More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4754 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013745  Htur_4754  BCCT transporter  100 
 
 		 552 aa  1091    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4752  BCCT transporter  59.62 
 
 		 536 aa  640    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.337094  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4750  choline/carnitine/betaine transporter  50.46 
 
 		 542 aa  564  1.0000000000000001e-159  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.216648  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4708  choline/carnitine/betaine transporter  53.66 
 
 		 552 aa  518  1.0000000000000001e-145  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2934  BCCT transporter  45.6 
 
 		 545 aa  454  1.0000000000000001e-126  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3777  BCCT transporter  43.76 
 
 		 563 aa  434  1e-120  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1055  BCCT transporter  43.99 
 
 		 565 aa  421  1e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  36.2 
 
 		 503 aa  296  9e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0174  choline/carnitine/betaine transporter  36.14 
 
 		 541 aa  294  3e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.525828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  33.94 
 
 		 506 aa  294  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  35.67 
 
 		 505 aa  291  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  36.14 
 
 		 531 aa  290  7e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  36.26 
 
 		 505 aa  289  8e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  36.26 
 
 		 505 aa  289  8e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1765  choline/carnitine/betaine transporter  37.3 
 
 		 573 aa  289  9e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  36.06 
 
 		 505 aa  288  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  36.06 
 
 		 505 aa  288  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  36.06 
 
 		 505 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  36.06 
 
 		 505 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  37.22 
 
 		 490 aa  287  2.9999999999999996e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  36.06 
 
 		 505 aa  286  7e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  33.59 
 
 		 520 aa  285  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  37.01 
 
 		 497 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  33.59 
 
 		 520 aa  285  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2029  choline/carnitine/betaine transporter  35.06 
 
 		 558 aa  283  5.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  36.16 
 
 		 498 aa  282  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  34.5 
 
 		 659 aa  282  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  36.34 
 
 		 508 aa  281  2e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  32.47 
 
 		 600 aa  281  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0066  choline/carnitine/betaine transporter  34.45 
 
 		 583 aa  281  2e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.432279  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  34.44 
 
 		 573 aa  281  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  34.5 
 
 		 659 aa  281  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4702  choline/carnitine/betaine transporter  37.15 
 
 		 583 aa  281  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.911193  decreased coverage  0.0031512 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  35.49 
 
 		 504 aa  281  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  36.67 
 
 		 531 aa  280  4e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  31.47 
 
 		 606 aa  279  8e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  35.1 
 
 		 504 aa  278  1e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  32.61 
 
 		 637 aa  278  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  34.82 
 
 		 504 aa  277  4e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2906  choline/carnitine/betaine transporter  34.76 
 
 		 577 aa  276  6e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25390  choline/carnitine/betaine transport  34.48 
 
 		 514 aa  276  9e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.229483  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  35.46 
 
 		 661 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  32.59 
 
 		 551 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1301  BCCT family betaine/choline/carnitine/glycine transporter  34.72 
 
 		 682 aa  274  3e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2741  choline/carnitine/betaine transporter  33.77 
 
 		 661 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1356  choline/carnitine/betaine transport  36.18 
 
 		 582 aa  273  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379286  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1374  choline/carnitine/betaine transporter  36.18 
 
 		 582 aa  273  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796407  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  33.74 
 
 		 685 aa  271  2e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2609  choline/carnitine/betaine transporter  37.28 
 
 		 573 aa  271  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0501554  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  34.98 
 
 		 661 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  32.99 
 
 		 657 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1909  choline/carnitine/betaine transport  32.73 
 
 		 660 aa  270  5e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.30039  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1390  choline/carnitine/betaine transporter  36.11 
 
 		 582 aa  270  5e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.211195 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  32.48 
 
 		 546 aa  270  5.9999999999999995e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  34.21 
 
 		 545 aa  269  8.999999999999999e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  32.02 
 
 		 526 aa  269  8.999999999999999e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  32 
 
 		 538 aa  268  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2914  choline/carnitine/betaine transporter  35.25 
 
 		 611 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.34631  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6160  choline transporter BetT  31.63 
 
 		 534 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0421  choline/carnitine/betaine transporter  34.96 
 
 		 661 aa  267  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.45567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4850  BCCT family transporter  34.5 
 
 		 667 aa  266  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1337  choline/carnitine/betaine transport  36.83 
 
 		 687 aa  266  5e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1485  choline/carnitine/betaine transporter  34.51 
 
 		 580 aa  266  5e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00724238  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1505  choline/carnitine/betaine transporter  33.71 
 
 		 668 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2025  choline/carnitine/betaine transporter  36.7 
 
 		 533 aa  266  5.999999999999999e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0764  transporter, BCCT family  34.5 
 
 		 667 aa  266  7e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.846408  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  33.2 
 
 		 538 aa  266  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0757  choline/carnitine/betaine transport  36.91 
 
 		 525 aa  266  1e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26622  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04148  secondary glycine betaine transporter BetU  34.31 
 
 		 667 aa  265  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04111  hypothetical protein  34.31 
 
 		 667 aa  265  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0154  choline/carnitine/betaine transporter  35.85 
 
 		 682 aa  264  4e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  31.6 
 
 		 530 aa  262  1e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0224  high-affinity choline transport protein  32.85 
 
 		 644 aa  262  1e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  31.21 
 
 		 656 aa  262  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2648  choline/carnitine/betaine transporter  31.97 
 
 		 534 aa  262  1e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2804  choline/carnitine/betaine transporter  32.84 
 
 		 658 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5241  BCCT transporter  32.89 
 
 		 665 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151008  normal  0.0666066 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1576  choline/carnitine/betaine transporter  32.71 
 
 		 658 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.823699 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1542  choline/carnitine/betaine transporter  32.84 
 
 		 658 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.869304  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3164  choline/carnitine/betaine transporter  32.82 
 
 		 660 aa  261  3e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1441  choline/carnitine/betaine transporter  32.96 
 
 		 658 aa  261  3e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  34.24 
 
 		 542 aa  260  4e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3628  choline/carnitine/betaine transporter  36.77 
 
 		 581 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2105  choline/carnitine/betaine transporter  36.77 
 
 		 581 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0309  choline/carnitine/betaine transporter  34.2 
 
 		 552 aa  259  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.670789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  32.73 
 
 		 494 aa  259  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0184  BCCT transporter  35.55 
 
 		 602 aa  258  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22610  choline/carnitine/betaine transport  36.18 
 
 		 663 aa  258  2e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.524203  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  32.72 
 
 		 667 aa  258  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  33.14 
 
 		 606 aa  257  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2119  betaine/carnitine/choline transporter family protein  35.86 
 
 		 524 aa  258  3e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6409  choline/carnitine/betaine transporter  33.01 
 
 		 585 aa  257  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2288  choline/carnitine/betaine transporter  36.77 
 
 		 582 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529795 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1362  choline/carnitine/betaine transport  34.7 
 
 		 673 aa  258  3e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000623924  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1121  choline/carnitine/betaine transporter  33.59 
 
 		 611 aa  257  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0044  choline/carnitine/betaine transporter  35.22 
 
 		 610 aa  257  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  33.61 
 
 		 532 aa  257  4e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2261  choline/carnitine/betaine transporter  34.26 
 
 		 671 aa  257  5e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3716  choline/carnitine/betaine transporter  34.09 
 
 		 629 aa  256  5e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.903721  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3107  choline/carnitine/betaine transporter  33.53 
 
 		 539 aa  256  6e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>