More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3326 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3326  choline/carnitine/betaine transporter  100 
 
 		 525 aa  1038    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188195  normal  0.774831 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  47.13 
 
 		 523 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  47.2 
 
 		 503 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2025  choline/carnitine/betaine transporter  52.92 
 
 		 533 aa  456  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  48.35 
 
 		 498 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  43.8 
 
 		 490 aa  436  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4749  glycine betaine transporter  43.55 
 
 		 516 aa  427  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0790865 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  43.16 
 
 		 516 aa  422  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  43.16 
 
 		 516 aa  422  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000010169  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  43.14 
 
 		 516 aa  424  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  44.91 
 
 		 508 aa  422  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  43.16 
 
 		 516 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  38.2 
 
 		 530 aa  420  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  42.77 
 
 		 516 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000015754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0522  glycine betaine transporter  42.97 
 
 		 516 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  42.66 
 
 		 532 aa  419  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  42.97 
 
 		 516 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0590  glycine betaine transporter  42.77 
 
 		 516 aa  421  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0683  glycine betaine transporter  42.97 
 
 		 516 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  43.4 
 
 		 505 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  43.19 
 
 		 505 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  43.4 
 
 		 505 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  43.4 
 
 		 505 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  43.4 
 
 		 505 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  43.4 
 
 		 505 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  43.4 
 
 		 505 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  43.7 
 
 		 504 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  43.49 
 
 		 504 aa  414  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  44.66 
 
 		 504 aa  414  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  43.84 
 
 		 505 aa  413  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0654  choline/carnitine/betaine transport  41.41 
 
 		 544 aa  409  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  43.53 
 
 		 497 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  43.53 
 
 		 531 aa  403  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0757  choline/carnitine/betaine transport  46.68 
 
 		 525 aa  397  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26622  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  41.58 
 
 		 506 aa  397  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  42.68 
 
 		 600 aa  394  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  40.55 
 
 		 657 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  44.4 
 
 		 531 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2906  choline/carnitine/betaine transporter  43.03 
 
 		 577 aa  387  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  41.41 
 
 		 573 aa  386  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  41.74 
 
 		 659 aa  387  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  41.53 
 
 		 659 aa  385  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  39.15 
 
 		 546 aa  385  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1765  choline/carnitine/betaine transporter  45.22 
 
 		 573 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4702  choline/carnitine/betaine transporter  43.72 
 
 		 583 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.911193  decreased coverage  0.0031512 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  38.56 
 
 		 548 aa  378  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000212445  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  37.78 
 
 		 551 aa  377  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  40.23 
 
 		 520 aa  376  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  38.56 
 
 		 548 aa  378  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  40.23 
 
 		 520 aa  376  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1874  BCCT transporter  43.52 
 
 		 676 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0838618  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  41.34 
 
 		 656 aa  375  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2609  choline/carnitine/betaine transporter  41.82 
 
 		 573 aa  372  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0501554  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4430  choline/carnitine/betaine transporter  43.66 
 
 		 691 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3360  choline/carnitine/betaine transporter  43.72 
 
 		 676 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0225578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1109  choline/carnitine/betaine transporter  40.57 
 
 		 676 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507446  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  39.13 
 
 		 637 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4045  choline/carnitine/betaine transporter  43.93 
 
 		 673 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.57128 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1132  choline/carnitine/betaine transporter  40.86 
 
 		 574 aa  371  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1485  choline/carnitine/betaine transporter  38.94 
 
 		 580 aa  368  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00724238  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6409  choline/carnitine/betaine transporter  39.07 
 
 		 585 aa  368  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  40.16 
 
 		 538 aa  366  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  40.9 
 
 		 606 aa  369  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0079  choline/carnitine/betaine transporter  39.88 
 
 		 558 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1390  choline/carnitine/betaine transporter  43.5 
 
 		 582 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.211195 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25390  choline/carnitine/betaine transport  40.45 
 
 		 514 aa  365  1e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.229483  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00590  choline/carnitine/betaine transport  40.45 
 
 		 592 aa  365  1e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0767816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1356  choline/carnitine/betaine transport  43.5 
 
 		 582 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379286  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1374  choline/carnitine/betaine transporter  43.5 
 
 		 582 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796407  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4210  choline/carnitine/betaine transport  44.13 
 
 		 676 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157306  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4156  choline/carnitine/betaine transporter  44.13 
 
 		 676 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87836  normal  0.0109397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5310  choline/carnitine/betaine transporter  41.44 
 
 		 698 aa  364  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.910175  normal  0.618905 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3341  choline/carnitine/betaine transporter  39.74 
 
 		 637 aa  364  3e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  40 
 
 		 667 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  37.21 
 
 		 542 aa  362  8e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  40.29 
 
 		 494 aa  362  1e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0727  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  38.25 
 
 		 681 aa  361  2e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06510  choline/carnitine/betaine transport  41.47 
 
 		 642 aa  361  2e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1122  transporter, BCCT family protein  47.32 
 
 		 515 aa  360  3e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  41.89 
 
 		 606 aa  360  3e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  39.26 
 
 		 685 aa  360  3e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  40 
 
 		 661 aa  360  5e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0174  choline/carnitine/betaine transporter  40.88 
 
 		 541 aa  360  5e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.525828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3532  choline/carnitine/betaine transporter  39.56 
 
 		 556 aa  359  7e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0066  choline/carnitine/betaine transporter  42.64 
 
 		 583 aa  358  9.999999999999999e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.432279  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0044  choline/carnitine/betaine transporter  40.32 
 
 		 610 aa  358  9.999999999999999e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  40.12 
 
 		 530 aa  357  3.9999999999999996e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  37.53 
 
 		 526 aa  357  3.9999999999999996e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0022  choline/carnitine/betaine transporter  39.84 
 
 		 580 aa  355  1e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.499144 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0407  BCCT family transporter  38.27 
 
 		 716 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0234  BCCT family transporter  38.27 
 
 		 716 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1859  BCCT family transporter  38.27 
 
 		 676 aa  355  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0971  choline/carnitine/betaine transporter  38.27 
 
 		 676 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.745252  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1364  BCCT family transporter  38.27 
 
 		 676 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0875  choline/carnitine/betaine transport  39.31 
 
 		 681 aa  354  2e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  39.1 
 
 		 550 aa  353  2.9999999999999997e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13010  choline/carnitine/betaine transport  41.34 
 
 		 603 aa  353  5e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.639384 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1384  choline/carnitine/betaine transporter  41.99 
 
 		 524 aa  353  5e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.095402  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0328  choline/carnitine/betaine transporter  38.09 
 
 		 676 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.140196  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1774  BCCT family transporter  38.09 
 
 		 676 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>