More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1450 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1450  translation-associated GTPase  100 
 
 
393 aa  804    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00412196  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0374  translation-associated GTPase  73.6 
 
 
392 aa  611  9.999999999999999e-175  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376171  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0462  translation-associated GTPase  73.86 
 
 
392 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0445  translation-associated GTPase  73.35 
 
 
392 aa  609  1e-173  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192639  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1545  translation-associated GTPase  73.1 
 
 
392 aa  609  1e-173  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1073  translation-associated GTPase  52.53 
 
 
394 aa  413  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0538  GTPase of unknown function domain protein  52.26 
 
 
400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000115599  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1959  translation-associated GTPase  51.39 
 
 
395 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0175  translation-associated GTPase  49.75 
 
 
390 aa  397  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.278003  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1800  GTPase of unknown function  49.37 
 
 
401 aa  391  1e-108  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.016533  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1725  translation-associated GTPase  51.39 
 
 
389 aa  393  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0069  translation-associated GTPase  48.62 
 
 
400 aa  376  1e-103  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000183308  normal  0.0114224 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1577  translation-associated GTPase  47.59 
 
 
389 aa  369  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2275  translation-associated GTPase  45.98 
 
 
393 aa  369  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2621  translation-associated GTPase  48.36 
 
 
389 aa  370  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2814  translation-associated GTPase  44.08 
 
 
392 aa  363  4e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0294234  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0065  translation-associated GTPase  47.21 
 
 
419 aa  362  4e-99  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0715  translation-associated GTPase  47.47 
 
 
399 aa  362  6e-99  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0624  translation-associated GTPase  47.1 
 
 
390 aa  359  4e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0779  translation-associated GTPase  43.22 
 
 
395 aa  352  5e-96  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1806  translation-associated GTPase  45.32 
 
 
401 aa  352  5e-96  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.732548 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0647  GTPase of unknown function domain protein  44.44 
 
 
392 aa  348  7e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.36601  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0297  translation-associated GTPase  46.35 
 
 
389 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1662  translation-associated GTPase  46.58 
 
 
401 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0533  translation-associated GTPase  46.08 
 
 
401 aa  341  1e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.626339  normal  0.0197443 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1534  translation-associated GTPase  44.58 
 
 
398 aa  339  5e-92  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000432045 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1616  translation-associated GTPase  45.82 
 
 
401 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1970  GTPase of unknown function domain protein  44.19 
 
 
392 aa  332  7.000000000000001e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2999  GTPase of unknown function domain protein  38.93 
 
 
399 aa  317  3e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0853  GTPase of unknown function domain protein  39.19 
 
 
399 aa  309  4e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1334  translation-associated GTPase  39.69 
 
 
395 aa  309  5.9999999999999995e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.570526  normal  0.888182 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1465  translation-associated GTPase  39.19 
 
 
400 aa  300  2e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0128  translation-associated GTPase  38.42 
 
 
395 aa  297  2e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737053  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0980  translation-associated GTPase  40.65 
 
 
403 aa  293  4e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.287275 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35157  predicted protein  34.45 
 
 
413 aa  234  1.0000000000000001e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00692  GTP-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_1G13540)  34.25 
 
 
412 aa  226  7e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3131  predicted protein  32.97 
 
 
271 aa  130  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668518  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2022  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.67 
 
 
363 aa  130  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1615  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.79 
 
 
370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0027  GTP-binding protein YchF  28.54 
 
 
366 aa  119  9e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3999  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.53 
 
 
365 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0109  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.15 
 
 
365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000802684  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0450  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.73 
 
 
363 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0274175  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1055  GTP-binding protein YchF  30.89 
 
 
354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0763151  hitchhiker  0.00159487 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0416  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  35.11 
 
 
363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.550609  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4838  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.67 
 
 
365 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0347  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.89 
 
 
363 aa  113  7.000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127573  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1634  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.57 
 
 
362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0594912  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1796  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.46 
 
 
363 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0100064  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1417  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32 
 
 
365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.685552 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2121  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.83 
 
 
365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1835  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.83 
 
 
365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.259258  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0877  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.4 
 
 
364 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00007173  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0048  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.26 
 
 
367 aa  110  4.0000000000000004e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0007  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.1 
 
 
371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0312393  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2193  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.14 
 
 
369 aa  110  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7891  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3096  GTP-binding protein YchF  30.11 
 
 
367 aa  110  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.156001 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1389  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.5 
 
 
366 aa  110  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.159782 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4159  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.62 
 
 
365 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.471291  normal  0.369246 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0823  GTP-binding protein YchF  28.53 
 
 
369 aa  109  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0006  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.17 
 
 
371 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0572  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  33.21 
 
 
363 aa  109  9.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23370  GTP-binding protein YchF  28.07 
 
 
364 aa  109  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000155952  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3547  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.12 
 
 
366 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2931  GTP-binding protein YchF  26.84 
 
 
366 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0442  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.21 
 
 
364 aa  107  3e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.392269  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1734  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.45 
 
 
363 aa  107  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0584836  normal  0.0100242 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0986  GTP-binding protein YchF  27.78 
 
 
363 aa  107  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4281  GTP-binding protein YchF  30.67 
 
 
366 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0206  GTP-binding protein YchF  29.62 
 
 
357 aa  106  6e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0117  GTPase, translation factor  30.73 
 
 
367 aa  106  6e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0395  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.93 
 
 
363 aa  106  7e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186596  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1621  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.04 
 
 
365 aa  106  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1835  GTP-binding protein YchF  29.57 
 
 
363 aa  106  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000078734  normal  0.600832 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2765  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.83 
 
 
364 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1739  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.17 
 
 
366 aa  105  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00258583  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0349  GTPase, translation factor  34.35 
 
 
366 aa  105  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0005  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.92 
 
 
371 aa  105  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3418  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.19 
 
 
366 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000016062  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2000  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28 
 
 
364 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0554  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.57 
 
 
363 aa  104  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.268556  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119525  Nucleic acid binding GTPase, translation factor, putative  30.4 
 
 
419 aa  105  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.832953  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3101  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.22 
 
 
365 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11960  GTP-binding protein YchF  34.24 
 
 
354 aa  104  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.642415  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21870  GTP-binding protein YchF  29.66 
 
 
354 aa  104  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0475417 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0422  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.54 
 
 
365 aa  104  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0242427  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3101  GTP-binding protein YchF  33.79 
 
 
357 aa  104  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0411  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.54 
 
 
365 aa  104  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00200515  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2592  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.71 
 
 
364 aa  103  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000145967  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4937  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.53 
 
 
366 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000108566  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2510  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.42 
 
 
365 aa  103  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.566797  normal  0.501348 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1475  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.34 
 
 
364 aa  103  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0116591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1259  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.18 
 
 
363 aa  103  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.471371  normal  0.0100148 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1204  GTP-binding protein YchF  29.14 
 
 
372 aa  103  7e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.590839  normal  0.981589 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37067  predicted protein  29.58 
 
 
363 aa  102  8e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0664  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.97 
 
 
364 aa  102  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151468  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2482  GTP-binding protein YchF  28.64 
 
 
365 aa  102  9e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1234  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.62 
 
 
363 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.909233  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0101  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.61 
 
 
362 aa  102  1e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.720243  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4263  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.88 
 
 
363 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.109438  normal  0.19312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>