More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4324 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  100 
 
 		 494 aa  981    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  49.48 
 
 		 523 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  45.77 
 
 		 506 aa  465  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  47.79 
 
 		 503 aa  450  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  45.25 
 
 		 659 aa  433  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  45.25 
 
 		 659 aa  434  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  44.15 
 
 		 657 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0757  choline/carnitine/betaine transport  47.05 
 
 		 525 aa  428  1e-119  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26622  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  44.88 
 
 		 661 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  44.22 
 
 		 526 aa  425  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  44.49 
 
 		 498 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  44.67 
 
 		 661 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  44.16 
 
 		 530 aa  419  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  42.68 
 
 		 490 aa  421  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1909  choline/carnitine/betaine transport  43.85 
 
 		 660 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.30039  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  43.65 
 
 		 504 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  43.53 
 
 		 667 aa  417  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3164  choline/carnitine/betaine transporter  42.69 
 
 		 660 aa  413  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1505  choline/carnitine/betaine transporter  43.09 
 
 		 668 aa  414  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4319  choline/carnitine/betaine transporter  44.31 
 
 		 534 aa  415  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  44.38 
 
 		 531 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  42.12 
 
 		 505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  42.28 
 
 		 497 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2741  choline/carnitine/betaine transporter  42.05 
 
 		 661 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  42.12 
 
 		 505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  42.12 
 
 		 505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  42.12 
 
 		 505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  42.12 
 
 		 505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  42.27 
 
 		 545 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  42.12 
 
 		 505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  41.62 
 
 		 538 aa  406  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  41.87 
 
 		 505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  43.5 
 
 		 508 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  42.66 
 
 		 600 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0421  choline/carnitine/betaine transporter  43.8 
 
 		 661 aa  403  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.45567  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  41.52 
 
 		 505 aa  404  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0154  choline/carnitine/betaine transporter  44.18 
 
 		 682 aa  404  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  41.32 
 
 		 504 aa  404  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  41.32 
 
 		 504 aa  404  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  40.32 
 
 		 551 aa  404  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  43.32 
 
 		 606 aa  402  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  42.09 
 
 		 685 aa  402  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1610  hypothetical protein  43.52 
 
 		 646 aa  401  9.999999999999999e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00096761  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1441  choline/carnitine/betaine transporter  45.58 
 
 		 658 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1362  choline/carnitine/betaine transport  43.29 
 
 		 673 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000623924  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0044  choline/carnitine/betaine transporter  42.29 
 
 		 610 aa  402  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1175  choline/carnitine/betaine transport  44.51 
 
 		 658 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0833615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  42.27 
 
 		 538 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1765  choline/carnitine/betaine transporter  42.71 
 
 		 573 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1576  choline/carnitine/betaine transporter  42.33 
 
 		 658 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.823699 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2804  choline/carnitine/betaine transporter  42.33 
 
 		 658 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1805  choline/carnitine/betaine transporter  44.69 
 
 		 664 aa  398  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.376035  hitchhiker  0.00814736 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1542  choline/carnitine/betaine transporter  42.33 
 
 		 658 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.869304  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25390  choline/carnitine/betaine transport  45.29 
 
 		 514 aa  398  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.229483  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  41.57 
 
 		 546 aa  392  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1301  BCCT family betaine/choline/carnitine/glycine transporter  42.65 
 
 		 682 aa  394  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1337  choline/carnitine/betaine transport  45.63 
 
 		 687 aa  393  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4702  choline/carnitine/betaine transporter  42.77 
 
 		 583 aa  395  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.911193  decreased coverage  0.0031512 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  42.47 
 
 		 637 aa  394  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04148  secondary glycine betaine transporter BetU  42.54 
 
 		 667 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  40.96 
 
 		 530 aa  390  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04111  hypothetical protein  42.54 
 
 		 667 aa  390  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0764  transporter, BCCT family  42.54 
 
 		 667 aa  390  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.846408  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1390  choline/carnitine/betaine transporter  42.14 
 
 		 582 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.211195 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4850  BCCT family transporter  42.34 
 
 		 667 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1546  choline/carnitine/betaine transporter  42.13 
 
 		 658 aa  392  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1384  choline/carnitine/betaine transporter  43.88 
 
 		 524 aa  391  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.095402  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0224  high-affinity choline transport protein  42 
 
 		 644 aa  388  1e-106  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1356  choline/carnitine/betaine transport  41.94 
 
 		 582 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379286  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1485  choline/carnitine/betaine transporter  40.61 
 
 		 580 aa  385  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00724238  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1374  choline/carnitine/betaine transporter  41.94 
 
 		 582 aa  388  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796407  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3532  choline/carnitine/betaine transporter  37.58 
 
 		 556 aa  386  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2906  choline/carnitine/betaine transporter  40 
 
 		 577 aa  385  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  42.51 
 
 		 531 aa  382  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  41.25 
 
 		 548 aa  385  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000212445  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  40.41 
 
 		 656 aa  382  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2552  choline/carnitine/betaine transporter  41.63 
 
 		 658 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2619  choline/carnitine/betaine transporter  41.84 
 
 		 658 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000908403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  41.25 
 
 		 548 aa  385  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2719  choline/carnitine/betaine transporter  41.63 
 
 		 658 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00590  choline/carnitine/betaine transport  41.83 
 
 		 592 aa  380  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0767816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  39.8 
 
 		 550 aa  381  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0174  choline/carnitine/betaine transporter  42.39 
 
 		 541 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.525828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2609  choline/carnitine/betaine transporter  40.68 
 
 		 573 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0501554  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0066  choline/carnitine/betaine transporter  42.15 
 
 		 583 aa  381  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.432279  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  38.88 
 
 		 542 aa  375  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2648  choline/carnitine/betaine transporter  39.96 
 
 		 534 aa  375  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3628  choline/carnitine/betaine transporter  41.01 
 
 		 581 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5374  choline/carnitine/betaine transporter family protein  39.5 
 
 		 567 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.985383  normal  0.22306 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01511  putative high-affinity choline transport protein  41.67 
 
 		 676 aa  373  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  39.56 
 
 		 532 aa  373  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1077  choline/carnitine/betaine transport  42.44 
 
 		 682 aa  375  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.892042  normal  0.109945 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2119  betaine/carnitine/choline transporter family protein  41.79 
 
 		 524 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2105  choline/carnitine/betaine transporter  41.01 
 
 		 581 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2288  choline/carnitine/betaine transporter  41.21 
 
 		 582 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529795 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13950  choline/carnitine/betaine transport  38.49 
 
 		 568 aa  374  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2676  choline/carnitine/betaine transporter  40.2 
 
 		 582 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  38.89 
 
 		 516 aa  371  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0079  choline/carnitine/betaine transporter  40.77 
 
 		 558 aa  371  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  39.17 
 
 		 567 aa  371  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>