More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0779 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0779  translation-associated GTPase  100 
 
 		 395 aa  790    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2814  translation-associated GTPase  76.28 
 
 		 392 aa  609  1e-173  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0294234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0647  GTPase of unknown function domain protein  70.92 
 
 		 392 aa  591  1e-168  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.36601  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2275  translation-associated GTPase  72.01 
 
 		 393 aa  589  1e-167  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1970  GTPase of unknown function domain protein  70.41 
 
 		 392 aa  577  1.0000000000000001e-163  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1959  translation-associated GTPase  51.9 
 
 		 395 aa  437  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1073  translation-associated GTPase  51.39 
 
 		 394 aa  419  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0175  translation-associated GTPase  52.04 
 
 		 390 aa  421  1e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.278003  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1577  translation-associated GTPase  52.51 
 
 		 389 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2621  translation-associated GTPase  48.74 
 
 		 389 aa  389  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0538  GTPase of unknown function domain protein  46.48 
 
 		 400 aa  388  1e-106  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000115599  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1725  translation-associated GTPase  49.87 
 
 		 389 aa  384  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0297  translation-associated GTPase  48.09 
 
 		 389 aa  370  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1800  GTPase of unknown function  43.39 
 
 		 401 aa  361  1e-98  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.016533  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1450  translation-associated GTPase  43.22 
 
 		 393 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00412196  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1534  translation-associated GTPase  42.89 
 
 		 398 aa  351  1e-95  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000432045 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0624  translation-associated GTPase  45.06 
 
 		 390 aa  350  3e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1465  translation-associated GTPase  48.23 
 
 		 400 aa  349  4e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0065  translation-associated GTPase  46.46 
 
 		 419 aa  348  8e-95  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0069  translation-associated GTPase  43.58 
 
 		 400 aa  348  9e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000183308  normal  0.0114224 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0445  translation-associated GTPase  41.85 
 
 		 392 aa  344  2e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.192639  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1545  translation-associated GTPase  42.07 
 
 		 392 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0462  translation-associated GTPase  42.07 
 
 		 392 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0374  translation-associated GTPase  42.07 
 
 		 392 aa  343  4e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.376171  normal  0.0362162 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1806  translation-associated GTPase  45.32 
 
 		 401 aa  339  4e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.732548 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0128  translation-associated GTPase  46.6 
 
 		 395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.737053  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0853  GTPase of unknown function domain protein  44.33 
 
 		 399 aa  336  2.9999999999999997e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2999  GTPase of unknown function domain protein  43.83 
 
 		 399 aa  333  4e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1334  translation-associated GTPase  47.63 
 
 		 395 aa  332  1e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.570526  normal  0.888182 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0715  translation-associated GTPase  45.11 
 
 		 399 aa  330  3e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0533  translation-associated GTPase  43.32 
 
 		 401 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.626339  normal  0.0197443 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1662  translation-associated GTPase  45.61 
 
 		 401 aa  318  1e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1616  translation-associated GTPase  44.3 
 
 		 401 aa  312  6.999999999999999e-84  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0980  translation-associated GTPase  38.61 
 
 		 403 aa  271  1e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.287275 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35157  predicted protein  32.48 
 
 		 413 aa  196  6e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00692  GTP-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_1G13540)  32.38 
 
 		 412 aa  187  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0565673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3131  predicted protein  34.1 
 
 		 271 aa  127  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.668518  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2845  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.92 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000149199  hitchhiker  0.000000000000211408 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0664  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.73 
 
 		 364 aa  110  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.151468  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3363  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.68 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1849  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.71 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.476561  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2000  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.03 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2022  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  26.86 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1659  GTP-binding protein YchF  30.26 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09848  putative ATP/GTP-binding protein  27.76 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2219  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.47 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1981  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.95 
 
 		 363 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.262835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2414  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.14 
 
 		 363 aa  101  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1917  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.95 
 
 		 363 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1537  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.95 
 
 		 363 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0518912 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1923  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.95 
 
 		 363 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1353  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.95 
 
 		 363 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0280261  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2121  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.65 
 
 		 363 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0490059  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26380  GTP-binding protein YchF  30.1 
 
 		 361 aa  100  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0845459 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2063  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.68 
 
 		 363 aa  100  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2592  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.59 
 
 		 364 aa  100  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000145967  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3547  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.79 
 
 		 366 aa  100  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4635  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.09 
 
 		 363 aa  99.8  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2444  GTP-binding protein YchF  30.11 
 
 		 363 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0781916  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1684  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.11 
 
 		 363 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000467912  normal  0.464774 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1367  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.11 
 
 		 363 aa  99.8  8e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.37474  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1350  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.11 
 
 		 363 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0630481  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2423  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.11 
 
 		 363 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0847638 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1939  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.11 
 
 		 363 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.256808  normal  0.0918473 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1308  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.11 
 
 		 363 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.253077  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01178  translation-associated GTPase  30.11 
 
 		 363 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2345  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.65 
 
 		 363 aa  99.4  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01188  hypothetical protein  30.11 
 
 		 363 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2765  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.65 
 
 		 364 aa  99.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3587  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.2 
 
 		 364 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1835  GTP-binding protein YchF  27.86 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000078734  normal  0.600832 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3871  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.28 
 
 		 358 aa  99  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.479028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1127  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.6 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.660689  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3569  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  31.2 
 
 		 364 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0823  GTP-binding protein YchF  27.65 
 
 		 369 aa  99  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13271  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.12 
 
 		 363 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2707  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.64 
 
 		 363 aa  98.2  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3611  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.13 
 
 		 364 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4015  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.42 
 
 		 366 aa  98.6  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.362655  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0349  GTPase, translation factor  27.3 
 
 		 366 aa  98.2  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0519  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.93 
 
 		 364 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1923  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.93 
 
 		 364 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.264442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1475  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  28.76 
 
 		 364 aa  97.8  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0116591 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0952  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.93 
 
 		 364 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3596  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.93 
 
 		 364 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0657  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.93 
 
 		 364 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5626  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.15 
 
 		 366 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000871672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5328  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.03 
 
 		 366 aa  97.4  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00440809  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5156  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.03 
 
 		 366 aa  97.4  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.474948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5172  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.03 
 
 		 366 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000341574  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3733  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.54 
 
 		 363 aa  97.4  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.316822 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0390  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  30.05 
 
 		 363 aa  97.4  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.997224  normal  0.0213751 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5333  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.15 
 
 		 366 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000128538  hitchhiker  0.000000465437 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5724  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.03 
 
 		 366 aa  97.4  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000153579  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5585  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.03 
 
 		 366 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000269 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2571  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  29.26 
 
 		 363 aa  97.4  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2121  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.73 
 
 		 365 aa  97.1  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1835  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.73 
 
 		 365 aa  97.4  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.259258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5663  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.03 
 
 		 366 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000189692  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0445  GTP-binding protein YchF  29.63 
 
 		 373 aa  97.4  4e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0330999  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>