More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2045 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2003  choline/carnitine/betaine transport family protein  62.12 
 
 		 535 aa  658    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0049  choline/carnitine/betaine transporter  62.74 
 
 		 523 aa  653    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.335489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01883  choline/carnitine/betaine transporter  63.2 
 
 		 529 aa  648    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1809  choline/carnitine/betaine transporter  62.33 
 
 		 526 aa  659    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0898  BCCT family transporter  60.34 
 
 		 540 aa  636    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0969  choline/carnitine/betaine transporter  62.31 
 
 		 525 aa  647    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.375142  normal  0.0777887 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2045  choline/carnitine/betaine transporter  100 
 
 		 554 aa  1099    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0189191  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4336  choline/carnitine/betaine transporter  62.67 
 
 		 529 aa  641    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0237  choline/carnitine/betaine transporter  60.96 
 
 		 550 aa  644    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000527978  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2323  glycine betaine transporter  61.73 
 
 		 525 aa  629  1e-179  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100678  hitchhiker  0.00817837 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0098  transporter, BCCT family  60.84 
 
 		 526 aa  630  1e-179  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0023  choline/carnitine/betaine transporter  59.29 
 
 		 539 aa  622  1e-177  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.16107 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0433  transporter, BCCT family  59.07 
 
 		 531 aa  608  1e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003545  choline-glycine betaine transporter  56.61 
 
 		 526 aa  602  1.0000000000000001e-171  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2648  choline/carnitine/betaine transporter  56.78 
 
 		 534 aa  597  1e-169  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06429  hypothetical protein  56.86 
 
 		 535 aa  597  1e-169  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003138  High-affinity choline uptake protein BetT  66 
 
 		 450 aa  589  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000429409  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0835  choline/carnitine/betaine transporter  52.97 
 
 		 574 aa  553  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003606  High-affinity choline uptake protein BetT  52.48 
 
 		 553 aa  550  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2125  choline/carnitine/betaine transport  54.51 
 
 		 549 aa  546  1e-154  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02455  choline/carnitine/betaine transporter  51.93 
 
 		 582 aa  543  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1282  transporter, BCCT family  51.17 
 
 		 534 aa  539  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0980  choline/carnitine/betaine transport  56.55 
 
 		 548 aa  536  1e-151  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3080  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  52.35 
 
 		 551 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3807  choline/carnitine/betaine transporter  52.35 
 
 		 551 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00825508  normal  0.301611 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3038  choline/carnitine/betaine transporter  52.55 
 
 		 554 aa  531  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3929  hypothetical protein  50 
 
 		 551 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.720842  normal  0.613133 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3129  choline/carnitine/betaine transporter  53.41 
 
 		 554 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.32452  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4552  choline/carnitine/betaine transporter  51.13 
 
 		 555 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2505  choline/carnitine/betaine transporter  50.74 
 
 		 541 aa  514  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  51.26 
 
 		 606 aa  489  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4548  choline/carnitine/betaine transporter  52.54 
 
 		 551 aa  489  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  46.21 
 
 		 545 aa  434  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1003  choline/carnitine/betaine transporter  43.1 
 
 		 553 aa  431  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.399191 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  43.36 
 
 		 656 aa  419  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  45.76 
 
 		 538 aa  419  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0066  choline/carnitine/betaine transporter  45.14 
 
 		 583 aa  417  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.432279  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  45.95 
 
 		 667 aa  413  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0600  choline/carnitine/betaine transporter  43.56 
 
 		 584 aa  415  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000857259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  44.51 
 
 		 659 aa  403  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  43.35 
 
 		 657 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  44.31 
 
 		 659 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  40.2 
 
 		 637 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1805  choline/carnitine/betaine transporter  42.03 
 
 		 664 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.376035  hitchhiker  0.00814736 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1055  choline/carnitine/betaine transporter  46.88 
 
 		 520 aa  390  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.144567  normal  0.0392371 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1909  choline/carnitine/betaine transport  41.6 
 
 		 660 aa  390  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.30039  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  42.62 
 
 		 661 aa  392  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  41.75 
 
 		 490 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3576  choline/carnitine/betaine transporter  42.41 
 
