More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1055 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013923  Nmag_3777  BCCT transporter  74.51 
 
 		 563 aa  811    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1055  BCCT transporter  100 
 
 		 565 aa  1107    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2934  BCCT transporter  72.49 
 
 		 545 aa  793    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4752  BCCT transporter  47.23 
 
 		 536 aa  467  9.999999999999999e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.337094  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4750  choline/carnitine/betaine transporter  45.94 
 
 		 542 aa  462  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.216648  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4708  choline/carnitine/betaine transporter  50.93 
 
 		 552 aa  456  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4754  BCCT transporter  43.99 
 
 		 552 aa  421  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2914  choline/carnitine/betaine transporter  34.95 
 
 		 611 aa  290  7e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.34631  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2648  choline/carnitine/betaine transporter  36.11 
 
 		 534 aa  290  7e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0044  choline/carnitine/betaine transporter  35.61 
 
 		 610 aa  288  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4702  choline/carnitine/betaine transporter  35.11 
 
 		 583 aa  283  8.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.911193  decreased coverage  0.0031512 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  36.65 
 
 		 506 aa  282  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  35.03 
 
 		 573 aa  279  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0174  choline/carnitine/betaine transporter  35.01 
 
 		 541 aa  279  1e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.525828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1809  choline/carnitine/betaine transporter  35.23 
 
 		 526 aa  276  8e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  37.68 
 
 		 503 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1765  choline/carnitine/betaine transporter  33.1 
 
 		 573 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  31.62 
 
 		 526 aa  275  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  35.25 
 
 		 505 aa  274  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  35.25 
 
 		 505 aa  274  3e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1356  choline/carnitine/betaine transport  34.8 
 
 		 582 aa  274  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379286  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1374  choline/carnitine/betaine transporter  34.8 
 
 		 582 aa  274  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796407  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1390  choline/carnitine/betaine transporter  34.8 
 
 		 582 aa  273  6e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.211195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  32.74 
 
 		 567 aa  273  7e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00590  choline/carnitine/betaine transport  32.71 
 
 		 592 aa  272  1e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0767816  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3628  choline/carnitine/betaine transporter  33.33 
 
 		 581 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2105  choline/carnitine/betaine transporter  33.33 
 
 		 581 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  35.25 
 
 		 505 aa  271  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2288  choline/carnitine/betaine transporter  33.87 
 
 		 582 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529795 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  35.05 
 
 		 505 aa  270  4e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  35.05 
 
 		 505 aa  270  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  35.05 
 
 		 505 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  34.85 
 
 		 505 aa  269  8e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  34.72 
 
 		 504 aa  268  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  35.86 
 
 		 546 aa  268  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  38.02 
 
 		 531 aa  267  4e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  33.33 
 
 		 494 aa  267  4e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3716  choline/carnitine/betaine transporter  32.83 
 
 		 629 aa  267  5e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.903721  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  34.85 
 
 		 504 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  33.99 
 
 		 505 aa  266  1e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6409  choline/carnitine/betaine transporter  32.1 
 
 		 585 aa  265  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2045  choline/carnitine/betaine transporter  33.7 
 
 		 554 aa  265  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0189191  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  36.4 
 
 		 498 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2609  choline/carnitine/betaine transporter  34.23 
 
 		 573 aa  263  8.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0501554  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  35.1 
 
 		 659 aa  262  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  31.79 
 
 		 538 aa  262  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3457  choline/carnitine/betaine transporter  35.61 
 
 		 694 aa  261  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25390  choline/carnitine/betaine transport  33.9 
 
 		 514 aa  261  2e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.229483  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  36.7 
 
 		 531 aa  261  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  34.87 
 
 		 548 aa  261  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000212445  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  31.55 
 
 		 520 aa  261  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  31.55 
 
 		 520 aa  261  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  34.87 
 
 		 548 aa  261  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10935  glycine betaine transport integral membrane protein betP  34.91 
 
 		 593 aa  260  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0049  choline/carnitine/betaine transporter  34.57 
 
 		 523 aa  260  6e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.335489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  34.9 
 
 		 659 aa  259  7e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  34.28 
 
 		 490 aa  259  7e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  33.73 
 
 		 504 aa  259  7e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1485  choline/carnitine/betaine transporter  31.8 
 
 		 580 aa  258  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00724238  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  33.64 
 
 		 606 aa  259  1e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  34.42 
 
 		 516 aa  258  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2676  choline/carnitine/betaine transporter  32.22 
 
 		 582 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  34.08 
 
 		 497 aa  258  2e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  34.27 
 
 		 516 aa  257  3e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000015754  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2261  choline/carnitine/betaine transporter  31.21 
 
 		 671 aa  257  4e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2119  betaine/carnitine/choline transporter family protein  35.27 
 
 		 524 aa  257  5e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  34.53 
 
 		 667 aa  256  5e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  32.46 
 
 		 657 aa  256  6e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0522  glycine betaine transporter  34.42 
 
 		 516 aa  256  6e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  34.42 
 
 		 516 aa  256  6e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  35.15 
 
 		 637 aa  256  6e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003545  choline-glycine betaine transporter  32.51 
 
 		 526 aa  256  7e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0898  BCCT family transporter  33.46 
 
 		 540 aa  256  7e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  35.37 
 
 		 532 aa  256  7e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0066  choline/carnitine/betaine transporter  34.57 
 
 		 583 aa  256  7e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.432279  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  34.42 
 
 		 516 aa  256  9e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000010169  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06429  hypothetical protein  33.46 
 
 		 535 aa  256  9e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0098  transporter, BCCT family  33.84 
 
 		 526 aa  256  9e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  34.42 
 
 		 516 aa  256  9e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  34.52 
 
 		 523 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  34.42 
 
 		 516 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0969  choline/carnitine/betaine transporter  34.5 
 
 		 525 aa  255  1.0000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.375142  normal  0.0777887 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  31.35 
 
 		 530 aa  254  3e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02380  choline/carnitine/betaine transport  34.19 
 
 		 664 aa  254  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.136626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0683  glycine betaine transporter  34.23 
 
 		 516 aa  254  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  32.2 
 
 		 508 aa  254  3e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4749  glycine betaine transporter  34.61 
 
 		 516 aa  254  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0790865 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2029  choline/carnitine/betaine transporter  32.57 
 
 		 558 aa  253  5.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0654  choline/carnitine/betaine transport  33.97 
 
 		 544 aa  252  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  32.01 
 
 		 600 aa  252  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0154  choline/carnitine/betaine transporter  33.65 
 
 		 682 aa  251  2e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01883  choline/carnitine/betaine transporter  32.89 
 
 		 529 aa  251  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  35.76 
 
 		 545 aa  251  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0237  choline/carnitine/betaine transporter  34.86 
 
 		 550 aa  252  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000527978  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0590  glycine betaine transporter  34.06 
 
 		 516 aa  251  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1909  choline/carnitine/betaine transport  35.34 
 
 		 660 aa  249  9e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.30039  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13010  choline/carnitine/betaine transport  35.53 
 
 		 603 aa  249  1e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.639384 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1121  choline/carnitine/betaine transporter  34.31 
 
 		 611 aa  249  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1610  hypothetical protein  34.1 
 
 		 646 aa  248  2e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00096761  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  32.09 
 
 		 551 aa  248  2e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>