More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS5298 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_5577  BCCT family osmoprotectant transporter  96.93 
 
 
522 aa  1008    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5380  osmoprotectant transporter, BCCT family  94.06 
 
 
522 aa  960    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.274616  normal  0.0982886 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5298  BCCT family osmoprotectant transporter  100 
 
 
522 aa  1035    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5125  BCCT family osmoprotectant transporter  98.28 
 
 
522 aa  1021    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5140  BCCT family osmoprotectant transporter  98.66 
 
 
522 aa  1019    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5539  osmoprotectant transporter, BCCT family  100 
 
 
522 aa  1035    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5694  BCCT family osmoprotectant transporter  100 
 
 
522 aa  1035    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5625  osmoprotectant transporter, BCCT family  95.4 
 
 
522 aa  999    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5569  osmoprotectant transporter, BCCT family  93.49 
 
 
522 aa  956    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5237  BCCT transporter  97.13 
 
 
522 aa  1013    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3860  BCCT family transporter  59.48 
 
 
519 aa  606  9.999999999999999e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.99321  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0815  BCCT transporter  53.59 
 
 
530 aa  565  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.820785  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2126  BCCT transporter  52.42 
 
 
533 aa  557  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00109884  hitchhiker  0.00218719 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3674  BCCT transporter  54.27 
 
 
549 aa  556  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000659  putative glycine betaine transporter  54.67 
 
 
528 aa  556  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06536  choline/carnitine/betaine transporter  53.08 
 
 
539 aa  550  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1813  BCCT transporter  52.51 
 
 
561 aa  548  1e-154  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.566263 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1238  BCCT transporter  51.1 
 
 
554 aa  546  1e-154  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.332872 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0875  glycine betaine transporter OpuD  53.43 
 
 
524 aa  544  1e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0576373  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0335  BCCT transporter  50.7 
 
 
534 aa  531  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.568613  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3383  BCCT transporter  51.3 
 
 
514 aa  488  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.198067  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0579  choline-glycine betaine transporter  48.59 
 
 
519 aa  483  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2692  BCCT family transporter  48.3 
 
 
516 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2888  BCCT transporter  46.37 
 
 
555 aa  464  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.696836  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3060  BCCT transporter  47.7 
 
 
516 aa  465  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.892998  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2920  BCCT transporter  47.7 
 
 
518 aa  438  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00190717  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2887  BCCT transporter  44.99 
 
 
529 aa  432  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2467  BCCT transporter  43.73 
 
 
537 aa  419  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16031  hypothetical protein  38.28 
 
 
519 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.034717  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0251  BCCT family glycine betaine transporter  41.12 
 
 
516 aa  345  8e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0223  BCCT family glycine betaine transporter  40.32 
 
 
518 aa  332  1e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604599  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  35.02 
 
 
551 aa  288  1e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05503  choline/carnitine/betaine transporter  50.18 
 
 
341 aa  281  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  35.87 
 
 
503 aa  266  8.999999999999999e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  33.47 
 
 
659 aa  264  4e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  35.9 
 
 
550 aa  261  3e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  33.06 
 
 
659 aa  260  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  33.7 
 
 
520 aa  257  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  33.7 
 
 
520 aa  257  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  32.61 
 
 
545 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  32.88 
 
 
538 aa  251  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  36.83 
 
 
498 aa  250  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  33.6 
 
 
506 aa  249  6e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2003  choline/carnitine/betaine transport family protein  31.83 
 
 
535 aa  249  6e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  31.45 
 
 
657 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  34.37 
 
 
523 aa  249  9e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  31.96 
 
 
490 aa  248  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  32.38 
 
 
542 aa  246  6e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  31.85 
 
 
494 aa  244  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  31.65 
 
 
606 aa  244  3e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  33.89 
 
 
504 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  30.93 
 
 
530 aa  243  6e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1809  choline/carnitine/betaine transporter  33.13 
 
 
526 aa  243  6e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4749  glycine betaine transporter  32.32 
 
 
516 aa  243  9e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0790865 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  32.09 
 
 
637 aa  242  9e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3532  choline/carnitine/betaine transporter  29.94 
 
 
556 aa  242  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  31.54 
 
 
573 aa  242  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  29.96 
 
 
600 aa  241  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0875  choline/carnitine/betaine transport  32.98 
 
 
681 aa  241  2e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  32.2 
 
 
661 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  32.73 
 
 
516 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000015754  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  32.53 
 
 
516 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  32.53 
 
 
516 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000010169  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0590  glycine betaine transporter  32.32 
 
 
516 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  32.53 
 
 
516 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0683  glycine betaine transporter  32.53 
 
 
516 aa  240  4e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0600  choline/carnitine/betaine transporter  30.51 
 
 
584 aa  239  6.999999999999999e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000857259  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0522  glycine betaine transporter  32.32 
 
 
516 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  32.32 
 
 
516 aa  239  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  32.17 
 
 
667 aa  239  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2648  choline/carnitine/betaine transporter  30.06 
 
 
534 aa  238  2e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  33.33 
 
 
526 aa  238  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  31.57 
 
 
532 aa  237  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  33.33 
 
 
505 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  33.12 
 
 
505 aa  236  8e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  33.12 
 
 
505 aa  236  8e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  33.12 
 
 
505 aa  236  8e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  32.32 
 
 
505 aa  236  8e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0049  choline/carnitine/betaine transporter  31.22 
 
 
523 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.335489  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  31.92 
 
 
538 aa  235  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  33.41 
 
 
505 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  31.81 
 
 
656 aa  236  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  33.41 
 
 
505 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13950  choline/carnitine/betaine transport  29.3 
 
 
568 aa  235  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1003  choline/carnitine/betaine transporter  31.85 
 
 
553 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  32.91 
 
 
504 aa  234  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0727  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  31.62 
 
 
681 aa  234  3e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2323  glycine betaine transporter  33.8 
 
 
525 aa  234  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100678  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0237  choline/carnitine/betaine transporter  31.24 
 
 
550 aa  234  4.0000000000000004e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000527978  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  32.31 
 
 
504 aa  233  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4336  choline/carnitine/betaine transporter  30.37 
 
 
529 aa  233  6e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  32 
 
 
661 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1904  choline/carnitine/betaine transporter  31.43 
 
 
678 aa  232  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  31.02 
 
 
516 aa  232  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12990  choline transporter  32.96 
 
 
653 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.283179 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1121  choline/carnitine/betaine transporter  31.43 
 
 
611 aa  231  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1610  hypothetical protein  30.34 
 
 
646 aa  231  2e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00096761  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  32.52 
 
 
567 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1282  transporter, BCCT family  30.93 
 
 
534 aa  229  8e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0098  transporter, BCCT family  31.5 
 
 
526 aa  229  9e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>