65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0591 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2094  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  99.68 
 
 		 315 aa  620  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0591  Type III secretion system protein  100 
 
 		 315 aa  623  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000972206  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2182  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  98.73 
 
 		 315 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.956943  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2054  type III secretion system BasJ  97.47 
 
 		 316 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793801  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1550  type III secretion system BasJ  97.47 
 
 		 316 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0733  type III secretion system BasJ  97.47 
 
 		 316 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.616821  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0823  type III secretion system BasJ  94.29 
 
 		 315 aa  472  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169884  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4131  type III secretion apparatus lipoprotein EprK  46.12 
 
 		 244 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003306 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3177  type III secretion apparatus lipoprotein EprK  45.21 
 
 		 244 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2993  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  41.77 
 
 		 252 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.050718  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3024  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  41.77 
 
 		 252 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930142 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3060  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  41.77 
 
 		 252 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.135863 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3076  type III secretion apparatus lipoprotein YscJ/HrcJ family  41.77 
 
 		 252 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000940676 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3181  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  41.77 
 
 		 252 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.521172 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0172  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  48.84 
 
 		 241 aa  177  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175289  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1505  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  28.74 
 
 		 249 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2432  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  31.46 
 
 		 277 aa  96.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1764  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  29.39 
 
 		 249 aa  95.9  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.469381  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0061  type III secretion apparatus lipoprotein YscJ  29.79 
 
 		 244 aa  94.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2266  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  30.74 
 
 		 239 aa  94.4  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1962  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  29.75 
 
 		 239 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.945457  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1520  type III secretion apparatus lipoprotein YscJ/HrcJ family  29.65 
 
 		 249 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1542  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  29.65 
 
 		 249 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.847712  normal  0.243621 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3910  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  34.09 
 
 		 243 aa  93.6  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3937  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  30.21 
 
 		 243 aa  93.6  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.861005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3822  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  34.09 
 
 		 243 aa  93.6  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5936  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  31.58 
 
 		 287 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0650117 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5637  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  31.33 
 
 		 264 aa  92.8  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0759041 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5854  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  30.9 
 
 		 263 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1934  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  29.2 
 
 		 249 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.464381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2991  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  32.14 
 
 		 271 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1899  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  29.55 
 
 		 261 aa  86.3  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0466  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  29.28 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003344  type III secretion bridge between inner and outermembrane lipoprotein (YscJ,HrcJ,EscJ PscJ)  25.63 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.305492  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0867  Hrp conserved lipoprotein HRCJ transmembrane  29.89 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.40629  hitchhiker  0.0038632 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0104  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  30.42 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480375  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03399  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  29 
 
 		 246 aa  82  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1195  type III secretion protein HrcJ  35.56 
 
 		 268 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42270  pscJ type III export protein  27.71 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01707  hypothetical protein  29.61 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5066  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  32.11 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.164544 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2197  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  28.24 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0424  lipoprotein transmembrane protein  29.8 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00546168  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2285  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  29.55 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.118465  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3744  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  29.71 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0261125  hitchhiker  0.00737074 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0683  lipoprotein transmembrane protein  29.55 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0921981  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2202  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  29.55 
 
 		 284 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1993  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  29.8 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1901  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  29.8 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3126  secretory protein YscJ/FliF  27.17 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0911453  hitchhiker  0.0031872 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0028  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  33.61 
 
 		 272 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1384  type III secretion protein HrcJ  33.62 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5216  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  24.01 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0747  lipoprotein transmembrane protein  29.22 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0239762  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4747  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  31.43 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.315409  normal  0.53409 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3516  Type III secretion system lipoprotein HrcJ/YscJ  30.86 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00184061  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4225  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  30.86 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.156632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4850  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  30.86 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000793043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5434  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  30.86 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119544  normal  0.0656048 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0748  secretory protein YscJ/FliF family protein  28.19 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0534146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0742  secretory protein YscJ/FliF family protein  32.77 
 
 		 239 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0584287  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0848  type III secretion protein SctJ  22.22 
 
 		 328 aa  51.6  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0706  secretory protein YscJ/FliF  27.12 
 
 		 239 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0389358  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0743  secretory protein YscJ/FliF family protein  32.77 
 
 		 239 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112716  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1951  type III secretion inner membrane protein SctJ  27.96 
 
 		 174 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0394609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>