 		 567 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440158  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04148  secondary glycine betaine transporter BetU  43.53 
 
 		 667 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2741  choline/carnitine/betaine transporter  43.79 
 
 		 661 aa  388  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04111  hypothetical protein  43.53 
 
 		 667 aa  385  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1610  hypothetical protein  41.33 
 
 		 646 aa  389  1e-106  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00096761  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1362  choline/carnitine/betaine transport  43.85 
 
 		 673 aa  387  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000623924  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  42.04 
 
 		 685 aa  385  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1542  choline/carnitine/betaine transporter  43.61 
 
 		 658 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.869304  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  43.13 
 
 		 573 aa  384  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4850  BCCT family transporter  43.14 
 
 		 667 aa  383  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1576  choline/carnitine/betaine transporter  43.61 
 
 		 658 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.823699 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2804  choline/carnitine/betaine transporter  43.61 
 
 		 658 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0764  transporter, BCCT family  43.33 
 
 		 667 aa  384  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.846408  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2552  choline/carnitine/betaine transporter  43.61 
 
 		 658 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2719  choline/carnitine/betaine transporter  43.81 
 
 		 658 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  42.42 
 
 		 661 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1301  BCCT family betaine/choline/carnitine/glycine transporter  44.02 
 
 		 682 aa  380  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1505  choline/carnitine/betaine transporter  43.29 
 
 		 668 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2619  choline/carnitine/betaine transporter  43.61 
 
 		 658 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000908403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3164  choline/carnitine/betaine transporter  42.89 
 
 		 660 aa  382  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  44.29 
 
 		 497 aa  379  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  41.3 
 
 		 530 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1441  choline/carnitine/betaine transporter  43.2 
 
 		 658 aa  378  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  40.55 
 
 		 551 aa  375  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1546  choline/carnitine/betaine transporter  43.41 
 
 		 658 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0421  choline/carnitine/betaine transporter  43.43 
 
 		 661 aa  375  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.45567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  43.9 
 
 		 550 aa  372  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4430  choline/carnitine/betaine transporter  43.35 
 
 		 691 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13010  choline/carnitine/betaine transport  40.88 
 
 		 603 aa  372  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.639384 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5310  choline/carnitine/betaine transporter  43.61 
 
 		 698 aa  372  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.910175  normal  0.618905 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0174  choline/carnitine/betaine transporter  42.57 
 
 		 541 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.525828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  44.18 
 
 		 503 aa  372  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3360  choline/carnitine/betaine transporter  42.4 
 
 		 676 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0225578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4045  choline/carnitine/betaine transporter  41.95 
 
 		 673 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.57128 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1175  choline/carnitine/betaine transport  45.71 
 
 		 658 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0833615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0224  high-affinity choline transport protein  39.84 
 
 		 644 aa  369  1e-100  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1874  BCCT transporter  42.22 
 
 		 676 aa  369  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0838618  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1384  choline/carnitine/betaine transporter  43.55 
 
 		 524 aa  368  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.095402  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12990  choline transporter  40.28 
 
 		 653 aa  365  2e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.283179 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1109  choline/carnitine/betaine transporter  40.81 
 
 		 676 aa  363  4e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507446  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0154  choline/carnitine/betaine transporter  41.95 
 
 		 682 aa  363  5.0000000000000005e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4210  choline/carnitine/betaine transport  42.4 
 
 		 676 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157306  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4156  choline/carnitine/betaine transporter  42.4 
 
 		 676 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87836  normal  0.0109397 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  41.25 
 
 		 506 aa  360  3e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3532  choline/carnitine/betaine transporter  40.5 
 
 		 556 aa  360  4e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0240  choline/carnitine/betaine transporter  42.48 
 
 		 662 aa  360  5e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.167365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  42.83 
 
 		 498 aa  360  5e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1174  choline transporter  39.64 
 
 		 671 aa  360  5e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  41.68 
 
 		 505 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0971  choline/carnitine/betaine transporter  40.81 
 
 		 676 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.745252  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1077  choline/carnitine/betaine transport  44.22 
 
 		 682 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.892042  normal  0.109945 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1859  BCCT family transporter  40.81 
 
 		 676 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>