More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2934 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2934  BCCT transporter  100 
 
 		 545 aa  1075    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3777  BCCT transporter  72.24 
 
 		 563 aa  781    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1055  BCCT transporter  72.49 
 
 		 565 aa  769    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4752  BCCT transporter  47.97 
 
 		 536 aa  491  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.337094  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4708  choline/carnitine/betaine transporter  50.75 
 
 		 552 aa  475  1e-132  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4750  choline/carnitine/betaine transporter  45.57 
 
 		 542 aa  474  1e-132  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.216648  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4754  BCCT transporter  45.6 
 
 		 552 aa  440  9.999999999999999e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  37.27 
 
 		 505 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  37.27 
 
 		 505 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  37.27 
 
 		 505 aa  300  4e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  37.27 
 
 		 505 aa  300  4e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  37.27 
 
 		 505 aa  300  4e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  37.07 
 
 		 505 aa  299  7e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  37.07 
 
 		 505 aa  297  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0174  choline/carnitine/betaine transporter  37.72 
 
 		 541 aa  297  3e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.525828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  37.17 
 
 		 504 aa  296  8e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  37.3 
 
 		 504 aa  293  6e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4702  choline/carnitine/betaine transporter  36.73 
 
 		 583 aa  292  9e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.911193  decreased coverage  0.0031512 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  35.87 
 
 		 606 aa  290  4e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  35.86 
 
 		 504 aa  290  6e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  35.33 
 
 		 506 aa  289  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  36.42 
 
 		 505 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  35.37 
 
 		 545 aa  287  4e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  35.52 
 
 		 490 aa  286  5e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1765  choline/carnitine/betaine transporter  35.2 
 
 		 573 aa  286  8e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  32.42 
 
 		 600 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0044  choline/carnitine/betaine transporter  36.5 
 
 		 610 aa  284  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  36.18 
 
 		 497 aa  283  7.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1390  choline/carnitine/betaine transporter  34.14 
 
 		 582 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.211195 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  32.95 
 
 		 526 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  36.31 
 
 		 531 aa  281  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  37.45 
 
 		 498 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  37.23 
 
 		 546 aa  280  5e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  35.73 
 
 		 659 aa  280  5e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1356  choline/carnitine/betaine transport  34.63 
 
 		 582 aa  280  5e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379286  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1374  choline/carnitine/betaine transporter  34.63 
 
 		 582 aa  280  5e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796407  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  36.75 
 
 		 503 aa  280  6e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2609  choline/carnitine/betaine transporter  35.74 
 
 		 573 aa  279  8e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0501554  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  33.84 
 
 		 657 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  35.73 
 
 		 659 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  34.12 
 
 		 508 aa  279  1e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2914  choline/carnitine/betaine transporter  34.73 
 
 		 611 aa  277  4e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.34631  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2648  choline/carnitine/betaine transporter  35.05 
 
 		 534 aa  277  4e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  32.44 
 
 		 551 aa  276  5e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  38.58 
 
 		 531 aa  276  6e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2906  choline/carnitine/betaine transporter  34.44 
 
 		 577 aa  276  9e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  33.64 
 
 		 573 aa  276  9e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1809  choline/carnitine/betaine transporter  38.9 
 
 		 526 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  35.83 
 
 		 548 aa  273  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  34.65 
 
 		 637 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  35.83 
 
 		 548 aa  273  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000212445  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  34.74 
 
 		 530 aa  273  5.000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  33.07 
 
 		 520 aa  273  7e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  33.07 
 
 		 520 aa  273  7e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0654  choline/carnitine/betaine transport  35.99 
 
 		 544 aa  273  8.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1485  choline/carnitine/betaine transporter  33.4 
 
 		 580 aa  272  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00724238  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  33.27 
 
 		 538 aa  271  2.9999999999999997e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3532  choline/carnitine/betaine transporter  33.46 
 
 		 556 aa  270  4e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25390  choline/carnitine/betaine transport  35.92 
 
 		 514 aa  270  7e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.229483  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  34.13 
 
 		 567 aa  269  8e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  35.1 
 
 		 530 aa  268  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1384  choline/carnitine/betaine transporter  34.39 
 
 		 524 aa  266  5e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.095402  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  35.07 
 
 		 523 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  34.47 
 
 		 661 aa  266  8e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10935  glycine betaine transport integral membrane protein betP  34.31 
 
 		 593 aa  265  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00590  choline/carnitine/betaine transport  32.51 
 
 		 592 aa  265  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0767816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1121  choline/carnitine/betaine transporter  34.53 
 
 		 611 aa  265  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2119  betaine/carnitine/choline transporter family protein  33.61 
 
 		 524 aa  264  3e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2125  choline/carnitine/betaine transport  34.21 
 
 		 549 aa  263  4.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  33.33 
 
 		 516 aa  263  8e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  34.66 
 
 		 550 aa  263  8e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0066  choline/carnitine/betaine transporter  37.17 
 
 		 583 aa  263  8e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.432279  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  35.34 
 
 		 667 aa  262  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22610  choline/carnitine/betaine transport  33.46 
 
 		 663 aa  261  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.524203  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2105  choline/carnitine/betaine transporter  33.57 
 
 		 581 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  35.82 
 
 		 542 aa  261  3e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  33.78 
 
 		 532 aa  261  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02455  choline/carnitine/betaine transporter  34.5 
 
 		 582 aa  261  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6409  choline/carnitine/betaine transporter  31.12 
 
 		 585 aa  260  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  34.59 
 
 		 661 aa  260  4e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0969  choline/carnitine/betaine transporter  35.09 
 
 		 525 aa  259  6e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.375142  normal  0.0777887 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0421  choline/carnitine/betaine transporter  34.84 
 
 		 661 aa  259  8e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.45567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0757  choline/carnitine/betaine transport  37.44 
 
 		 525 aa  259  9e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26622  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3628  choline/carnitine/betaine transporter  33.57 
 
 		 581 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0835  choline/carnitine/betaine transporter  34.23 
 
 		 574 aa  259  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3716  choline/carnitine/betaine transporter  33.53 
 
 		 629 aa  259  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.903721  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2288  choline/carnitine/betaine transporter  33.09 
 
 		 582 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529795 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3129  choline/carnitine/betaine transporter  34.76 
 
 		 554 aa  258  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.32452  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2676  choline/carnitine/betaine transporter  33.02 
 
 		 582 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0154  choline/carnitine/betaine transporter  36.16 
 
 		 682 aa  257  3e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003606  High-affinity choline uptake protein BetT  32.88 
 
 		 553 aa  257  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  32.48 
 
 		 685 aa  257  3e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  33.13 
 
 		 516 aa  257  4e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000015754  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5310  choline/carnitine/betaine transporter  34.17 
 
 		 698 aa  257  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.910175  normal  0.618905 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4071  choline/carnitine/betaine transporter  33.52 
 
 		 650 aa  256  6e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2029  choline/carnitine/betaine transporter  31.26 
 
 		 558 aa  256  7e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  33.4 
 
 		 516 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  33.4 
 
 		 516 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000010169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  33.4 
 
 		 516 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  33.4 
 
 		 516 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>