More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2098 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  80.12 
 
 		 503 aa  823    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  100 
 
 		 498 aa  992    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  63.33 
 
 		 505 aa  641    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  62.73 
 
 		 505 aa  633  1e-180  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  62.32 
 
 		 505 aa  631  1e-180  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  62.32 
 
 		 505 aa  631  1e-180  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  62.12 
 
 		 504 aa  632  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  62.32 
 
 		 505 aa  631  1e-180  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  62.32 
 
 		 505 aa  631  1e-180  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  61.72 
 
 		 504 aa  629  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  61.92 
 
 		 505 aa  626  1e-178  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  61.92 
 
 		 505 aa  626  1e-178  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  61.52 
 
 		 504 aa  621  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  53.4 
 
 		 516 aa  560  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  52.4 
 
 		 532 aa  551  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  52.8 
 
 		 516 aa  551  1e-155  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000015754  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  52.4 
 
 		 516 aa  550  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  52.4 
 
 		 516 aa  550  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000010169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  52.4 
 
 		 516 aa  550  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0683  glycine betaine transporter  52.2 
 
 		 516 aa  548  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4749  glycine betaine transporter  52.2 
 
 		 516 aa  550  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0790865 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0522  glycine betaine transporter  52.2 
 
 		 516 aa  548  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  52.2 
 
 		 516 aa  548  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0590  glycine betaine transporter  52 
 
 		 516 aa  546  1e-154  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  58.44 
 
 		 523 aa  531  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  50.91 
 
 		 490 aa  491  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  51.52 
 
 		 508 aa  477  1e-133  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  50.89 
 
 		 548 aa  475  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000212445  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  50.89 
 
 		 548 aa  475  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  50.73 
 
 		 546 aa  470  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  48.7 
 
 		 506 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  49.5 
 
 		 497 aa  457  1e-127  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  48.16 
 
 		 531 aa  455  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  48.27 
 
 		 659 aa  449  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  48.27 
 
 		 659 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0757  choline/carnitine/betaine transport  53.83 
 
 		 525 aa  450  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26622  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  47.39 
 
 		 520 aa  437  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  47.39 
 
 		 520 aa  437  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1765  choline/carnitine/betaine transporter  44.87 
 
 		 573 aa  436  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2906  choline/carnitine/betaine transporter  46.28 
 
 		 577 aa  434  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  43.71 
 
 		 530 aa  431  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  44.49 
 
 		 494 aa  430  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4702  choline/carnitine/betaine transporter  43.98 
 
 		 583 aa  428  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.911193  decreased coverage  0.0031512 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  45.09 
 
 		 600 aa  429  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  47.12 
 
 		 531 aa  428  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3326  choline/carnitine/betaine transporter  49.68 
 
 		 525 aa  427  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188195  normal  0.774831 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0654  choline/carnitine/betaine transport  47.89 
 
 		 544 aa  425  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1356  choline/carnitine/betaine transport  45.22 
 
 		 582 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379286  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2609  choline/carnitine/betaine transporter  44.06 
 
 		 573 aa  424  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0501554  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1374  choline/carnitine/betaine transporter  45.22 
 
 		 582 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796407  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1390  choline/carnitine/betaine transporter  45.02 
 
 		 582 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.211195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6409  choline/carnitine/betaine transporter  43.33 
 
 		 585 aa  419  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  45.05 
 
 		 542 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  43.08 
 
 		 551 aa  415  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2105  choline/carnitine/betaine transporter  43.43 
 
 		 581 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  44.05 
 
 		 530 aa  414  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  46.2 
 
 		 637 aa  413  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1132  choline/carnitine/betaine transporter  44.74 
 
 		 574 aa  412  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  46.32 
 
 		 573 aa  413  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3628  choline/carnitine/betaine transporter  43.43 
 
 		 581 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  46.19 
 
 		 657 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0044  choline/carnitine/betaine transporter  43.25 
 
 		 610 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  44.93 
 
 		 550 aa  409  1e-113  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  42.48 
 
 		 526 aa  410  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2288  choline/carnitine/betaine transporter  43.23 
 
 		 582 aa  411  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529795 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25390  choline/carnitine/betaine transport  46.79 
 
 		 514 aa  407  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.229483  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2025  choline/carnitine/betaine transporter  48.38 
 
 		 533 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1384  choline/carnitine/betaine transporter  47.77 
 
 		 524 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.095402  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  43.35 
 
 		 538 aa  404  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  45.63 
 
 		 545 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1441  choline/carnitine/betaine transporter  47.64 
 
 		 658 aa  402  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2676  choline/carnitine/betaine transporter  42.13 
 
 		 582 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1337  choline/carnitine/betaine transport  47.47 
 
 		 687 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0154  choline/carnitine/betaine transporter  46.33 
 
 		 682 aa  401  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  45.57 
 
 		 606 aa  400  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13010  choline/carnitine/betaine transport  45.33 
 
 		 603 aa  400  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.639384 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1542  choline/carnitine/betaine transporter  45.76 
 
 		 658 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.869304  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2804  choline/carnitine/betaine transporter  45.76 
 
 		 658 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1122  transporter, BCCT family protein  50.88 
 
 		 515 aa  395  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1576  choline/carnitine/betaine transporter  45.76 
 
 		 658 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.823699 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1109  choline/carnitine/betaine transporter  43.84 
 
 		 676 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507446  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00590  choline/carnitine/betaine transport  44.18 
 
 		 592 aa  396  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0767816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0174  choline/carnitine/betaine transporter  45.27 
 
 		 541 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.525828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0022  choline/carnitine/betaine transporter  45.38 
 
 		 580 aa  396  1e-109  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.499144 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  45.51 
 
 		 685 aa  396  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1505  choline/carnitine/betaine transporter  47.11 
 
 		 668 aa  392  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1485  choline/carnitine/betaine transporter  41.73 
 
 		 580 aa  392  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00724238  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1909  choline/carnitine/betaine transport  47.29 
 
 		 660 aa  394  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.30039  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1362  choline/carnitine/betaine transport  47.89 
 
 		 673 aa  392  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000623924  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  42.42 
 
 		 667 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2552  choline/carnitine/betaine transporter  45.79 
 
 		 658 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  45.34 
 
 		 661 aa  395  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  42.31 
 
 		 538 aa  393  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2719  choline/carnitine/betaine transporter  45.79 
 
 		 658 aa  393  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3164  choline/carnitine/betaine transporter  46.58 
 
 		 660 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1301  BCCT family betaine/choline/carnitine/glycine transporter  45.55 
 
 		 682 aa  391  1e-107  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5310  choline/carnitine/betaine transporter  42.17 
 
 		 698 aa  391  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.910175  normal  0.618905 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3716  choline/carnitine/betaine transporter  41.7 
 
 		 629 aa  389  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.903721  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0240  choline/carnitine/betaine transporter  48.44 
 
 		 662 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1546  choline/carnitine/betaine transporter  45.55 
 
 		 658 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>