87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0104 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0104  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  100 
 
 		 266 aa  532  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480375  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0867  Hrp conserved lipoprotein HRCJ transmembrane  34.96 
 
 		 269 aa  139  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.40629  hitchhiker  0.0038632 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42270  pscJ type III export protein  40.7 
 
 		 248 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01707  hypothetical protein  36.59 
 
 		 252 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0061  type III secretion apparatus lipoprotein YscJ  37.23 
 
 		 244 aa  138  7e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5637  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  40.09 
 
 		 264 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0759041 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5854  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  40.09 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003344  type III secretion bridge between inner and outermembrane lipoprotein (YscJ,HrcJ,EscJ PscJ)  35.83 
 
 		 247 aa  138  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.305492  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2991  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  39.31 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1993  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  41.71 
 
 		 269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1901  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  41.71 
 
 		 269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5936  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  39.18 
 
 		 287 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0650117 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0424  lipoprotein transmembrane protein  41.24 
 
 		 262 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00546168  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2432  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  39.01 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2202  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  38.33 
 
 		 284 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2285  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  38.33 
 
 		 284 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.118465  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0683  lipoprotein transmembrane protein  38.33 
 
 		 282 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0921981  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0747  lipoprotein transmembrane protein  37.76 
 
 		 285 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0239762  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03399  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  37.36 
 
 		 246 aa  116  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3822  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  37.3 
 
 		 243 aa  116  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3937  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  37.3 
 
 		 243 aa  115  5e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.861005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3910  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  37.3 
 
 		 243 aa  116  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1505  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  32.03 
 
 		 249 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1542  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  33.48 
 
 		 249 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.847712  normal  0.243621 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1520  type III secretion apparatus lipoprotein YscJ/HrcJ family  33.48 
 
 		 249 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0466  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  36.67 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1764  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  34.09 
 
 		 249 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.469381  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1934  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  35.71 
 
 		 249 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.464381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3744  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  34.25 
 
 		 293 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0261125  hitchhiker  0.00737074 
 
 
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NC_011353  ECH74115_5066  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  33.51 
 
 		 190 aa  109  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.164544 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1899  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  32.84 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2197  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  34.52 
 
 		 255 aa  106  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1384  type III secretion protein HrcJ  35.29 
 
 		 268 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5216  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  32.82 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0028  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  35.91 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1195  type III secretion protein HrcJ  33.49 
 
 		 268 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1962  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  33.87 
 
 		 239 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.945457  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2266  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  33.87 
 
 		 239 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5434  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  35.43 
 
 		 295 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119544  normal  0.0656048 
 
 
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NC_008061  Bcen_3516  Type III secretion system lipoprotein HrcJ/YscJ  35.43 
 
 		 292 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00184061  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_4850  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  35.43 
 
 		 292 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000793043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4225  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  35.43 
 
 		 309 aa  99.4  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.156632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4747  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  34.09 
 
 		 295 aa  99  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.315409  normal  0.53409 
 
 
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NC_007951  Bxe_A3126  secretory protein YscJ/FliF  33.71 
 
 		 281 aa  96.3  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0911453  hitchhiker  0.0031872 
 
 
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NC_010660  SbBS512_A0172  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  31.33 
 
 		 241 aa  86.7  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175289  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A0591  Type III secretion system protein  32.93 
 
 		 315 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000972206  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2182  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  32.93 
 
 		 315 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.956943  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0823  type III secretion system BasJ  32.93 
 
 		 315 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169884  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2054  type III secretion system BasJ  32.93 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793801  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2094  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  32.93 
 
 		 315 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1550  type III secretion system BasJ  32.93 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0733  type III secretion system BasJ  32.93 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.616821  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3060  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  31.69 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.135863 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2993  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  31.69 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.050718  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3076  type III secretion apparatus lipoprotein YscJ/HrcJ family  31.69 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000940676 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3024  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  31.69 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930142 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3181  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  31.69 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.521172 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4131  type III secretion apparatus lipoprotein EprK  31.58 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003306 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3177  type III secretion apparatus lipoprotein EprK  30.41 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0748  secretory protein YscJ/FliF family protein  33.15 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0534146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1951  type III secretion inner membrane protein SctJ  38.78 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0394609  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  31.05 
 
 		 590 aa  58.9  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0848  type III secretion protein SctJ  26.58 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  32.54 
 
 		 544 aa  53.9  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  31.95 
 
 		 544 aa  52.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1681  flagellar MS-ring protein  32.2 
 
 		 546 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  30.27 
 
 		 552 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1105  flagellar MS-ring protein  31.79 
 
 		 544 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0742  secretory protein YscJ/FliF family protein  34.09 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0584287  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31220  flagellar basal-body M-ring protein/flagellar hook-basal body protein FliF  34.74 
 
 		 530 aa  47  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0799735 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0706  secretory protein YscJ/FliF  32.54 
 
 		 239 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0389358  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1361  flagellar MS-ring protein  25.81 
 
 		 566 aa  46.2  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3225  flagellar MS-ring protein  31 
 
 		 572 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0389507  normal  0.995627 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3838  flagellar M-ring protein FliF  31.92 
 
 		 523 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  28.8 
 
 		 527 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0083  flagellar MS-ring protein  27.32 
 
 		 566 aa  43.5  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0137  flagellar M-ring protein FliF  27.81 
 
 		 513 aa  43.5  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0053  flagellar FliF M-ring protein  30.3 
 
 		 570 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1688  flagellar M-ring protein FliF  30.3 
 
 		 570 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00646799  hitchhiker  0.000845587 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2408  flagellar MS-ring protein  25.74 
 
 		 521 aa  43.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  28.71 
 
 		 580 aa  42.7  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16890  flagellar M-ring protein FliF  26.84 
 
 		 519 aa  42.7  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0743  secretory protein YscJ/FliF family protein  34.09 
 
 		 239 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112716  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_1650  flagellar M-ring protein FliF  29.52 
 
 		 537 aa  42.7  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.307384  normal  0.223803 
 
 
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NC_009831  Ssed_0077  flagellar MS-ring protein  26.09 
 
 		 570 aa  42.4  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008009  Acid345_1652  flagellar M-ring protein FliF  30.64 
 
 		 529 aa  42.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202816  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_0759  flagellar M-ring protein FliF  27.87 
 
 		 531 aa  42  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.853034  n/a   
 
 
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