89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2991 on replicon NC_008741
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008741  Dvul_2991  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  100 
 
 		 271 aa  541  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2432  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  74.21 
 
 		 277 aa  368  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5854  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  37.07 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5637  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  37.5 
 
 		 264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0759041 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1993  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  44.25 
 
 		 269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A0424  lipoprotein transmembrane protein  44.25 
 
 		 262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00546168  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1901  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  44.25 
 
 		 269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01707  hypothetical protein  37.71 
 
 		 252 aa  162  7e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2202  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  41.48 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2285  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  41.48 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.118465  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0683  lipoprotein transmembrane protein  41.48 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0921981  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0747  lipoprotein transmembrane protein  42.11 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0239762  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003344  type III secretion bridge between inner and outermembrane lipoprotein (YscJ,HrcJ,EscJ PscJ)  36.59 
 
 		 247 aa  156  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.305492  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42270  pscJ type III export protein  43.09 
 
 		 248 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0061  type III secretion apparatus lipoprotein YscJ  41.54 
 
 		 244 aa  155  8e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5936  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  38.69 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0650117 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0466  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  43.02 
 
 		 287 aa  148  8e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0867  Hrp conserved lipoprotein HRCJ transmembrane  37.77 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.40629  hitchhiker  0.0038632 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03399  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  40.8 
 
 		 246 aa  142  7e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0104  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  39.2 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480375  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5216  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  39.67 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3744  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  33.85 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0261125  hitchhiker  0.00737074 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1934  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  32.04 
 
 		 249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.464381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1764  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  31.73 
 
 		 249 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.469381  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1505  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  29.2 
 
 		 249 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1542  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  32.04 
 
 		 249 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.847712  normal  0.243621 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1520  type III secretion apparatus lipoprotein YscJ/HrcJ family  32.04 
 
 		 249 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3822  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  37.3 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3937  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  37.3 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.861005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3910  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  37.3 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1962  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  33.33 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.945457  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2266  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  32.43 
 
 		 239 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1195  type III secretion protein HrcJ  38.3 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0028  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  38.57 
 
 		 272 aa  122  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1899  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  37.1 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2197  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  38.25 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3126  secretory protein YscJ/FliF  37.22 
 
 		 281 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0911453  hitchhiker  0.0031872 
 
 
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NC_004578  PSPTO_1384  type III secretion protein HrcJ  37.29 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4225  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  36.57 
 
 		 309 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.156632  normal  1 
 
 
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NC_010552  BamMC406_4747  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  36.57 
 
 		 295 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.315409  normal  0.53409 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5434  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  36.57 
 
 		 295 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119544  normal  0.0656048 
 
 
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NC_008061  Bcen_3516  Type III secretion system lipoprotein HrcJ/YscJ  36.57 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00184061  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_4850  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  36.57 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000793043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5066  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  33.52 
 
 		 190 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.164544 
 
 
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NC_011083  SeHA_C3060  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  34.07 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.135863 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3076  type III secretion apparatus lipoprotein YscJ/HrcJ family  34.07 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000940676 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3181  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  34.07 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.521172 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3024  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  34.07 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930142 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2993  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  33.33 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.050718  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4131  type III secretion apparatus lipoprotein EprK  30.54 
 
 		 244 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003306 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3177  type III secretion apparatus lipoprotein EprK  30.13 
 
 		 244 aa  92  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1550  type III secretion system BasJ  31.76 
 
 		 316 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2054  type III secretion system BasJ  31.76 
 
 		 316 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793801  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0823  type III secretion system BasJ  31.76 
 
 		 315 aa  89.7  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169884  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2094  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  31.76 
 
 		 315 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0733  type III secretion system BasJ  31.76 
 
 		 316 aa  90.1  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.616821  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0591  Type III secretion system protein  31.76 
 
 		 315 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000972206  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2182  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  31.76 
 
 		 315 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.956943  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1951  type III secretion inner membrane protein SctJ  40.86 
 
 		 174 aa  85.5  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0394609  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0748  secretory protein YscJ/FliF family protein  34.78 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0534146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0172  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  27.4 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175289  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0848  type III secretion protein SctJ  25.81 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0742  secretory protein YscJ/FliF family protein  35.77 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0584287  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0706  secretory protein YscJ/FliF  34.86 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0389358  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0743  secretory protein YscJ/FliF family protein  35.77 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112716  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1681  flagellar MS-ring protein  30.18 
 
 		 546 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0035  flagellar MS-ring protein  31.95 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0608  flagellar MS-ring protein  31.52 
 
 		 570 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.269822  normal  0.0804297 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0629  flagellar MS-ring protein  30.91 
 
 		 559 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.252464 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0640  flagellar MS-ring protein  30.91 
 
 		 559 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.378287  normal  0.0508656 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2689  flagellar MS-ring protein  29.41 
 
 		 547 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.677442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1105  flagellar MS-ring protein  29.94 
 
 		 544 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0038  flagellar M-ring protein FliF  27.27 
 
 		 505 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.796687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2936  flagellar M-ring protein FliF  27.64 
 
 		 551 aa  49.3  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1475  flagellar M-ring protein FliF  26.82 
 
 		 520 aa  46.6  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4068  flagellar MS-ring protein  28.57 
 
 		 568 aa  46.6  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3225  flagellar MS-ring protein  28.4 
 
 		 572 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0389507  normal  0.995627 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1051  flagellar MS-ring protein  30.91 
 
 		 568 aa  46.6  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1146  flagellar MS-ring protein  30.91 
 
 		 580 aa  46.2  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.29702  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0759  flagellar M-ring protein FliF  28.49 
 
 		 531 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.853034  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1394  flagellar M-ring protein FliF  32.39 
 
 		 533 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0124624  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1129  flagellar MS-ring protein  29.7 
 
 		 553 aa  44.7  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1652  flagellar M-ring protein FliF  29.88 
 
 		 529 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.202816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4200  flagellar MS-ring protein  29.7 
 
 		 579 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  27.03 
 
 		 552 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0771  flagellar MS-ring protein  30.1 
 
 		 524 aa  43.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107573 
 
 
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NC_012850  Rleg_0337  flagellar MS-ring protein  27.32 
 
 		 563 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.548751  normal  0.254086 
 
 
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NC_011369  Rleg2_0305  flagellar MS-ring protein  26.78 
 
 		 563 aa  42.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.243877  normal  1 
 
 
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NC_012793  GWCH70_1111  flagellar MS-ring protein  28.57 
 
 		 527 aa  42.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.330038  n/a   
 
 
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