More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1725 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1725  translation-associated GTPase  100 
 
 		 389 aa  801    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0297  translation-associated GTPase  64.01 
 
 		 389 aa  528  1e-149  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1577  translation-associated GTPase  64.52 
 
 		 389 aa  523  1e-147  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2621  translation-associated GTPase  61.44 
 
 		 389 aa  496  1e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0624  translation-associated GTPase  57.44 
 
 		 390 aa  450  1e-125  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1073  translation-associated GTPase  56.71 
 
 		 394 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0175  translation-associated GTPase  54.36 
 
 		 390 aa  427  1e-118  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.278003  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1959  translation-associated GTPase  52.79 
 
 		 395 aa  421  1e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1450  translation-associated GTPase  51.39 
 
 		 393 aa  393  1e-108  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00412196  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2275  translation-associated GTPase  49.12 
 
 		 393 aa  387  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0779  translation-associated GTPase  49.87 
 
 		 395 aa  384  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2814  translation-associated GTPase  48.6 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0294234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1545  translation-associated GTPase  49.37 
 
 		 392 aa  374  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0374  translation-associated GTPase  49.37 
 
 		 392 aa  372  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376171  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0462  translation-associated GTPase  49.37 
 
 		 392 aa  372  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0647  GTPase of unknown function domain protein  46.68 
 
 		 392 aa  364  1e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.36601  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0445  translation-associated GTPase  48.61 
 
 		 392 aa  363  2e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192639  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1800  GTPase of unknown function  45.73 
 
 		 401 aa  355  5e-97  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.016533  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1970  GTPase of unknown function domain protein  47.34 
 
 		 392 aa  355  1e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0538  GTPase of unknown function domain protein  46.98 
 
 		 400 aa  351  1e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000115599  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0069  translation-associated GTPase  46.63 
 
 		 400 aa  351  1e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000183308  normal  0.0114224 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1534  translation-associated GTPase  46.41 
 
 		 398 aa  346  5e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000432045 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0715  translation-associated GTPase  44.39 
 
 		 399 aa  318  1e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0065  translation-associated GTPase  43.32 
 
 		 419 aa  313  3.9999999999999997e-84  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1806  translation-associated GTPase  43.83 
 
 		 401 aa  311  2e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.732548 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0533  translation-associated GTPase  44.22 
 
 		 401 aa  294  2e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.626339  normal  0.0197443 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1616  translation-associated GTPase  44.36 
 
 		 401 aa  293  4e-78  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1662  translation-associated GTPase  42.93 
 
 		 401 aa  289  6e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1465  translation-associated GTPase  39.75 
 
 		 400 aa  276  5e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1334  translation-associated GTPase  38.85 
 
 		 395 aa  273  3e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.570526  normal  0.888182 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2999  GTPase of unknown function domain protein  37.28 
 
 		 399 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0980  translation-associated GTPase  39.65 
 
 		 403 aa  271  1e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.287275 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0128  translation-associated GTPase  39.85 
 
 		 395 aa  271  2e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737053  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0853  GTPase of unknown function domain protein  38 
 
 		 399 aa  270  4e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00692  GTP-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_1G13540)  33.17 
 
 		 412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35157  predicted protein  30.97 
 
 		 413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3131  predicted protein  34.22 
 
 		 271 aa  122  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668518  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0349  GTPase, translation factor  27.56 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0007  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.19 
 
 		 371 aa  110  5e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0312393  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2193  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.39 
 
 		 369 aa  108  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7891  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0109  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.05 
 
 		 365 aa  108  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000802684  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0117  GTPase, translation factor  27.18 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1739  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.88 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00258583  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0006  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.81 
 
 		 371 aa  107  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2022  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.63 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2707  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.14 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2579  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.14 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2482  GTP-binding protein YchF  34.2 
 
 		 365 aa  103  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5862  GTP-binding protein YchF  27.98 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0731  GTP-binding protein YchF  33.93 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000537765  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1574  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  38.12 
 
 		 365 aa  102  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1634  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.76 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0594912  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0005  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.29 
 
 		 371 aa  100  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1234  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.62 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.909233  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13271  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.1 
 
 		 363 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2592  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.82 
 
 		 364 aa  100  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000145967  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23370  GTP-binding protein YchF  26.93 
 
 		 364 aa  99.8  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000155952  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0554  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  36.31 
 
 		 363 aa  99.8  8e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.268556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13131  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.1 
 
 		 363 aa  99.4  9e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0877  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.25 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00007173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2845  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  37.66 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000149199  hitchhiker  0.000000000000211408 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1615  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.07 
 
 		 370 aa  98.6  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3101  GTP-binding protein YchF  38.22 
 
 		 357 aa  98.6  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1769  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.89 
 
 		 365 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2121  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  39.07 
 
 		 365 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1835  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  39.07 
 
 		 365 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.259258  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15861  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.76 
 
 		 363 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.100082  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0664  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  38.31 
 
 		 364 aa  97.8  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151468  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2510  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.95 
 
 		 365 aa  97.8  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.566797  normal  0.501348 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0416  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.72 
 
 		 363 aa  97.8  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.550609  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0746  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.28 
 
 		 363 aa  97.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.926297  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0395  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.39 
 
 		 363 aa  97.4  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186596  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13021  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.84 
 
 		 363 aa  97.4  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.98106  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5333  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.37 
 
 		 366 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128538  hitchhiker  0.000000465437 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0305  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.33 
 
 		 368 aa  96.7  6e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0911742  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5626  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.59 
 
 		 366 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000871672  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5602  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.67 
 
 		 366 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0104876  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4625  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.84 
 
 		 363 aa  96.7  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0369347 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5328  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.67 
 
 		 366 aa  96.3  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00440809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5156  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.67 
 
 		 366 aa  96.3  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.474948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5172  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.67 
 
 		 366 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000341574  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3733  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.64 
 
 		 363 aa  96.3  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.316822 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5724  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.67 
 
 		 366 aa  96.3  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000153579  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5663  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.67 
 
 		 366 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000189692  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1259  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.92 
 
 		 363 aa  96.3  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.471371  normal  0.0100148 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1861  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  38.46 
 
 		 373 aa  96.7  7e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.924801 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5585  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.67 
 
 		 366 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000269 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0442  GTP-binding protein YchF  39.35 
 
 		 366 aa  96.3  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.637193  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0027  GTP-binding protein YchF  38.56 
 
 		 366 aa  95.9  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4281  GTP-binding protein YchF  39.1 
 
 		 366 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1537  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.61 
 
 		 367 aa  95.5  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0679708  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0473  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  39.49 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3611  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.77 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2467  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.38 
 
 		 364 aa  95.9  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293996  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0206  GTP-binding protein YchF  33.33 
 
 		 357 aa  95.5  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0675  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  39.47 
 
 		 361 aa  95.5  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.762559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0590  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.05 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000196131  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8269  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.43 
 
 		 357 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1629  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.17 
 
 		 367 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.866476  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2708  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.09 
 
 		 364 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>