More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_16031 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_16031  hypothetical protein  100 
 
 		 519 aa  1013    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.034717  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0223  BCCT family glycine betaine transporter  61.6 
 
 		 518 aa  572  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0251  BCCT family glycine betaine transporter  60.24 
 
 		 516 aa  569  1e-161  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5577  BCCT family osmoprotectant transporter  38.48 
 
 		 522 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5539  osmoprotectant transporter, BCCT family  38.28 
 
 		 522 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3860  BCCT family transporter  37.38 
 
 		 519 aa  368  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.99321  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5298  BCCT family osmoprotectant transporter  38.28 
 
 		 522 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5694  BCCT family osmoprotectant transporter  38.28 
 
 		 522 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5625  osmoprotectant transporter, BCCT family  38.28 
 
 		 522 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5140  BCCT family osmoprotectant transporter  38.28 
 
 		 522 aa  365  1e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5125  BCCT family osmoprotectant transporter  38.28 
 
 		 522 aa  364  2e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5237  BCCT transporter  38.08 
 
 		 522 aa  364  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5380  osmoprotectant transporter, BCCT family  39.28 
 
 		 522 aa  362  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.274616  normal  0.0982886 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5569  osmoprotectant transporter, BCCT family  39.08 
 
 		 522 aa  361  2e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3674  BCCT transporter  37.35 
 
 		 549 aa  351  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0815  BCCT transporter  37.34 
 
 		 530 aa  348  1e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.820785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0335  BCCT transporter  35.34 
 
 		 534 aa  348  2e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.568613  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2126  BCCT transporter  36.15 
 
 		 533 aa  347  2e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00109884  hitchhiker  0.00218719 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1813  BCCT transporter  38.68 
 
 		 561 aa  344  2e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.566263 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000659  putative glycine betaine transporter  36.99 
 
 		 528 aa  344  2.9999999999999997e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06536  choline/carnitine/betaine transporter  36.94 
 
 		 539 aa  342  8e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1238  BCCT transporter  36.23 
 
 		 554 aa  342  8e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332872 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0875  glycine betaine transporter OpuD  38.38 
 
 		 524 aa  339  5.9999999999999996e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0576373  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3383  BCCT transporter  37.67 
 
 		 514 aa  332  7.000000000000001e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.198067  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2692  BCCT family transporter  39.39 
 
 		 516 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3060  BCCT transporter  38.85 
 
 		 516 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.892998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0579  choline-glycine betaine transporter  36.48 
 
 		 519 aa  310  5e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2888  BCCT transporter  34.44 
 
 		 555 aa  310  5.9999999999999995e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.696836  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2920  BCCT transporter  38.44 
 
 		 518 aa  294  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00190717  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2467  BCCT transporter  37.69 
 
 		 537 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2887  BCCT transporter  34.36 
 
 		 529 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  33.05 
 
 		 546 aa  234  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0600  choline/carnitine/betaine transporter  31.11 
 
 		 584 aa  233  8.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000857259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  30.82 
 
 		 551 aa  229  6e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  32.29 
 
 		 505 aa  226  9e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  32.29 
 
 		 505 aa  226  9e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  33.77 
 
 		 494 aa  225  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  32.68 
 
 		 505 aa  225  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  32.29 
 
 		 505 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  31.15 
 
 		 516 aa  223  7e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  32.29 
 
 		 505 aa  223  8e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  32.29 
 
 		 505 aa  223  9e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  32.29 
 
 		 505 aa  223  9e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  32.29 
 
 		 505 aa  223  9e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  32.29 
 
 		 504 aa  223  9e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  32.66 
 
 		 504 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  31.24 
 
 		 520 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  31.99 
 
 		 504 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  31.24 
 
 		 520 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  31.08 
 
 		 606 aa  221  3e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  31.93 
 
 		 503 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  31.91 
 
 		 532 aa  220  5e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  30.9 
 
 		 657 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  30.12 
 
 		 516 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000015754  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  32.77 
 
 		 548 aa  218  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000212445  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  32.77 
 
 		 548 aa  218  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0590  glycine betaine transporter  30.04 
 
 		 516 aa  216  5e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0522  glycine betaine transporter  30.43 
 
 		 516 aa  216  8e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  30.43 
 
 		 516 aa  216  8e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0022  choline/carnitine/betaine transporter  31.11 
 
 		 580 aa  216  9e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.499144 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0683  glycine betaine transporter  30.21 
 
 		 516 aa  216  9e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  31.98 
 
 		 498 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  31.96 
 
 		 526 aa  215  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4749  glycine betaine transporter  29.84 
 
 		 516 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0790865 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  30.21 
 
 		 516 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  30.21 
 
 		 516 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000010169  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  32.88 
 
 		 545 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  30.21 
 
 		 516 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  29.84 
 
 		 567 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13010  choline/carnitine/betaine transport  29.71 
 
 		 603 aa  214  3.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.639384 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  30.69 
 
 		 661 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1003  choline/carnitine/betaine transporter  32.99 
 
 		 553 aa  211  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0727  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  29.47 
 
 		 681 aa  210  5e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  30.73 
 
 		 542 aa  210  6e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3164  choline/carnitine/betaine transporter  33.5 
 
 		 660 aa  209  9e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06510  choline/carnitine/betaine transport  33.33 
 
 		 642 aa  209  1e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  30.89 
 
 		 659 aa  208  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  31.12 
 
 		 661 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22610  choline/carnitine/betaine transport  31.22 
 
 		 663 aa  208  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.524203  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  30.89 
 
 		 659 aa  207  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  29.87 
 
 		 530 aa  207  4e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  31.09 
 
 		 637 aa  207  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  32.47 
 
 		 606 aa  206  6e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10935  glycine betaine transport integral membrane protein betP  31.71 
 
 		 593 aa  206  6e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  34.15 
 
 		 530 aa  206  7e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  31.19 
 
 		 550 aa  206  7e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0079  choline/carnitine/betaine transporter  29.81 
 
 		 558 aa  206  9e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  30.83 
 
 		 523 aa  206  9e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1282  transporter, BCCT family  29.71 
 
 		 534 aa  206  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0875  choline/carnitine/betaine transport  29.96 
 
 		 681 aa  205  1e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  31.51 
 
 		 656 aa  205  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1610  hypothetical protein  31.07 
 
 		 646 aa  205  2e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00096761  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1505  choline/carnitine/betaine transporter  33.17 
 
 		 668 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  29.84 
 
 		 506 aa  205  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1909  choline/carnitine/betaine transport  31.71 
 
 		 660 aa  204  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.30039  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  30.02 
 
 		 667 aa  203  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0980  choline/carnitine/betaine transport  31.55 
 
 		 548 aa  203  6e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02380  choline/carnitine/betaine transport  31.04 
 
 		 664 aa  203  6e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.136626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  31.37 
 
 		 508 aa  203  6e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0237  choline/carnitine/betaine transporter  32.16 
 
 		 550 aa  203  7e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000527978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>