More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2920 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2887  BCCT transporter  69.57 
 
 		 529 aa  691    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2888  BCCT transporter  73.49 
 
 		 555 aa  731    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.696836  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2920  BCCT transporter  100 
 
 		 518 aa  1021    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00190717  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3860  BCCT family transporter  50.78 
 
 		 519 aa  508  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.99321  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0815  BCCT transporter  50.1 
 
 		 530 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.820785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2126  BCCT transporter  49.08 
 
 		 533 aa  499  1e-140  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00109884  hitchhiker  0.00218719 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1238  BCCT transporter  49.49 
 
 		 554 aa  493  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332872 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0335  BCCT transporter  49.7 
 
 		 534 aa  479  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.568613  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5569  osmoprotectant transporter, BCCT family  49.5 
 
 		 522 aa  476  1e-133  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0875  glycine betaine transporter OpuD  48.67 
 
 		 524 aa  478  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0576373  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1813  BCCT transporter  48.67 
 
 		 561 aa  476  1e-133  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.566263 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5380  osmoprotectant transporter, BCCT family  49.5 
 
 		 522 aa  478  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.274616  normal  0.0982886 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5577  BCCT family osmoprotectant transporter  47.5 
 
 		 522 aa  474  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5298  BCCT family osmoprotectant transporter  47.7 
 
 		 522 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5125  BCCT family osmoprotectant transporter  47.7 
 
 		 522 aa  472  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5140  BCCT family osmoprotectant transporter  46.97 
 
 		 522 aa  472  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5694  BCCT family osmoprotectant transporter  47.7 
 
 		 522 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5539  osmoprotectant transporter, BCCT family  47.7 
 
 		 522 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5237  BCCT transporter  47.7 
 
 		 522 aa  473  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5625  osmoprotectant transporter, BCCT family  47.31 
 
 		 522 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000659  putative glycine betaine transporter  48.77 
 
 		 528 aa  468  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3383  BCCT transporter  49.6 
 
 		 514 aa  466  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.198067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06536  choline/carnitine/betaine transporter  47.36 
 
 		 539 aa  462  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3674  BCCT transporter  46.17 
 
 		 549 aa  456  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0579  choline-glycine betaine transporter  48.37 
 
 		 519 aa  437  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2692  BCCT family transporter  44.82 
 
 		 516 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3060  BCCT transporter  44.82 
 
 		 516 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.892998  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2467  BCCT transporter  41.92 
 
 		 537 aa  350  5e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0251  BCCT family glycine betaine transporter  40.81 
 
 		 516 aa  328  2.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0223  BCCT family glycine betaine transporter  41.03 
 
 		 518 aa  319  1e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16031  hypothetical protein  35.67 
 
 		 519 aa  312  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.034717  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05503  choline/carnitine/betaine transporter  46.25 
 
 		 341 aa  276  9e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  32.63 
 
 		 520 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  32.63 
 
 		 520 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  31.87 
 
 		 531 aa  232  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  33.01 
 
 		 573 aa  231  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  30.1 
 
 		 526 aa  231  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12990  choline transporter  30.5 
 
 		 653 aa  224  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.283179 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1174  choline transporter  31.21 
 
 		 671 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  31.01 
 
 		 530 aa  223  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  30.57 
 
 		 538 aa  223  6e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  32.07 
 
 		 503 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  30.43 
 
 		 545 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  33.27 
 
 		 508 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0247  BCCT transporter  31.16 
 
 		 666 aa  219  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.442957  normal  0.516419 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  31.6 
 
 		 531 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  29.72 
 
 		 551 aa  216  5.9999999999999996e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  31.73 
 
 		 546 aa  216  9e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  29.17 
 
 		 490 aa  216  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  30.2 
 
 		 661 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  29.82 
 
 		 659 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  29.82 
 
 		 659 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4827  BCCT transporter  30.53 
 
 		 664 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.767861 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  32.07 
 
