More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3716 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4702  choline/carnitine/betaine transporter  57.07 
 
 		 583 aa  637    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.911193  decreased coverage  0.0031512 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3716  choline/carnitine/betaine transporter  100 
 
 		 629 aa  1263    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.903721  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0044  choline/carnitine/betaine transporter  56.51 
 
 		 610 aa  635    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1765  choline/carnitine/betaine transporter  57.4 
 
 		 573 aa  640    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3457  choline/carnitine/betaine transporter  87.95 
 
 		 694 aa  1023    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2105  choline/carnitine/betaine transporter  55.29 
 
 		 581 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3628  choline/carnitine/betaine transporter  55.57 
 
 		 581 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2288  choline/carnitine/betaine transporter  56.23 
 
 		 582 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529795 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2914  choline/carnitine/betaine transporter  58.85 
 
 		 611 aa  628  1e-178  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.34631  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2609  choline/carnitine/betaine transporter  57.89 
 
 		 573 aa  624  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0501554  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1356  choline/carnitine/betaine transport  57.78 
 
 		 582 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379286  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1374  choline/carnitine/betaine transporter  57.78 
 
 		 582 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796407  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2676  choline/carnitine/betaine transporter  55.92 
 
 		 582 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1390  choline/carnitine/betaine transporter  60.97 
 
 		 582 aa  616  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.211195 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1485  choline/carnitine/betaine transporter  54.66 
 
 		 580 aa  597  1e-169  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00724238  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6409  choline/carnitine/betaine transporter  53.5 
 
 		 585 aa  589  1e-167  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00590  choline/carnitine/betaine transport  53.14 
 
 		 592 aa  587  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0767816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0184  BCCT transporter  49.58 
 
 		 602 aa  542  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4898  choline/carnitine/betaine transporter  55.22 
 
 		 586 aa  530  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4142  choline/carnitine/betaine transporter  54.17 
 
 		 602 aa  516  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22610  choline/carnitine/betaine transport  46.94 
 
 		 663 aa  498  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.524203  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  49.06 
 
 		 531 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  51.9 
 
 		 531 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1904  choline/carnitine/betaine transporter  45.17 
 
 		 678 aa  456  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02380  choline/carnitine/betaine transport  42.6 
 
 		 664 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.136626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2261  choline/carnitine/betaine transporter  43.78 
 
 		 671 aa  449  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0757  choline/carnitine/betaine transport  52.41 
 
 		 525 aa  434  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26622  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2906  choline/carnitine/betaine transporter  45.34 
 
 		 577 aa  432  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22280  choline/carnitine/betaine transport  43.97 
 
 		 639 aa  430  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1132  choline/carnitine/betaine transporter  47.51 
 
 		 574 aa  429  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  41.63 
 
 		 600 aa  425  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00860  choline/carnitine/betaine transport  42.98 
 
 		 662 aa  404  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  41.91 
 
 		 573 aa  401  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16530  choline/carnitine/betaine transport  45.16 
 
 		 651 aa  397  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0532776  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  40.34 
 
 		 505 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  40.31 
 
 		 504 aa  381  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  41.7 
 
 		 498 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  40.15 
 
 		 505 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  40.5 
 
 		 504 aa  376  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  40.15 
 
 		 505 aa  378  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  40.15 
 
 		 505 aa  378  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  40.15 
 
 		 505 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  40.5 
 
 		 504 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  40.91 
 
 		 505 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  39.96 
 
 		 505 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  39.96 
 
 		 505 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  37.64 
 
 		 503 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  38.72 
 
 		 546 aa  370  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  40.86 
 
 		 523 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13010  choline/carnitine/betaine transport  37.86 
 
 		 603 aa  370  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.639384 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  39.62 
 
 		 494 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  37.96 
 
 		 516 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  37.13 
 
 		 516 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  37.25 
 
 		 532 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  37.77 
 
 		 516 aa  365  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000015754  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  37.77 
 
 		 516 aa  365  2e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000010169  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0022  choline/carnitine/betaine transporter  38.64 
 
 		 580 aa  364  2e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.499144 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  37.77 
 
 		 516 aa  365  2e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  40.5 
 
 		 497 aa  364  3e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  41.31 
 
 		 506 aa  364  3e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0522  glycine betaine transporter  37.59 
 
 		 516 aa  363  4e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  37.59 
 
 		 516 aa  363  4e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0683  glycine betaine transporter  37.77 
 
 		 516 aa  363  4e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4749  glycine betaine transporter  37.55 
 
 		 516 aa  363  6e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0790865 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3341  choline/carnitine/betaine transporter  38.82 
 
 		 637 aa  362  9e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  38.55 
 
 		 548 aa  362  2e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  38.55 
 
 		 548 aa  362  2e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000212445  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  39.14 
 
 		 490 aa  361  3e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0590  glycine betaine transporter  37.23 
 
 		 516 aa  359  9e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  39.81 
 
 		 606 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  38.95 
 
 		 530 aa  353  5e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0079  choline/carnitine/betaine transporter  38.45 
 
 		 558 aa  353  5.9999999999999994e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  39.65 
 
 		 508 aa  351  2e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5310  choline/carnitine/betaine transporter  40.41 
 
 		 698 aa  352  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.910175  normal  0.618905 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  37.92 
 
 		 567 aa  351  3e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  39.79 
 
 		 659 aa  350  5e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  39.79 
 
 		 659 aa  350  6e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  38.86 
 
 		 530 aa  349  9e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  37.16 
 
 		 526 aa  344  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  40.67 
 
 		 545 aa  345  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  35.42 
 
 		 551 aa  345  2e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  39.33 
 
 		 667 aa  343  5e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  41.58 
 
 		 538 aa  343  5e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10935  glycine betaine transport integral membrane protein betP  43.79 
 
 		 593 aa  342  2e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01900  choline/carnitine/betaine transport  37.26 
 
 		 619 aa  341  2.9999999999999998e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30890  choline/carnitine/betaine transport  38.59 
 
 		 572 aa  341  2.9999999999999998e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0654  choline/carnitine/betaine transport  35.86 
 
 		 544 aa  339  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0174  choline/carnitine/betaine transporter  40.79 
 
 		 541 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.525828  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  36.97 
 
 		 657 aa  337  5e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1109  choline/carnitine/betaine transporter  39.8 
 
 		 676 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507446  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  39.1 
 
 		 550 aa  335  1e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25390  choline/carnitine/betaine transport  38.48 
 
 		 514 aa  335  2e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.229483  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2648  choline/carnitine/betaine transporter  38.85 
 
 		 534 aa  334  2e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2667  choline/carnitine/betaine transporter  38.58 
 
 		 606 aa  335  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0383388 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0066  choline/carnitine/betaine transporter  40.04 
 
 		 583 aa  335  2e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.432279  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0023  choline/carnitine/betaine transporter  39.61 
 
 		 539 aa  333  5e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.16107 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1610  hypothetical protein  40.08 
 
 		 646 aa  333  8e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00096761  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  36.83 
 
 		 538 aa  332  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3532  choline/carnitine/betaine transporter  37.21 
 
 		 556 aa  331  3e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2003  choline/carnitine/betaine transport family protein  37.52 
 
 		 535 aa  330  4e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>