More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4752 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013745  Htur_4752  BCCT transporter  100 
 
 		 536 aa  1069    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.337094  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4750  choline/carnitine/betaine transporter  58.27 
 
 		 542 aa  624  1e-177  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.216648  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4754  BCCT transporter  59.62 
 
 		 552 aa  617  1e-175  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4708  choline/carnitine/betaine transporter  62.02 
 
 		 552 aa  585  1e-166  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2934  BCCT transporter  47.97 
 
 		 545 aa  491  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3777  BCCT transporter  48.74 
 
 		 563 aa  469  1.0000000000000001e-131  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1055  BCCT transporter  47.23 
 
 		 565 aa  450  1e-125  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  38.45 
 
 		 490 aa  325  1e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  36.97 
 
 		 506 aa  324  3e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2906  choline/carnitine/betaine transporter  37.86 
 
 		 577 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  37.61 
 
 		 503 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  39.29 
 
 		 545 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  39.6 
 
 		 497 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0757  choline/carnitine/betaine transport  41.7 
 
 		 525 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26622  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  37.64 
 
 		 531 aa  306  6e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  36.46 
 
 		 659 aa  306  7e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  36.46 
 
 		 659 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  36.31 
 
 		 600 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0174  choline/carnitine/betaine transporter  36.28 
 
 		 541 aa  302  1e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.525828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  36.52 
 
 		 573 aa  301  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  37.09 
 
 		 523 aa  301  3e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2025  choline/carnitine/betaine transporter  41.29 
 
 		 533 aa  301  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  38.44 
 
 		 505 aa  300  4e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  38.44 
 
 		 505 aa  300  4e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  32.96 
 
 		 538 aa  300  4e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  32.54 
 
 		 526 aa  300  5e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  37.04 
 
 		 498 aa  300  6e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1384  choline/carnitine/betaine transporter  36.72 
 
 		 524 aa  299  7e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.095402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  38.44 
 
 		 505 aa  299  8e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  38.44 
 
 		 505 aa  299  8e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  39.61 
 
 		 531 aa  299  8e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  38.44 
 
 		 505 aa  299  8e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  38.44 
 
 		 505 aa  299  8e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  37.8 
 
 		 505 aa  298  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  35.44 
 
 		 685 aa  298  2e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  35.47 
 
 		 508 aa  297  3e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  34.17 
 
 		 530 aa  296  8e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  33.92 
 
 		 551 aa  295  1e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  38.01 
 
 		 504 aa  295  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  37.8 
 
 		 504 aa  295  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  36.15 
 
 		 661 aa  293  6e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  32.82 
 
 		 520 aa  293  7e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  32.82 
 
 		 520 aa  293  7e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1301  BCCT family betaine/choline/carnitine/glycine transporter  35.02 
 
 		 682 aa  291  2e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25390  choline/carnitine/betaine transport  37.39 
 
 		 514 aa  291  2e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.229483  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  37.07 
 
 		 505 aa  291  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4702  choline/carnitine/betaine transporter  36.42 
 
 		 583 aa  290  4e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.911193  decreased coverage  0.0031512 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  35.34 
 
 		 530 aa  290  5.0000000000000004e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  35.08 
 
 		 657 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3532  choline/carnitine/betaine transporter  32.8 
 
 		 556 aa  288  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0154  choline/carnitine/betaine transporter  36 
 
 		 682 aa  288  2e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0421  choline/carnitine/betaine transporter  37.4 
 
 		 661 aa  288  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.45567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  35.71 
 
 		 538 aa  288  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6409  choline/carnitine/betaine transporter  36.01 
 
 		 585 aa  286  5.999999999999999e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1765  choline/carnitine/betaine transporter  36.4 
 
 		 573 aa  286  9e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  36.8 
 
 		 504 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  35.1 
 
 		 606 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  33.81 
 
 		 637 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0309  choline/carnitine/betaine transporter  37.73 
 
 		 552 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.670789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001291  choline/carnitine/betaine transporter family protein  36.19 
 
 		 578 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.335478  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  35.31 
 
 		 661 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2609  choline/carnitine/betaine transporter  37.94 
 
 		 573 aa  283  7.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0501554  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  33.81 
 
 		 532 aa  283  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0066  choline/carnitine/betaine transporter  37.42 
 
 		 583 aa  282  9e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.432279  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0522  glycine betaine transporter  33.61 
 
 		 516 aa  282  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  33.61 
 
 		 516 aa  282  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  33.61 
 
 		 516 aa  282  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000010169  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1337  choline/carnitine/betaine transport  36.96 
 
 		 687 aa  282  1e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  33.61 
 
 		 516 aa  282  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  33.61 
 
 		 516 aa  282  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  33.33 
 
 		 546 aa  281  2e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0683  glycine betaine transporter  33.4 
 
 		 516 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2029  choline/carnitine/betaine transporter  34.21 
 
 		 558 aa  280  4e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  34.1 
 
 		 516 aa  280  5e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0044  choline/carnitine/betaine transporter  36.88 
 
 		 610 aa  280  5e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2914  choline/carnitine/betaine transporter  35.66 
 
 		 611 aa  280  5e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.34631  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1356  choline/carnitine/betaine transport  37.1 
 
 		 582 aa  280  6e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379286  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1374  choline/carnitine/betaine transporter  37.1 
 
 		 582 aa  280  6e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796407  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0590  glycine betaine transporter  33.4 
 
 		 516 aa  279  7e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5374  choline/carnitine/betaine transporter family protein  35.92 
 
 		 567 aa  279  9e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.985383  normal  0.22306 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  33.4 
 
 		 516 aa  279  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000015754  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01511  putative high-affinity choline transport protein  35.76 
 
 		 676 aa  278  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1390  choline/carnitine/betaine transporter  36.9 
 
 		 582 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.211195 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4749  glycine betaine transporter  33.47 
 
 		 516 aa  277  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0790865 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  34.9 
 
 		 542 aa  277  3e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0654  choline/carnitine/betaine transport  35.11 
 
 		 544 aa  276  5e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1485  choline/carnitine/betaine transporter  35.32 
 
 		 580 aa  275  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00724238  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4142  choline/carnitine/betaine transporter  33.64 
 
 		 602 aa  275  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  34.58 
 
 		 494 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1077  choline/carnitine/betaine transport  35.23 
 
 		 682 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.892042  normal  0.109945 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2648  choline/carnitine/betaine transporter  35.22 
 
 		 534 aa  275  2.0000000000000002e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3628  choline/carnitine/betaine transporter  36.27 
 
 		 581 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2105  choline/carnitine/betaine transporter  36.27 
 
 		 581 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2676  choline/carnitine/betaine transporter  36.2 
 
 		 582 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0240  choline/carnitine/betaine transporter  35.37 
 
 		 662 aa  273  5.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2288  choline/carnitine/betaine transporter  36.02 
 
 		 582 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529795 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  32.77 
 
 		 548 aa  273  7e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000212445  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  32.77 
 
 		 548 aa  273  7e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  35.85 
 
 		 606 aa  273  7e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3436  choline/carnitine/betaine transporter  35.05 
 
 		 526 aa  272  9e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.97143  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>