 		 637 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1904  choline/carnitine/betaine transporter  31.94 
 
 		 678 aa  213  7.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0079  choline/carnitine/betaine transporter  29.02 
 
 		 558 aa  212  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5269  choline transporter  30.51 
 
 		 664 aa  211  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0600  choline/carnitine/betaine transporter  30.92 
 
 		 584 aa  211  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000857259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4071  choline/carnitine/betaine transporter  31.71 
 
 		 650 aa  211  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5310  choline/carnitine/betaine transporter  30.91 
 
 		 698 aa  211  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.910175  normal  0.618905 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0224  high-affinity choline transport protein  30.1 
 
 		 644 aa  210  4e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  29.38 
 
 		 506 aa  210  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1003  choline/carnitine/betaine transporter  30.33 
 
 		 553 aa  210  5e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0190  BCCT transporter  28.6 
 
 		 525 aa  210  5e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  30.95 
 
 		 497 aa  209  8e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1121  choline/carnitine/betaine transporter  31.39 
 
 		 611 aa  209  9e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4104  choline/carnitine/betaine transporter  31.33 
 
 		 650 aa  209  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1384  choline/carnitine/betaine transporter  33.57 
 
 		 524 aa  209  1e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.095402  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00106  putative choline-glycine betaine transporter  31.91 
 
 		 586 aa  208  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  30.06 
 
 		 606 aa  208  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4045  choline/carnitine/betaine transporter  33.7 
 
 		 673 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.57128 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2648  choline/carnitine/betaine transporter  29.53 
 
 		 534 aa  208  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  30 
 
 		 661 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0022  choline/carnitine/betaine transporter  29.3 
 
 		 580 aa  208  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.499144 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  31.97 
 
 		 656 aa  208  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  29.76 
 
 		 550 aa  207  3e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2914  choline/carnitine/betaine transporter  31.13 
 
 		 611 aa  207  5e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.34631  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  27.68 
 
 		 657 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  30.99 
 
 		 548 aa  206  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0654  choline/carnitine/betaine transport  30.75 
 
 		 544 aa  206  6e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  30.99 
 
 		 548 aa  206  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000212445  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4754  BCCT transporter  30.37 
 
 		 552 aa  206  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22610  choline/carnitine/betaine transport  29.85 
 
 		 663 aa  206  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.524203  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2029  choline/carnitine/betaine transporter  29.53 
 
 		 558 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3360  choline/carnitine/betaine transporter  32.11 
 
 		 676 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0225578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1109  choline/carnitine/betaine transporter  30.18 
 
 		 676 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507446  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4430  choline/carnitine/betaine transporter  32.3 
 
 		 691 aa  204  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3341  choline/carnitine/betaine transporter  29.62 
 
 		 637 aa  204  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1874  BCCT transporter  33.47 
 
 		 676 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0838618  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1485  choline/carnitine/betaine transporter  29.71 
 
 		 580 aa  204  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00724238  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2261  choline/carnitine/betaine transporter  30.25 
 
 		 671 aa  204  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0066  choline/carnitine/betaine transporter  31.24 
 
 		 583 aa  203  7e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.432279  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13010  choline/carnitine/betaine transport  30.49 
 
 		 603 aa  202  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.639384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2906  choline/carnitine/betaine transporter  28.88 
 
 		 577 aa  202  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0223  choline transport protein BetT  30.52 
 
 		 686 aa  202  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0875  choline/carnitine/betaine transport  29.42 
 
 		 681 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0309  choline/carnitine/betaine transporter  32.71 
 
 		 552 aa  202  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.670789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4983  choline/carnitine/betaine transporter  30.06 
 
 		 665 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.684113  normal  0.911624 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0244  choline/carnitine/betaine transporter  29.5 
 
 		 667 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.300044  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0229  choline/carnitine/betaine transporter  29.67 
 
 		 653 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00896074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>