTPase of unknown function  49.25 
 
 		 401 aa  384  1e-105  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.016533  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0175  translation-associated GTPase  49.62 
 
 		 390 aa  384  1e-105  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.278003  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1959  translation-associated GTPase  49.12 
 
 		 395 aa  376  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1725  translation-associated GTPase  49.37 
 
 		 389 aa  372  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0069  translation-associated GTPase  46.98 
 
 		 400 aa  372  1e-102  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000183308  normal  0.0114224 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2621  translation-associated GTPase  48.87 
 
 		 389 aa  371  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2275  translation-associated GTPase  43.83 
 
 		 393 aa  355  8.999999999999999e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1577  translation-associated GTPase  46.21 
 
 		 389 aa  353  2e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2814  translation-associated GTPase  42.93 
 
 		 392 aa  352  5.9999999999999994e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0294234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0297  translation-associated GTPase  47.22 
 
 		 389 aa  348  7e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0065  translation-associated GTPase  45.8 
 
 		 419 aa  347  2e-94  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0624  translation-associated GTPase  46.98 
 
 		 390 aa  345  7e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0779  translation-associated GTPase  42.07 
 
 		 395 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1534  translation-associated GTPase  45.59 
 
 		 398 aa  342  8e-93  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000432045 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0715  translation-associated GTPase  45.73 
 
 		 399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0647  GTPase of unknown function domain protein  43.58 
 
 		 392 aa  339  4e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.36601  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1806  translation-associated GTPase  43.91 
 
 		 401 aa  339  5e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.732548 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0533  translation-associated GTPase  46.45 
 
 		 401 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.626339  normal  0.0197443 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1616  translation-associated GTPase  46.19 
 
 		 401 aa  335  1e-90  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1662  translation-associated GTPase  46.1 
 
 		 401 aa  334  2e-90  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1970  GTPase of unknown function domain protein  43.07 
 
 		 392 aa  324  1e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2999  GTPase of unknown function domain protein  37.82 
 
 		 399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0853  GTPase of unknown function domain protein  38.58 
 
 		 399 aa  309  5.9999999999999995e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1465  translation-associated GTPase  38.27 
 
 		 400 aa  297  2e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0128  translation-associated GTPase  37.88 
 
 		 395 aa  297  2e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737053  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1334  translation-associated GTPase  38.27 
 
 		 395 aa  296  3e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.570526  normal  0.888182 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0980  translation-associated GTPase  41.06 
 
 		 403 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.287275 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35157  predicted protein  34.91 
 
 		 413 aa  232  8.000000000000001e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00692  GTP-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_1G13540)  33.5 
 
 		 412 aa  212  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3131  predicted protein  32.35 
 
 		 271 aa  128  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668518  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2022  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.89 
 
 		 363 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0877  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.98 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00007173  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0416  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.76 
 
 		 363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.550609  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3101  GTP-binding protein YchF  35.9 
 
 		 357 aa  109  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1796  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.03 
 
 		 363 aa  109  8.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0100064  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2193  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29 
 
 		 369 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7891  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0823  GTP-binding protein YchF  28.5 
 
 		 369 aa  109  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1615  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.54 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1734  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.49 
 
 		 363 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0584836  normal  0.0100242 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1280  GTP-binding protein YchF  32.7 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0347  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.27 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127573  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23370  GTP-binding protein YchF  30.38 
 
 		 364 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000155952  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1835  GTP-binding protein YchF  28.57 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000078734  normal  0.600832 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0154  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.01 
 
 		 362 aa  106  6e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0101  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.8 
 
 		 362 aa  106  8e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.720243  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3547  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.58 
 
 		 366 aa  106  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1634  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.32 
 
 		 362 aa  105  9e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0594912  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2482  GTP-binding protein YchF  29.92 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4015  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.02 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.362655  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37067  predicted protein  29.46 
 
 		 363 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2002  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.76 
 
 		 363 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00393198  normal  0.0943361 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0572  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.49 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0450  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.23 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0274175  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5333  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.57 
 
 		 366 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128538  hitchhiker  0.000000465437 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0109  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.02 
 
 		 365 aa  104  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000802684  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12121  GTP-binding protein  30.16 
 
 		 393 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.467658 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1259  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.86 
 
 		 363 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.471371  normal  0.0100148 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3096  GTP-binding protein YchF  31.03 
 
 		 367 aa  103  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156001 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2642  GTP-binding protein YchF  29.18 
 
 		 366 aa  103  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3418  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.47 
 
 		 366 aa  103  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000016062  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0007  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.69 
 
 		 371 aa  103  8e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0312393  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4937  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.11 
 
 		 366 aa  102  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000108566  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0027  GTP-binding protein YchF  27.93 
 
 		 366 aa  102  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5626  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.88 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000871672  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4281  GTP-binding protein YchF  29.97 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0986  GTP-binding protein YchF  27.59 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2592  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.62 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000145967  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0442  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.11 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.392269  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5585  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.33 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000269 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5328  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.33 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00440809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5156  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.33 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.474948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5172  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.33 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000341574  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3090  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.11 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5663  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.33 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000189692  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5724  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.33 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000153579  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5602  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.3 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3030  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.11 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0048  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.56 
 
 		 367 aa  100  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0517  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.22 
 
 		 362 aa  101  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2000  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.15 
 
 		 364 aa  101  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2765  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.15 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0664  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.69 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151468  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13271  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  38.18 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0005  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.06 
 
 		 371 aa  100  4e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119525  Nucleic acid binding GTPase, translation factor, putative  29.7 
 
 		 419 aa  100  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.832953  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0395  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.27 
 
 		 363 aa  100  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186596  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1234  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.77 
 
 		 363 aa  100  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.909233  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11960  GTP-binding protein YchF  30.5 
 
 		 354 aa  99.8  7e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.642415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1055  GTP-binding protein YchF  27.79 
 
 		 354 aa  99.4  9e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0763151  hitchhiker  0.00159487 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1204  GTP-binding protein YchF  29.26 
 
 		 372 aa  99.8  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.590839  normal  0.981589 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21870  GTP-binding protein YchF  28.95 
 
 		 354 aa  99.4  9e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0475417 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1318  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.44 
 
 		 367 aa  99  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0104464  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0006  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.53 
 
 		 371 aa  99  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>