More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1813 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3860  BCCT family transporter  58.49 
 
 		 519 aa  644    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.99321  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000659  putative glycine betaine transporter  65.09 
 
 		 528 aa  703    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0875  glycine betaine transporter OpuD  78.77 
 
 		 524 aa  818    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0576373  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0815  BCCT transporter  72.4 
 
 		 530 aa  810    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.820785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3674  BCCT transporter  64.57 
 
 		 549 aa  714    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1813  BCCT transporter  100 
 
 		 561 aa  1129    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.566263 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1238  BCCT transporter  79.85 
 
 		 554 aa  910    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332872 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06536  choline/carnitine/betaine transporter  64.01 
 
 		 539 aa  708    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2126  BCCT transporter  76.22 
 
 		 533 aa  839    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00109884  hitchhiker  0.00218719 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5125  BCCT family osmoprotectant transporter  52.71 
 
 		 522 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5625  osmoprotectant transporter, BCCT family  53.11 
 
 		 522 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0335  BCCT transporter  54.58 
 
 		 534 aa  560  1e-158  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.568613  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0579  choline-glycine betaine transporter  57.26 
 
 		 519 aa  560  1e-158  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5237  BCCT transporter  53.11 
 
 		 522 aa  561  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5577  BCCT family osmoprotectant transporter  52.51 
 
 		 522 aa  556  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5298  BCCT family osmoprotectant transporter  52.51 
 
 		 522 aa  557  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5140  BCCT family osmoprotectant transporter  52.72 
 
 		 522 aa  556  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5694  BCCT family osmoprotectant transporter  52.51 
 
 		 522 aa  557  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3383  BCCT transporter  56.27 
 
 		 514 aa  557  1e-157  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.198067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5539  osmoprotectant transporter, BCCT family  52.51 
 
 		 522 aa  557  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5380  osmoprotectant transporter, BCCT family  53.11 
 
 		 522 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.274616  normal  0.0982886 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5569  osmoprotectant transporter, BCCT family  52.71 
 
 		 522 aa  538  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2888  BCCT transporter  47.99 
 
 		 555 aa  497  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.696836  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2692  BCCT family transporter  52.13 
 
 		 516 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3060  BCCT transporter  52.13 
 
 		 516 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.892998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2887  BCCT transporter  48.88 
 
 		 529 aa  461  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2920  BCCT transporter  48.67 
 
 		 518 aa  455  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00190717  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05503  choline/carnitine/betaine transporter  68.71 
 
 		 341 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2467  BCCT transporter  47.26 
 
 		 537 aa  426  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16031  hypothetical protein  38.68 
 
 		 519 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.034717  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0251  BCCT family glycine betaine transporter  37.38 
 
 		 516 aa  319  7.999999999999999e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0223  BCCT family glycine betaine transporter  38.26 
 
 		 518 aa  311  2e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  31.27 
 
 		 551 aa  265  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  32.64 
 
 		 494 aa  254  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  31.05 
 
 		 520 aa  253  4.0000000000000004e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  33.85 
 
 		 550 aa  254  4.0000000000000004e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  31.05 
 
 		 520 aa  253  4.0000000000000004e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  31.93 
 
 		 657 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  33.6 
 
 		 661 aa  248  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  32.93 
 
 		 545 aa  246  9e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  32.76 
 
 		 606 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  35.05 
 
 		 659 aa  244  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  32.14 
 
 		 506 aa  244  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  33.68 
 
 		 659 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2648  choline/carnitine/betaine transporter  32.96 
 
 		 534 aa  244  3.9999999999999997e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  33 
 
 		 606 aa  243  7.999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  31.55 
 
 		 531 aa  242  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  33.2 
 
 		 661 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  32.1 
 
 		 538 aa  241  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  30.94 
 
 		 573 aa  240  4e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1512  choline transport protein BetT  32.79 
 
 		 679 aa  239  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0971262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3532  choline/carnitine/betaine transporter  32.78 
 
 		 556 aa  239  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2645  choline transport protein BetT  32.3 
 
 		 684 aa  238  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00290709  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0223  choline transport protein BetT  33.06 
 
 		 686 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  32.14 
 
 		 490 aa  236  9e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06510  choline/carnitine/betaine transport  33.15 
 
 		 642 aa  236  9e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  32.96 
 
 		 637 aa  236  9e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2667  choline/carnitine/betaine transporter  31.12 
 
 		 606 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0383388 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0079  choline/carnitine/betaine transporter  31.38 
 
 		 558 aa  236  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  31.36 
 
 		 530 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  34.24 
 
 		 503 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  32.99 
 
 		 538 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  30.43 
 
 		 542 aa  233  1e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  31.43 
 
 		 546 aa  232  1e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1610  hypothetical protein  31.79 
 
 		 646 aa  232  1e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00096761  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  29.87 
 
 		 548 aa  231  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000212445  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  29.87 
 
 		 548 aa  231  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2603  choline transport protein BetT  32.92 
 
 		 685 aa  230  6e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158704 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  30.87 
 
 		 531 aa  230  6e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13010  choline/carnitine/betaine transport  30.07 
 
 		 603 aa  229  7e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.639384 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0237  choline/carnitine/betaine transporter  31.62 
 
 		 550 aa  229  7e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000527978  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003606  High-affinity choline uptake protein BetT  32.9 
 
 		 553 aa  229  9e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4336  choline/carnitine/betaine transporter  29.94 
 
 		 529 aa  229  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1904  choline/carnitine/betaine transporter  28.52 
 
 		 678 aa  229  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  31.71 
 
 		 523 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  34.91 
 
 		 667 aa  229  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  28.57 
 
 		 600 aa  228  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12990  choline transporter  30.47 
 
 		 653 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.283179 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0022  choline/carnitine/betaine transporter  31.36 
 
 		 580 aa  228  3e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.499144 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  31.44 
 
 		 656 aa  228  3e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0898  BCCT family transporter  29.68 
 
 		 540 aa  227  4e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5310  choline/carnitine/betaine transporter  30.89 
 
 		 698 aa  227  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.910175  normal  0.618905 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02455  choline/carnitine/betaine transporter  31.75 
 
 		 582 aa  227  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0654  choline/carnitine/betaine transport  31.99 
 
 		 544 aa  226  6e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  32.92 
 
 		 497 aa  226  6e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1174  choline transporter  30.27 
 
 		 671 aa  226  9e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  33.06 
 
 		 685 aa  226  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1909  choline/carnitine/betaine transport  33.33 
 
 		 660 aa  225  2e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.30039  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1109  choline/carnitine/betaine transporter  32.42 
 
 		 676 aa  225  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507446  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1809  choline/carnitine/betaine transporter  32.73 
 
 		 526 aa  225  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  33.33 
 
 		 567 aa  225  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5241  BCCT transporter  28.6 
 
 		 665 aa  224  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151008  normal  0.0666066 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0049  choline/carnitine/betaine transporter  30.58 
 
 		 523 aa  224  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.335489  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2003  choline/carnitine/betaine transport family protein  31.55 
 
 		 535 aa  223  7e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1859  BCCT family transporter  32.03 
 
 		 676 aa  223  7e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0971  choline/carnitine/betaine transporter  32.03 
 
 		 676 aa  223  7e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.745252  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0328  choline/carnitine/betaine transporter  32.03 
 
 		 676 aa  223  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.140196  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0247  BCCT transporter  30.08 
 
 		 666 aa  223  7e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.442957  normal  0.516419 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1774  BCCT family transporter  32.03 
 
 		 676 aa  223  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841224  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1364  BCCT family transporter  32.03 
 
 		 676 aa  223  7e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>