More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2261 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_02380  choline/carnitine/betaine transport  54.81 
 
 		 664 aa  678    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.136626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2261  choline/carnitine/betaine transporter  100 
 
 		 671 aa  1325    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22610  choline/carnitine/betaine transport  46.91 
 
 		 663 aa  534  1e-150  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.524203  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1904  choline/carnitine/betaine transporter  47.45 
 
 		 678 aa  525  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.674112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1765  choline/carnitine/betaine transporter  47.2 
 
 		 573 aa  501  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4702  choline/carnitine/betaine transporter  46.93 
 
 		 583 aa  497  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.911193  decreased coverage  0.0031512 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22280  choline/carnitine/betaine transport  45.84 
 
 		 639 aa  495  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1356  choline/carnitine/betaine transport  45.39 
 
 		 582 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379286  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1374  choline/carnitine/betaine transporter  45.39 
 
 		 582 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796407  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1390  choline/carnitine/betaine transporter  45.39 
 
 		 582 aa  492  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.211195 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2609  choline/carnitine/betaine transporter  45.91 
 
 		 573 aa  482  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0501554  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16530  choline/carnitine/betaine transport  45.86 
 
 		 651 aa  479  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0532776  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00860  choline/carnitine/betaine transport  45.87 
 
 		 662 aa  478  1e-133  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0044  choline/carnitine/betaine transporter  48.28 
 
 		 610 aa  470  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2914  choline/carnitine/betaine transporter  44.95 
 
 		 611 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.34631  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3716  choline/carnitine/betaine transporter  43.78 
 
 		 629 aa  448  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.903721  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1485  choline/carnitine/betaine transporter  44.91 
 
 		 580 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00724238  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3628  choline/carnitine/betaine transporter  44.04 
 
 		 581 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2288  choline/carnitine/betaine transporter  43.73 
 
 		 582 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529795 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2105  choline/carnitine/betaine transporter  44.04 
 
 		 581 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2676  choline/carnitine/betaine transporter  43.6 
 
 		 582 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3457  choline/carnitine/betaine transporter  43.72 
 
 		 694 aa  437  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00590  choline/carnitine/betaine transport  42.21 
 
 		 592 aa  437  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0767816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6409  choline/carnitine/betaine transporter  42.21 
 
 		 585 aa  432  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0292  BCCT transporter  49.38 
 
 		 513 aa  428  1e-118  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0419043 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0184  BCCT transporter  44.4 
 
 		 602 aa  409  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  43.87 
 
 		 531 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4142  choline/carnitine/betaine transporter  44.49 
 
 		 602 aa  396  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2906  choline/carnitine/betaine transporter  44.51 
 
 		 577 aa  389  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1132  choline/carnitine/betaine transporter  44.23 
 
 		 574 aa  377  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4898  choline/carnitine/betaine transporter  42.44 
 
 		 586 aa  376  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  43.37 
 
 		 531 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4749  glycine betaine transporter  37.76 
 
 		 516 aa  362  8e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0790865 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0757  choline/carnitine/betaine transport  45.85 
 
 		 525 aa  362  1e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26622  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  37.21 
 
 		 532 aa  360  6e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0522  glycine betaine transporter  37.19 
 
 		 516 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  37.19 
 
 		 516 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  39.84 
 
 		 600 aa  357  5e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  36.99 
 
 		 516 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  36.99 
 
 		 516 aa  355  1e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  36.99 
 
 		 516 aa  355  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000010169  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0590  glycine betaine transporter  36.99 
 
 		 516 aa  355  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0683  glycine betaine transporter  37.26 
 
 		 516 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  37.18 
 
 		 516 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000015754  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  35.91 
 
 		 516 aa  351  3e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  38.76 
 
 		 573 aa  349  1e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  36.28 
 
 		 546 aa  348  2e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2648  choline/carnitine/betaine transporter  40.27 
 
 		 534 aa  340  4e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1410  choline/carnitine/betaine transporter  36.65 
 
 		 548 aa  339  9e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000212445  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  36.65 
 
 		 548 aa  339  9e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  37.27 
 
 		 523 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  37.33 
 
 		 505 aa  334  3e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  37.52 
 
 		 505 aa  333  5e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  37.52 
 
 		 505 aa  333  5e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  37.52 
 
 		 505 aa  333  5e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  37.52 
 
 		 505 aa  333  5e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0022  choline/carnitine/betaine transporter  39.01 
 
 		 580 aa  332  1e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.499144 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  37.6 
 
 		 504 aa  331  2e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  37.6 
 
 		 504 aa  330  7e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0079  choline/carnitine/betaine transporter  39.33 
 
 		 558 aa  329  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  37.13 
 
 		 505 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  37.13 
 
 		 505 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  37.85 
 
 		 504 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  40.72 
 
 		 606 aa  327  3e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3341  choline/carnitine/betaine transporter  37.82 
 
 		 637 aa  327  6e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  35.39 
 
 		 520 aa  324  3e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  35.39 
 
 		 520 aa  324  3e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  34.98 
 
 		 503 aa  324  4e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  38.87 
 
 		 497 aa  323  7e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  36.45 
 
 		 505 aa  323  7e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  37.84 
 
 		 508 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  37.98 
 
 		 498 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1122  transporter, BCCT family protein  38.88 
 
 		 515 aa  320  3.9999999999999996e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  38.66 
 
 		 659 aa  320  6e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  38.22 
 
 		 659 aa  320  6e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06510  choline/carnitine/betaine transport  36.85 
 
 		 642 aa  314  2.9999999999999996e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4430  choline/carnitine/betaine transporter  37.8 
 
 		 691 aa  312  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  36.36 
 
 		 494 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3360  choline/carnitine/betaine transporter  38.57 
 
 		 676 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0225578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  36.81 
 
 		 506 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13010  choline/carnitine/betaine transport  36.14 
 
 		 603 aa  311  4e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.639384 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  37.2 
 
 		 545 aa  310  6.999999999999999e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  35.51 
 
 		 637 aa  310  8e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0727  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  37.43 
 
 		 681 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1874  BCCT transporter  38.57 
 
 		 676 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0838618  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0875  choline/carnitine/betaine transport  39.12 
 
 		 681 aa  308  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  36.36 
 
 		 530 aa  307  5.0000000000000004e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10935  glycine betaine transport integral membrane protein betP  39.07 
 
 		 593 aa  306  7e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2025  choline/carnitine/betaine transporter  39.29 
 
 		 533 aa  306  9.000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1109  choline/carnitine/betaine transporter  35.57 
 
 		 676 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507446  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3326  choline/carnitine/betaine transporter  41.24 
 
 		 525 aa  306  1.0000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188195  normal  0.774831 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  34.7 
 
 		 490 aa  305  1.0000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4045  choline/carnitine/betaine transporter  36.69 
 
 		 673 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.57128 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4819  choline/carnitine/betaine transporter  40.26 
 
 		 538 aa  303  8.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0648582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2029  choline/carnitine/betaine transporter  36.99 
 
 		 558 aa  302  1e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1301  BCCT family betaine/choline/carnitine/glycine transporter  41.41 
 
 		 682 aa  301  2e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5310  choline/carnitine/betaine transporter  37.53 
 
 		 698 aa  302  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.910175  normal  0.618905 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3745  choline/carnitine/betaine transporter  38 
 
 		 724 aa  301  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  37.48 
 
 		 657 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1121  choline/carnitine/betaine transporter  37.45 
 
 		 611 aa  300  5e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>