65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4131 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_4131  type III secretion apparatus lipoprotein EprK  100 
 
 
244 aa  499  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0003306 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3177  type III secretion apparatus lipoprotein EprK  98.36 
 
 
244 aa  491  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3181  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  53.68 
 
 
252 aa  250  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.521172 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2993  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  53.68 
 
 
252 aa  250  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.050718  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3076  type III secretion apparatus lipoprotein YscJ/HrcJ family  53.68 
 
 
252 aa  250  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000940676 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3024  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  53.68 
 
 
252 aa  250  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00930142 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3060  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  53.68 
 
 
252 aa  250  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.135863 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0172  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  44.8 
 
 
241 aa  199  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0175289  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0823  type III secretion system BasJ  45.79 
 
 
315 aa  198  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169884  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2094  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  45.79 
 
 
315 aa  198  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0733  type III secretion system BasJ  45.79 
 
 
316 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.616821  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2054  type III secretion system BasJ  45.79 
 
 
316 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793801  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0591  Type III secretion system protein  45.79 
 
 
315 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000972206  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1550  type III secretion system BasJ  45.79 
 
 
316 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2182  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  45.79 
 
 
315 aa  197  9e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.956943  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0061  type III secretion apparatus lipoprotein YscJ  32.98 
 
 
244 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1542  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  32.79 
 
 
249 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.847712  normal  0.243621 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1764  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  32.79 
 
 
249 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.469381  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1520  type III secretion apparatus lipoprotein YscJ/HrcJ family  32.79 
 
 
249 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1934  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  32.79 
 
 
249 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.464381  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2432  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  31.96 
 
 
277 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1505  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  32.79 
 
 
249 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3910  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  32.61 
 
 
243 aa  98.6  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3937  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  32.61 
 
 
243 aa  98.6  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.861005  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3822  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  32.61 
 
 
243 aa  98.6  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1962  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  34.02 
 
 
239 aa  97.1  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.945457  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01707  hypothetical protein  28.93 
 
 
252 aa  97.1  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2266  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  33.61 
 
 
239 aa  96.3  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003344  type III secretion bridge between inner and outermembrane lipoprotein (YscJ,HrcJ,EscJ PscJ)  32.22 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.305492  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42270  pscJ type III export protein  32.16 
 
 
248 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2991  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  31.77 
 
 
271 aa  92.8  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0867  Hrp conserved lipoprotein HRCJ transmembrane  30.94 
 
 
269 aa  85.5  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.40629  hitchhiker  0.0038632 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1899  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  30.11 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2197  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  29.07 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5637  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  29.19 
 
 
264 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0759041 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2202  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  29.38 
 
 
284 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357372  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0683  lipoprotein transmembrane protein  29.38 
 
 
282 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0921981  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2285  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  29.38 
 
 
284 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.118465  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0466  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  30.64 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1195  type III secretion protein HrcJ  28.26 
 
 
268 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.105142 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5854  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  28.65 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5936  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  29.53 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0650117 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0747  lipoprotein transmembrane protein  30.23 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0239762  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3126  secretory protein YscJ/FliF  28.9 
 
 
281 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0911453  hitchhiker  0.0031872 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0104  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  32.02 
 
 
266 aa  77  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.480375  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5066  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  30.27 
 
 
190 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.164544 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0424  lipoprotein transmembrane protein  26.88 
 
 
262 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00546168  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0028  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  26.63 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1901  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  26.34 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1993  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  26.34 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03399  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  28.32 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5216  type III secretion apparatus lipoprotein, YscJ/HrcJ family  24.19 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1384  type III secretion protein HrcJ  25.61 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0748  secretory protein YscJ/FliF family protein  32.31 
 
 
239 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0534146  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0742  secretory protein YscJ/FliF family protein  32.48 
 
 
239 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0584287  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3744  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  25.43 
 
 
293 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0261125  hitchhiker  0.00737074 
 
 
-
 
NC_002620  TC0848  type III secretion protein SctJ  23.25 
 
 
328 aa  56.6  0.0000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0706  secretory protein YscJ/FliF  33.33 
 
 
239 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0389358  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0743  secretory protein YscJ/FliF family protein  31.62 
 
 
239 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112716  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4747  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  26.01 
 
 
295 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.315409  normal  0.53409 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4225  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  26.01 
 
 
309 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.156632  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4850  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  25.43 
 
 
292 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000793043  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3516  Type III secretion system lipoprotein HrcJ/YscJ  25.43 
 
 
292 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00184061  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5434  YscJ/HrcJ family type III secretion apparatus lipoprotein  25.43 
 
 
295 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119544  normal  0.0656048 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1951  type III secretion inner membrane protein SctJ  28.26 
 
 
174 aa  42.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0394609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>