More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3674 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3674  BCCT transporter  100 
 
 		 549 aa  1093    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06536  choline/carnitine/betaine transporter  72.61 
 
 		 539 aa  771    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3860  BCCT family transporter  61.71 
 
 		 519 aa  645    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.99321  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000659  putative glycine betaine transporter  72.02 
 
 		 528 aa  758    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1813  BCCT transporter  64.57 
 
 		 561 aa  700    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.566263 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0815  BCCT transporter  65.79 
 
 		 530 aa  721    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.820785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1238  BCCT transporter  63.13 
 
 		 554 aa  712    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332872 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0875  glycine betaine transporter OpuD  67.06 
 
 		 524 aa  696    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0576373  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2126  BCCT transporter  63.84 
 
 		 533 aa  711    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00109884  hitchhiker  0.00218719 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5125  BCCT family osmoprotectant transporter  53.42 
 
 		 522 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3383  BCCT transporter  57.03 
 
 		 514 aa  561  1e-158  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.198067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0579  choline-glycine betaine transporter  57.2 
 
 		 519 aa  557  1e-157  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5298  BCCT family osmoprotectant transporter  54.27 
 
 		 522 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5140  BCCT family osmoprotectant transporter  54.58 
 
 		 522 aa  558  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5539  osmoprotectant transporter, BCCT family  54.27 
 
 		 522 aa  556  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5694  BCCT family osmoprotectant transporter  54.27 
 
 		 522 aa  556  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5237  BCCT transporter  54.27 
 
 		 522 aa  555  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0335  BCCT transporter  52.06 
 
 		 534 aa  555  1e-157  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.568613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5625  osmoprotectant transporter, BCCT family  52.84 
 
 		 522 aa  554  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5577  BCCT family osmoprotectant transporter  53.46 
 
 		 522 aa  548  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5569  osmoprotectant transporter, BCCT family  53.42 
 
 		 522 aa  538  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5380  osmoprotectant transporter, BCCT family  53.23 
 
 		 522 aa  536  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.274616  normal  0.0982886 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3060  BCCT transporter  52.94 
 
 		 516 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.892998  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2692  BCCT family transporter  52.74 
 
 		 516 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.315858 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2888  BCCT transporter  46.75 
 
 		 555 aa  484  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.696836  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2887  BCCT transporter  47.68 
 
 		 529 aa  461  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2920  BCCT transporter  46.17 
 
 		 518 aa  433  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00190717  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2467  BCCT transporter  47.18 
 
 		 537 aa  419  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05503  choline/carnitine/betaine transporter  56.34 
 
 		 341 aa  371  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16031  hypothetical protein  37.35 
 
 		 519 aa  351  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.034717  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0251  BCCT family glycine betaine transporter  39.18 
 
 		 516 aa  322  9.000000000000001e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0223  BCCT family glycine betaine transporter  40.32 
 
 		 518 aa  322  9.999999999999999e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  31.2 
 
 		 551 aa  263  4.999999999999999e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0079  choline/carnitine/betaine transporter  30.92 
 
 		 558 aa  248  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  30.54 
 
 		 530 aa  246  6e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  31.79 
 
 		 550 aa  243  7e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  31.11 
 
 		 494 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  31.71 
 
 		 546 aa  235  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  32.2 
 
 		 503 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  28.2 
 
 		 526 aa  235  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  32.35 
 
 		 538 aa  234  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  30.88 
 
 		 520 aa  234  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  30.88 
 
 		 520 aa  234  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  32.02 
 
 		 538 aa  233  5e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  30.86 
 
 		 606 aa  233  9e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  30.47 
 
 		 506 aa  231  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  30.73 
 
 		 542 aa  230  5e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1384  choline/carnitine/betaine transporter  33.41 
 
 		 524 aa  229  7e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.095402  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0522  glycine betaine transporter  32.96 
 
 		 516 aa  229  9e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  32.96 
 
 		 516 aa  229  9e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  32.16 
 
 		 637 aa  229  9e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  31.99 
 
 		 523 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  32.96 
 
 		 516 aa  229  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  32.96 
 
 		 516 aa  229  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000010169  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  30.48 
 
 		 659 aa  229  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  32.47 
 
 		 516 aa  229  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0590  glycine betaine transporter  32.73 
 
 		 516 aa  229  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0600  choline/carnitine/betaine transporter  29.4 
 
 		 584 aa  229  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000857259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  32.96 
 
 		 516 aa  229  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  31.89 
 
 		 657 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  30.88 
 
 		 545 aa  228  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0683  glycine betaine transporter  33.18 
 
 		 516 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  30.48 
 
 		 659 aa  228  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4749  glycine betaine transporter  30.93 
 
 		 516 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0790865 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  32.51 
 
 		 516 aa  226  6e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000015754  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  32.92 
 
 		 567 aa  225  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  31.89 
 
 		 667 aa  225  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  29.85 
 
 		 490 aa  224  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  29.7 
 
 		 573 aa  224  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22610  choline/carnitine/betaine transport  30.35 
 
 		 663 aa  223  6e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.524203  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0022  choline/carnitine/betaine transporter  29.43 
 
 		 580 aa  222  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.499144 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  31.89 
 
 		 661 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1121  choline/carnitine/betaine transporter  34.43 
 
 		 611 aa  221  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0309  choline/carnitine/betaine transporter  31.18 
 
 		 552 aa  221  3.9999999999999997e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.670789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1904  choline/carnitine/betaine transporter  31.22 
 
 		 678 aa  220  5e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  31.14 
 
 		 531 aa  219  8.999999999999998e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0190  BCCT transporter  30.2 
 
 		 525 aa  219  1e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0654  choline/carnitine/betaine transport  31.99 
 
 		 544 aa  219  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  32.4 
 
 		 498 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  29.26 
 
 		 530 aa  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3341  choline/carnitine/betaine transporter  28.99 
 
 		 637 aa  218  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1851  choline/carnitine/betaine transporter  30.13 
 
 		 543 aa  217  4e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.993809  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0224  high-affinity choline transport protein  30.93 
 
 		 644 aa  217  5e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3532  choline/carnitine/betaine transporter  29.39 
 
 		 556 aa  217  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  31.69 
 
 		 661 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0174  choline/carnitine/betaine transporter  31.38 
 
 		 541 aa  216  7e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.525828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  31.38 
 
 		 532 aa  216  8e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13950  choline/carnitine/betaine transport  28.92 
 
 		 568 aa  216  9e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06510  choline/carnitine/betaine transport  30.61 
 
 		 642 aa  215  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  28.89 
 
 		 606 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  29.24 
 
 		 548 aa  214  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1512  choline transport protein BetT  29.85 
 
 		 679 aa  214  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0971262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  29.24 
 
 		 548 aa  214  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000212445  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0875  choline/carnitine/betaine transport  30.52 
 
 		 681 aa  214  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  30.9 
 
 		 685 aa  213  7e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4752  BCCT transporter  32.42 
 
 		 536 aa  213  9e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.337094  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  29.49 
 
 		 600 aa  212  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0727  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  29.46 
 
 		 681 aa  212  2e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  31.15 
 
 		 504 aa  211  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0077  choline/carnitine/betaine transporter  31.44 
 
 		 546 aa  212  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>